家系分析工作组
在单基因网络框架下,新成立的这一工作组重点开展基于家系的遗传学分析,旨在发现新的帕金森病致病基因。
About the 家系分析工作组
家系遗传分析工作组由 Joanne Trinh 与 Niccolò Mencacci 共同牵头,依托多代帕金森病(PD)家系的家系图谱,识别与疾病在家系内共分离的罕见变异,从而补充基于人群的遗传学研究。
为何采用基于家系的遗传学分析?
家系研究在识别单基因致病机制方面具有显著优势,能够弥补散发病例-对照研究设计的不足。由于受累亲属之间共享较高比例的遗传背景,罕见变异信号在家系中更易被放大。常用方法包括连锁分析、三联体或家系的全基因组测序、共分离分析以及超罕见变异的负荷分析。在早发型或家族性帕金森病(PD)队列中,尤其是在经过表型富集的家系中,致病基因的检出率可高达约15%
里程碑事件
已完成
- 对57个家系开展了共分离分析,重点评估编码区变异的家系内遗传模式。
- 已对100名先证者实施长读长全基因组测序(WGS)。
活跃
- 已建立基于家系的全基因组测序(WGS)分析工作流程,重点研究尚未明确遗传病因的早发型及家族性帕金森病(PD)病例。
- 在家系中开展罕见变异关联分析与共分离检验(涵盖编码区及非编码区变异),以精准定位高外显率的单基因致病因素。
- 对有潜力的候选变异进行实验室内部验证及进一步的共分离分析。
- 通过 GP2 内部的伙伴机制扩大具有帕金森病(PD)家族史的家系规模。
- 对具有阳性家族史的家系开展长读长全基因组测序(WGS),用于检测复杂重复序列。
- 开展基于家系的罕见变异关联分析。
- 对共分离分析所得候选变异开展病例对照分析。
