البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 والشراكة من أجل تسريع تطوير أدوية داء باركنسون AMP PD. شركاء المنصة من أجل تحقيق تقدم في أبحاث داء باركنسون

⁧⁩البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 والشراكة من أجل تسريع إنتاج الأدوية: داء باركنسون(⁧⁩⁧⁩⁧⁩AMP PD⁧⁩⁧⁩⁧⁩) قد طوروا شراكة كي يكونوا محطة موحدة للبيانات الجينية (GP2) والجينومية (AMP PD) والتي من شأنها أن تسرع اكتشاف أهداف جديدة للعقاقير والمؤشرات الحيوية لتسريع إنتاج جيل جديد من الأدوية لداء باركنسون. سوف نضيف الحوسبة السحابية التعاونية للربط بين قواعد البيانات الضخمة هذه.⁧

⁩ ⁧⁩سوف نوفر محطة موحدة سهلة وآمنة تجمع كمية هائلة من البينات المخزنة على السحابة، باستخدام ⁧⁩⁧⁩⁧⁩Terra⁧⁩⁧⁩⁧⁩كأساس لتحليل البيانات، وتخزينها، والتحقق من الباحثين. تحمل Terra عمليات الحوسبة إلى مستوى متقدم، بوجود مساحات عمل تعاونية تحتوي على دفاتر ملاحظات ومسارات عمل سحابية. الحوسبة السحابية تعني بأنكم تستطيعون تحليل البيانات في مكان آمن دون الحاجة لنقل البيانات الذي قد يكون مكلفاً ويستغرق وقتاً طويلاً. إن استخدام terra لهيكلية دفتر ملاحظات Jupyter يسمح بتحليل واضح وتفاعلي، ويمكن لكم أيضاً نشر مساحات العمل الخاصة بكم مع نتائج عملكم لضمان شفافية الأبحاث وإمكانية إعادة إنتاجها. تشمل الخطط المستقبلية تطوير القدرة على إجراء العمليات المشتركة في مساحات عمل ومنصات أمراض عصبية استحالية أخرى من أجل تعظيم قيمة البيانات.⁧

⁩ ⁧⁩لماذا وضعنا هذين البرنامجين في مكان واحد؟ لأنهما يكملان بعضهما البعض بشكل جميل. إذا أردتم أن تغوصوا في عشرة آلاف عينة تحتوي على قراءات متعددة الأوميك بما يشمل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (الرنا) وتسلسل الجينوم، حينها تكون مجموعة بيانات برنامج الشراكة من أجل تسريع تطوير أدوية داء باركنسون هي خياركم الأفضل. إذا رغبتم باستكشاف الارتباطات الجينية في مجموعات سكانية متنوعة على نطاق البنك الحيوي، توجهوا إلى البرنامج العالمي GP2. ويشمل البرنامج العالمي GP2 وبرنامج الشراكة من أجل تسريع تطوير أدوية داء باركنسون AMP PD بيانات سريرية مختارة ذات صلة حول أغلب المشاركين. بشكل عام، نستخدم البرنامج العالمي GP2 كمجموعة بيانات استكشافية من أجل التحاليل على نطاق هائل (لتوليد النظريات)، ومن ثم بالإمكان التدقيق والبحث عن قرب في هذه الاكتشافات في المجموعات البحثية الموحدة لبرنامج الشراكة من أجل تسريع تطوير أدوية داء باركنسون.⁧⁩

⁧⁩أفضل ما في هذا الموضوع هو أن نقطة الولوج والنماذج الورقية تسمح بالدخول إلى مجموعتي البيانات باستخدام هيكلية واحدة والتوثيق المكثف المتاح لتخفيض منحنى التعلّم. قمنا بتطوير هذه اللمحة العامة المصورة لتوضيح استخدام الحالات لبيانات البرنامج العالمي GP2 وبرنامج الشراكة من أجل تسريع تطوير أدوية داء باركنسون AMP PD.⁧⁩ ⁧
⁩⁧⁩

  ⁧⁩قام بكتابة هذه المدونة أعضاء البرنامج العالمي GP2 وبرنامج الشراكة من أجل تسريع تطوير أدوية داء باركنسون AMP PD التالية أسماؤهم:⁧

⁩⁧⁩⁧⁩مايك أ. نالز، حاصل على شهادة الدكتوراة⁧⁩⁧⁩⁧⁩⁧⁩شر
كة داتا تكنيكا الدولية، الولايات المتحدة
الأمريكية⁧⁩⁧⁩⁧⁩⁧⁩أسَّس مايك شركة داتا تكنيكا في بداية عام 2017، وذلك بعد عملٍ استمر لأكثر من عقد من الزمن في مجالي تحليل مجموعات البيانات الكبرى وأساليب البحث في الرعاية الصحية وغيرهما من المجالات العلمية. وقد نشر ما يزيد عن 350 دراسة خاضعة لمراجعة الأقران (قبل بلوغه سن الأربعين) في مجال الإحصاءات التطبيقية في مجموعات البيانات الكبرى، وأمراض الدماغ وعلم المجين. ويناصر مايك بقوة العلم المفتوح، والتشاركية والشفافية في العلم.⁧

⁩⁧⁩ ⁧⁩⁧⁩هامبتون لينارد، ماجستير في العلوم⁧⁩⁧
⁩⁧⁩⁧⁩شركة داتا تكنيكا، المعاهد الوطنية للصحة، الولايات المتحدة
الأمريكية⁧⁩⁧⁩⁧⁩⁧⁩ تتمتع هامبتون بخبرة في مجالي علم البيانات والتعلم الآلي، حيث توظف هذه الخبرة في تعاملها مع مجموعات بيانات أوميكية متعددة وكبيرة في مجال الأمراض العصبية الاستحالية. لديها شغف باستكشاف الفروقات على المستويات الأوميكية والسريرية وكيف يمكن أن تؤثر هذه الفروقات على مخرجات التجارب السريرية.⁧⁩⁧⁩

⁧⁩⁧⁩مات بوكمان⁧⁩⁧⁩⁧⁩⁧⁩
Verily Life Sciences | USA⁧
⁩⁧⁩⁧⁩⁧⁩مات هو مهندس حلول في فريق Terra في Verily. كرئيس مشارك لمجموعة العمل حول البيانات في برنامج تسريع تطوير الأدوية لداء باركنسون، عمل بوكمان مع العلماء المشاركين لمعالجة البيانات الجينومية والترنسكريبتومية وجعلها متاحة للباحثين المؤهلين في Terra. حصل مات على بكالوريوس في الرياضيات التطبيقية في جامعة كاليفورنيا في لوس انجلوس وماجستير في علوم الحاسوب وعلم الأحياء الحسابي من جامعة ستانفورد.⁧⁩⁧⁩

⁧⁩⁧⁩إلين أبيلمانس
⁧⁩⁧⁩⁧⁩⁧⁩مؤسسة المعاهد الوطنية للصحة | الولايات المتحدة ا
لأمريكية⁧⁩⁧⁩⁧⁩⁧⁩كمديرة للشراكات البحثية في علم الجهاز العصبي، تعمل د. أبيلمانس بالتنسيق مع المعاهد الوطنية للصحة، والمؤسسات غير الربحية، والقياديين في هذا القطاع، وقيادات مشاريع مؤسسة المعاهد الوطنية للصحة على تطبيق الفرق لشراكة تسريع تطوير الأدوية لمرض ألزهايمر وشراكة تسريع تطوير الأدوية لداء باركنسون، وشراكة تسريع تطوير الأدوية لمرض الفصام، والمجلس العلمي للشركاء من القطاع الخاص في المبادرة 3 للتصوير العصبي لمرض ألزهايمر، وغيرها من المشاريع قيد التطوير.⁧⁩⁧⁩