オープンサイエンスが扉を開く
ブログフィードに戻る

オープンサイエンスが扉を開く

By Bradford Casey | |
Author(s)
  • Bradford Casey, PhD

    Michael J. Fox Foundation | USA

    博士は財団のゲノミクス、計算生物学、およびデータサイエンスの研究ポートフォリオを主導し、他の財団の科学者と協力して財団の研究戦略を開発しています。研究者、臨床リーダー、業界パートナーと協力して、新しいリソースを開発し、新しいテクノロジーを適用し、MJFFの研�... Read More

  • オープンサイエンスはすべての利害関係者の価値を明らかにします
  • オープンサイエンスはリソース投資に対して最大利益をもたらします
  • オープンサイエンスは大きな発見を促進します

科学研究の基本的な使命は、未知のものを知ることです。歴史的に、研究は主に特定の質問を綿密に研究するために、単独または小さなチームで働く科学者によって行われてきました。この従来モデルは非常に普及しているため、漫画にも顕微鏡をじっと見つめる人間として描かれます。このモデルは、科学について考える人の数を示しています。質問を提案し、綿密に調査し、その後発見を有します。すべての刺激を無視し全体のほんの一部のみに焦点を合わせた一人の視点、この顕微鏡の例えこそが、問題なのです。

もちろん科学的発見には綿密な研究が大切ですが、1度に1つの領域にのみ焦点を当てた1つのラボがリソースのボトルネックになっています。頻繁にデータとツールへのアクセスが制限されると、発見が遅くなり、研究費用がかさみ、非効率的な重複につながります。データ収集から結論を導き出し、公開するまでに何年もかかる可能性があり、研究者と患者のコストがかさみ、わずかに異なるプロジェクトによって存在感を消されてしまいます。 このようなモデルの問題は明らかです。データ生成は、多くの場合、協調的ではなく競争的になり、発見への障害となります。データセットの生成とキュレーションの課題は、実行される科学研究の障壁となり、そのプロセスで個々の研究者の貢献度が小さくなる可能性があります。このような閉鎖的プロセスでは、常にデータセットのフラクチャとサイロ化につながり、生成にコストがかかり、分析と比較が困難になります。さらに、分離されたデータセットを効果的に比較できない場合もあり、重要な発見が見落とされる可能性があります。

このモデルの代替案は、「オープンサイエンス」と呼ばれます。 1つの方法は、共有の研究データプラットフォームを構築し、多くの科学者が同時にそれに取り組む方法を開発することです。ENCODEプロジェクト、GTExなどの研究コンソーシアムは、共同データ生成の価値を実証しており、研究に大きなインパクトを与えています。さまざまな関心と専門知識を持つ研究者は、ニーズに基づいてデータを独立、または共同で使用します。リソース生成の観点から、このモデルでは同じリソース(資金、時間、労力)で、より大きく、より価値のあるデータセットを作成できます。

研究計画、初期の結果、課題などを共有することで、プロジェクトにおける個人の貢献度も高まり、研究者は重要な質問を特定し、対処することができます。これは、オープンサイエンスモデルの下で機会を見つけアクセスする若手研究者と研修生にとって特に重要です。このモデルはまた、プロセスの中で自らの努力が認められるという意識で研究に従事できるため、公平なコラボレーションを促進します。進行中の研究の共有に焦点を当て、作業をサポートする共有ツールとリソースを開発する際のベストプラクティスが促進され、既存データを活用する能力を備えた研究者の数が増えます。GP2は参加する多くのコホートの公平な利益の確保に取り組み、オープンサイエンスへの参画を通して、研究と研究者にリソースと機会提供のサポートをすることを保証します。

[1] ENCODEプロジェクトコンソーシアム。ヒトゲノムDNA要素の統合百科事典Nature.2012;489(7414):57-74. doi:10.1038/nature11247

[2] http://www.gtexportal.org