GP2-Lernplattform

  • Training is central to the GP2 effort, and throughout this project we will offer online training courses–listed below–on a range of topics related to Parkinson’s disease genetics. This platform is available to everyone. To join, please complete the form that follows.

    Already registered? Access the platform.

Indem Sie dieses Formular abschicken, erklären Sie sich damit einverstanden, E-Mails mit aktuellen Informationen von GP2 und ASAP zu erhalten. Kontaktieren Sie uns unter[email protected], wenn Sie Fragen zu den GP2-Ausbildungsmöglichkeiten haben.

Verfügbare Kurse

Im Folgenden finden Sie eine Aufstellung des aktuell auf unserer Lernplattform verfügbaren GP2-Kursangebots. Bitte füllen Sie obenstehendes Formular aus, um über die GP2-Lernplattform Zugang zu den Kursen zu erhalten. Schauen Sie regelmäßig auf dieser Seite vorbei, da wir unser Kurs- und Ausbildungsangebot fortlaufend aktualisieren.

  • Was ist Terra?
  • Verfügbare Ressourcen von AMP® PD und Terra
  • Einführung in Notebooks
  • Einführung in die Google Cloud Platform
  • Datenabfragen in einem Terra Notebook
  • Zugriff auf VCF und verbundene Dateien
  • Preise
  • Demo: Durchführung von Analysen in einem Terra Notebook
  • Überprüfung: Wissenstest: Einsatz von Terra für Datenzugriff & Durchführung von Analysen
  • Qualitätskontrolle der Genotypisierung 
  • Imputation 
  • Genom-weite Assoziationsstudien für binäre und qualitative Merkmale 
  • Polygene Risikoscores für die Parkinson-Krankheit 
  • Variantenpriorisierung mit Hilfe von Gesamt-Exom-/-Genom-Sequenzierung 
  • Anwendung von Netzwerkanalysen in der Translationalen Genetik
  • Nächste Schritte 
  • Einführung in die Genetik der Parkinson-Krankheit: Vergangenheit, Gegenwart und Zukunft
  • Grundlegende genetische Konzepte verstehen
  • Monogenetische Parkinson-Erkrankung: Familienstudien
  • Die Genetik der Parkinson-Krankheit in der Klinik:
  • Aktuelle Technologien zur Untersuchung der Genetik der Parkinson-Krankheit
  • Die Genetik der sporadischen Parkinson-Krankheit: Genomweite Assoziationsstudien und Risikoprognosen
  • Die Genetik der Progression und des Alters bei Krankheitsausbruch verstehen
  • Die Genetik des atypischen Parkinsonismus verstehen
  • Die Genetik unterrepräsentierter Populationen: Vorteile und Herausforderungen
  • Parkinson-Genetik in der Post-GWAS-Ära: Verwendung der Mendelschen Randomisierung zur Bestimmung der Kausalität
  • Die Genetik der Parkinson-Krankheit in der Post-GWAS-Ära: Feinkartierung, Kolokalisierung und Datenintegration
  • Die Genetik der Parkinson-Krankheit in der Arzneimittelentwicklung
  • Strukturelle genetische Variation bei der Parkinson-Krankheit
  • Abschluss
  • Grundlagen der Statistik
  • Interpretation von Statistiken und Hypothesentests
  • Studienaufbau:
  • Statistikauswertung
  • Systematische Überprüfung und Meta-Analyse
  • Einführung in Forschungsmethoden
  • Statistiken interpretieren lernen
  • Die Anwendung verschiedener Studiendesigns verstehen
  • Einführung und Terra-Demo
  • Einführung in aktuelle AMP- und GP2-Daten und Kostenmanagement
  • Hochladen, Abrufen und Überschreiben von Daten
  • Interaktion mit klinischen Daten
  • Beispiel 1: Polygener Risikoscore bei nichteuropäischen Populationen
  • Beispiel 2: Einzelgenanalysen
  • Einführung in Workflows und WDL
  • Genomweite Assoziationsstudien zum Verlauf der Parkinson-Krankheit
  • Erforschung der kumulativen Wirkung genetischer Variation auf die Parkinson-Krankheit
  • Auswertung von Kopienzahlvarianten und langen homozygoten Segmenten (Runs of Homozygosity – ROH) aus Genotypisierungsdaten
  • Post-genomweite Assoziationsstudien zum Risiko der Parkinson-Krankheit I
  • Post-genomweite Assoziationsstudien zum Risiko der Parkinson-Krankheit II

  • Eine Einführung in das Programmieren in Python

  • Syntax und Semantik in Python verstehen

  • Daten und operative Strukturen: Bedingungen und Schleifen

  • Funktionen, Arbeiten mit Strings reguläre Ausdrücke

  • Pakete und Module

  • Datenvisualisierung, Fehler und Ausnahmen

  • Python-Anwendungen im Bereich biomedizinische Daten

  • DNA-Extraktion und -Quantifizierung

  • DNA-Qualität: Aufreinigung, Femto-Impulse und Tapestation

  • Bibliotheksvorbereitung und Sequenzierung für Oxford Nanopore

  • Bewährte Praktiken für die Erfassung und Speicherung klinischer GP2-Daten mit REDCap

Klinische Gentests bei Parkinson-Erkrankung: Warum, wann und wie?

AMP-PD-Videoreihe

Genetik komplexer Merkmale

 

Haben Sie allgemeine Fragen zu GP2 oder einem der oben aufgeführten Kurse? Wenden Sie sich gerne an den/die Trainee-Beauftragte*n in Ihrer Region.