GP2与AMP PD：推进帕金森病研究的平台合作伙伴

全球帕金森基因计划（GP2）与帕金森病加速药物合作伙伴关系：(AMP PD)建立了合作，为您提供一站式帕金森病遗传数据（GP2）和基因组数据（AMP PD），可加快您发现创新型药物靶点和生物标记物的速度，加速新的帕金森药物开发。我们正在添加基于云的协作计算来连接这两个庞大的数据库。

我们使用Terra 作为数据分析、数据存储和研究员身份验证的主干系统，为存储在云中的大量数据提供了一个安全且简单的访问点。Terra将计算工作提升到一个新的水平，协作工作区包含云原生笔记本和工作流。基于云的计算意味着您可以在更安全的地方分析数据，而无需进行耗时且昂贵的数据传输。Terra使用直观的Jupyter笔记本结构，能够进行清晰的交互式分析，您还可以随您的结果一起发布您的工作区，以确保实现可重复和透明的研究。未来还计划实现与其他神经退行性疾病工作区和平台的互操作，以实现数据价值的最大化。

为什么要把这两个项目放在一起？因为二者有很好的互补性。如果您想深入研究经协调的具有不同多组学读数（包括RNAseq和基因组序列）的一万个样本，那么AMP PD是您的不二选择。如您希望在生物样本库规模探索不同人群的基因关联，那么请选择GP2。GP2和AMP PD都包括大多数参与者的相关精选纵向临床数据。总的来说，我们将GP2作为大规模分析的发现式数据集使用（生成假设），然后可能再在AMP PD统一的队列里进一步完善和密切探索这些发现。

最棒的一点在于，两个数据集可以使用同一个登录点和同一套文件，单一架构上储存大量可用的文件，可缩短学习曲线。GP2和AMP PD数据案例的使用如下图所示。

本篇博文由以下GP2和AMP PD成员撰写：

Mike A. Nalls, PhD
Data Tecnica公司|美国
在医疗和其它科学领域的大数据集分析和方法研究方面工作十多年后，Mike于2017年初创立了Data Tecnica公司。他在大数据集、脑部疾病和基因组学的应用统计学领域发表了350多篇经过同行审议的文章（40岁之前）。他是开放科学、合作和科学透明的坚定倡导者。

Hampton Leonard, MS
Data Tecnica公司/ 美国国立卫生研究院|美国
Hampton拥有数据科学和机器学习的背景，并将其应用于神经退行性疾病领域的大型多组学数据集。她热衷于研究临床和组学水平的差异，以及这些差异如何影响临床试验结果。

Matt Bookman
Verily生命科学公司|美国
Matt是Verily公司Terra团队的解决方案架构师。他担任AMP PD数据工作组联席组长，与协作科学家一起处理基因组和转录组数据，并将其提供给符合条件的Terra研究员。Matt在加州大学洛杉矶分校（UCLA）获得应用数学学士学位，在斯坦福大学获得计算机科学和计算生物学硕士学位。

Eline Appelmans
国立卫生研究院基金会|美国
作为神经科学研究合作伙伴关系的主管，Appelmans 博士与美国国立卫生研究院（NIH）、非营利组织、行业领袖和国立卫生研究院基金会（FNIH）项目负责人一起协调团队实施针对阿尔茨海默病的药物加速合作伙伴关系（AMP）即AMP-AD、帕金森病AMP即AMP-PD、精神分裂症AMP即AMP-SCZ、阿尔茨海默病神经影像学倡议计划三-私人合作伙伴科学委员会 (ADNI3 PPSB)、生物标记物联盟神经科学指导委员会(BC NSC)以及其它正在制定的项目。