Arbeitsgruppe Monogenic - Sample Prioritization (Priorisierung von monogenetischen Proben)

Die Sample Prioritization Group ist eine der drei Arbeitsgruppen, die das Monogenic Network bilden. Ziel unserer Arbeitsgruppe ist es, für eine gerechte und demokratische Priorisierung der Proben für den Monogenic Hub zu sorgen.

Wir priorisieren Fälle, bei denen der starke Verdacht auf eine monogen bedingte Parkinson-Erkrankung besteht. Hierbei wird eine Vielzahl von Faktoren berücksichtigt, so etwa vorherige Gentests mit negativem Ergebnis, Anzahl der pro Familie verfügbaren betroffenen Proben, Verfügbarkeit von Proben beider nicht betroffener Elternteile, Alter beim Ausbruch der Parkinson-Krankheit und Blutsverwandtschaft. Zu diesem Zweck verwenden wir ein entsprechendes Punktesystem. Als Orientierungshilfe findet sichhier ein Link zur Tabelle für die Punktvergabe bei der Priorisierung.

Durch die Konzentration auf Proben mit höherer Wahrscheinlichkeit für eine monogene Ursache hoffen wir, die Chance auf die Entdeckung neuer Parkinson-Gene zu erhöhen. Wir hoffen auch, dass wir Proben aus der ganzen Welt erhalten und entsprechend Patient*innen aus unterrepräsentierten Populationen einbeziehen können.

Arbeitsgruppe
Christine Klein, MD, FEAN
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Christine Klein, MD, FEAN

Universität zu Lübeck | Deutschland
Soraya Bardien, PhD
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Soraya Bardien, PhD

Universität Stellenbosch | Südafrika
Kishore Raj Kumar, MBBS, PhD, FRACP
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Kishore Raj Kumar, MBBS, PhD, FRACP

University of Sydney | Australien
Julie Hunter, BSc
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Julie Hunter, BSc

ANZAC Research Institute | Australien
Eva-Juliane Vollstedt, Dr.
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Eva-Juliane Vollstedt, Dr.

Universität zu Lübeck | Deutschland
Meilensteine
Bisherige Fortschritte
  • Kontaktaufnahme mit 241 Forschungsteams aus 64 Ländern
  • Komplette GP2-Dokumentation ausgefüllt durch 32 Forschungszentren (25 % aus unterrepräsentierten Regionen)
  • Eingang von 2.170 externen Monogenic-Proben bei GP2
  • Versand von 910 Proben zur Genotypisierung und 628 zur WGS
  • Freigabe der sequenzierten Daten von 235 Proben für AMP® PD
  • Fusion des MJFF Global Genetic PD Project und des GP2 Monogenic Network: Kontaktaufnahme mit 89 GGPD-Zentren der MJFF im Hinblick auf den Beitritt zum GP2 Monogenic Network; potenzielle Verfügbarkeit von 9.124 Proben
  • Nun auch Aufnahme von Parkinson-Patient*innen und asymptomatischen Träger*innen mit pathogenen Varianten bei bekannten Parkinson-Genen in das GP2 Monogenic Network
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Verbleibende Ziele für das Jahr 3
  • Verarbeitung von 12.500 Proben, die von Mitwirkenden und potenziellen Mitwirkenden zugesagt wurden
  • Beschleunigung der administrativen und der Vertragsprozesse und zeitnaher Versand aller verfügbaren Proben
  • Beschleunigung des Prozesses durch gleichzeitige Einsendung von Proben zur Genotypisierung und WGS, ohne zuvor die Ergebnisse der Genotypisierung abzuwarten
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Kontakt

Wenn Sie mitwirken möchten oder Fragen haben, kontaktieren Sie uns gerne unter [email protected].