Plateforme d'apprentissage du GP2

  • Training is central to the GP2 effort, and throughout this project we will offer online training courses–listed below–on a range of topics related to Parkinson’s disease genetics. This platform is available to everyone. To join, please complete the form that follows.

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Formations disponibles

Vous trouverez ci-dessous un résumé de la gamme actuelle des formations du GP2 (accessibles sur la plateforme d’apprentissage). Veuillez remplir le formulaire ci-dessus pour accéder aux formations proposées sur la plateforme d’apprentissage du GP2. Veuillez consulter cette liste car elle est régulièrement mise à jour avec de nouvelles formations.

  • Présentation de Terra
  • Ressources disponibles auprès de AMP® PD et Terra
  • Présentation des bloc-notes
  • Présentation de la plateforme Google Cloud
  • Interroger des données dans un bloc-notes Terra
  • Accéder aux fichiers VCF et fichiers connexes
  • Tarification
  • Démonstration : Analyse des données dans un bloc-notes Terra
  • Evaluation : Contrôle des connaissances : Utilisation de Terra pour accéder aux données et effectuer des analyses
  • Contrôle de qualité du génotypage  
  • Imputation 
  • Études d’association pangénomique pour les traits binaires et qualitatifs 
  • Grilles des risques plurigénétiques dans la maladie de Parkinson  
  • Priorisation des variants via le séquençage du génome/de l’exome entier  
  • Application des analyses en réseau pour la recherche génétique translationnelle
  • Étapes suivantes 
  • Introduction à la génétique de la maladie de Parkinson – passé, présent, futur
  • Comprendre les fondamentaux de la génétique
  • La maladie de Parkinson monogénique – études familiales
  • La génétique parkinsonienne en médecine clinique
  • Technologies actuelles utilisées pour étudier la génétique de la maladie de Parkinson
  • La génétique de la forme sporadique de la maladie de Parkinson : les études d’association pangénomique et les prédictions de risque
  • Comprendre d’emblée la génétique de l’évolution et de l’âge
  • La génétique de la forme atypique de la maladie de Parkinson
  • La génétique des populations sous-représentées : avantages et défis
  • Génétique de la maladie de Parkinson à l’ère post-GWAS (études d’association pangénomique) : la randomisation mendélienne pour comprendre les liens de causalité
  • La génétique de la maladie de Parkinson à l’ère post-GWAS (études d’association pangénomique) : cartographie fine, colocalisation et intégration des données
  • La génétique parkinsonienne dans le développement de médicaments
  • Variation génétique structurelle de la maladie de Parkinson
  • Conclusion
  • Notions de base des statistiques
  • Interprétation des statistiques et mise à l’épreuve des hypothèses
  • Conception de l’étude
  • Analyse statistique
  • Examen systématique et méta-analyse
  • Introduction aux méthodes de recherche
  • Apprentissage de l’interprétation des statistiques
  • Maîtrise de l’application de différentes conceptions d’étude
  • Introduction et démonstration de Terra
  • Introduction aux données actuelles de l’AMP et du GP2 et à la gestion des coûts
  • Téléchargement, accès et copie des données
  • Manipulation des données cliniques
  • Exemple 1 : Grilles des risques plurigénétiques chez les populations non-européennes
  • Exemple 2 : Analyses d’un seul gène
  • Introduction aux flux de travail et à WDL
  • Etudes d’association pangénomique (GWAS) sur l’évolution de la maladie de Parkinson
  • Étude de l’effet cumulatif de la variation génétique sur la maladie de Parkinson
  • Etude de la variation du nombre de copies et des séries d’homozygotie à partir des données de génotypage
  • Etudes d’association post-pangénomique sur les risques associés à la maladie de Parkinson 1
  • Etudes d’association post-pangénomique sur les risques associés à la maladie de Parkinson II

  • Introduction à la programmation sur Python

  • Comprendre la syntaxe et la sémantique de Python

  • Structures des données et des opérations : déclarations conditionnelles et boucles

  • Fonctions, manipulation des chaînes et expressions communes

  • Paquets et modules

  • Affichage des données, erreurs et exceptions

  • Applications de Python aux données biomédicales

  • Extraction ADN et quantification

  • Qualité ADN : purification, systèmes Femto Pulse et TapeStation

  • Préparation bibliothèque et séquençage à longue lecture ONT (Oxford Nanopore Technologies)

  • Meilleures pratiques des recueils de données cliniques GP2 et stockage utilisant le REDCap.

Dépistage génétique clinique pour la maladie de Parkinson : Pourquoi, quand et comment ?

Série de clips vidéo sur l’AMP-PD

Génétique des traits complexes

 

Avez-vous des questions d’ordre général sur le GP2 ou les formations proposées ci-dessous ? Contactez leschargés de formation de votre région.