Versión de junio de 2023

A grandes rasgos, el Global Parkinson’s Genetics Program (GP2) se rige por una política de «evitar sorpresas», en virtud de la cual análisis, proyectos y manuscritos se coordinan y comunican de manera abierta y transparente. Es la voluntad del GP2 que los datos se usen de la manera más generalizada y abierta posible.

• Para los manuscritos dirigidos por el consorcio (como GWAS de grandes dimensiones), todos los investigadores colaboradores se incluirán como autores, y deberá compartirse el manuscrito con toda la red del GP2 dos semanas antes de su envío para publicación.
• Para miembros del GP2 que hacen subanálisis con datos del GP2 (como estudios de un gen/locus específico), solo se incluirán como autores en la lista de autores los investigadores que hayan colaborado con el proyecto. Sin embargo, el GP2 deberá incluirse en la lista de autores y, por consiguiente, los investigadores del GP2 serán considerados como autores complementarios y aparecerán en las búsquedas en PubMed. El manuscrito deberá compartirse con toda la red del GP2 dos semanas antes de su envío para publicación.
• Para manuscritos externos dirigidos por no miembros del GP2 (es decir, análisis de usuarios externos o subanálisis de resúmenes estadísticos), solicitamos que cite el GP2 en la sección de agradecimientos y que cite los conjuntos de datos del GP2 en su declaración de disponibilidad de datos haciendo referencia a la base de datos AMP PD y especificando la versión del conjunto de datos consultado. También le rogamos que, tras su publicación, nos envíe su manuscrito a [email protected]. ¡Nos encantaría que lo compartiera con nosotros! Para todos los manuscritos dirigidos por miembros del GP2, si emplean datos del GP2, es obligatorio preimprimir las cargas (como bioRxiv) en el momento de la presentación del manuscrito a una revista para su revisión, publicar el trabajo con acceso libre y compartir el código. Recomendamos encarecidamente que los manuscritos externos que usen datos del GP2 hagan lo propio.

Introducción

El Global Parkinson’s Genetics Program (GP2) es un programa internacional que tiene por objeto generar conocimientos reveladores sobre la base genética de la enfermedad de Parkinson (EP) y democratizar el acceso a resultados y datos. El GP2 está financiado por la iniciativa Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP, https://gp2.org/), y la promoción de la colaboración, la generación de recursos y la democratización de los datos es parte de sus objetivos estratégicos. La difusión de los datos del GP2 es una de las metas principales del GP2, y ASAP fomenta la publicación de resultados rápida, accesible y a gran escala.

Resumen

El objetivo de esta política es garantizar que

• Los datos y resultados del GP2 se difundan de manera integral, precisa y con celeridad.
• Se reconozca a los miembros del estudio del GP2 por su trabajo en el diseño del estudio, la adquisición y el análisis de datos y la recogida de muestras biológicas.
• Se pueda llevar un registro de las publicaciones del GP2 para elaborar una lista completa de los hallazgos derivados de las iniciativas del GP2.
• Los resultados de los análisis de datos del GP2 sean accesibles y estén disponibles al público gratuitamente cuando sea posible.

Acceso libre

Las publicaciones firmadas por el Comité Directivo del GP2, los grupos de trabajo y otros beneficiarios de subvenciones del GP2 deberán adherirse a las políticas de acceso libre de ASAP y The Michael J. Fox Foundation (MJFF), que pueden consultarse aquí y en www.michaeljfox.org/openaccesspolicy, respectivamente. Esto significa que todas las publicaciones firmadas por el GP2 tendrán: 

1. Acceso inmediato y gratuito en línea tras la publicación, los beneficiarios conservarán los derechos de autor en virtud de una licencia CC BY 4.0 (o equivalente), que permite la reutilización de la publicación sin restricciones.
2. Los manuscritos se publican en un repositorio de prepublicaciones de acceso libre tras su envío a una revista para su revisión (o antes).
3. Todos los resultados de la investigación (datos, protocolos, código) deben depositarse en repositorios de acceso público y citarse en la publicación.
4. Atribuciones adecuadas de los trabajos financiados por el GP2.

Para promover el libre intercambio de resultados, se ruega a los usuarios externos de datos del GP2 que no reciban fondos del GP2 que también se adhieran a las políticas de acceso libre de ASAP y MJFF.

Compartir resultados y código

De acuerdo con las políticas de acceso libre de ASAP y la MJFF, el Comité Directivo del GP2, sus grupos de trabajo y todos los beneficiarios financiados por el GP2 deben asegurarse de que los resultados y el código tanto extraídos como desarrollados a partir de análisis con datos del GP2 se compartan públicamente y sean fácilmente accesibles en línea a través de repositorios públicos, confiables y aceptados por la comunidad.

El GP2 depositará datos en plataformas como Accelerating Medicines Partnership: Parkinson’s Disease (AMP® PD) y https://www.ebi.ac.uk/gwas/. El GP2 compartirá protocolos en plataformas como https://www.protocols.io/ y compartirá código en plataformas como https://github.com lo antes posible (siempre que sea viable). Esta política se aplicará a estadísticas, metadatos, documentación y casos de uso computacionales, según proceda. Para obtener más información sobre las directrices para compartir código, le invitamos a consultar la Política de buenas prácticas y estandarización del código del GP2. Tenga en cuenta que para publicar un artículo, el código deberá registrarse con un identificador permanente que capture el código en el momento de la entrega del artículo a través de Zenodo. Para promover el libre intercambio de resultados y códigos, instamos a los usuarios externos de datos del GP2 que no reciban fondos del GP2 a compartir también sus resultados y código en plataformas de datos en línea de acceso público.

Revisión administrativa

Todos los manuscritos, preimpresiones y resúmenes/pósteres que usen datos del GP2 deberán someterse a una revisión administrativa por parte del GP2 antes de ser enviados como propuesta a una revista, base de datos pública o conferencia. El GP2 responderá a todas las propuestas recibidas en un plazo máximo de dos semanas. Tenga que en cuenta que deberá haber prepublicado el artículo en el momento de presentarlo a una revista (o antes). Para enviar un manuscrito o resumen/póster al Comité Directivo del GP2, escriba a [email protected].

Reconocimientos

Todos los manuscritos, prepublicaciones y resúmenes/pósteres derivados del uso de datos o código del GP2 deben citar a ASAP y al GP2 con la formulación siguiente:

«[Los datos y/o código] utilizados en la preparación de este artículo pertenecen al Global Parkinson’s Genetics Program (GP2). El GP2 es un programa financiado por la iniciativa Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP) e implementado por la Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s Research (https://gp2.org). Para consultar una lista completa de los miembros del GP2, visite https://gp2.org.»

Todos los manuscritos, prepublicaciones y resúmenes/pósteres que hayan contado con el apoyo del GP2, pero que no se deriven explícitamente del uso de datos del GP2 deben citar a ASAP y al GP2 con la formulación siguiente:

«Este proyecto ha contado con el apoyo del Global Parkinson’s Genetics Program (GP2). El GP2 es un programa financiado por la iniciativa Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP) e implementado por la Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s Research (https://gp2.org). Para consultar una lista completa de los miembros del GP2, visite https://gp2.org.»

Autoría

Los investigadores pueden usar datos del GP2 para cualquier proyecto/análisis de su interés siempre que se cumpla con el acuerdo de uso de datos del GP2. Las publicaciones del GP2 pueden ser de tres tipos:

Artículos dirigidos por el consorcio, enfocados en el GP2

1) En artículos firmados por el Comité Directivo o los grupos de trabajo o de proyecto del GP2 y enfocados principalmente en los conjuntos de datos colaborativos del GP2, todos los miembros del GP2 constarán como coautores y el nombre del consorcio (Global Parkinson’s Genetics Program [GP2]) se incluirá después de los autores principales (siguiendo las convenciones de la revista). Todos los autores mencionados tendrán la oportunidad de ver, hacer comentarios y expresar su acuerdo con el contenido del artículo antes de su entrega para publicación. Los autores pueden pedir que no se les incluya en la lista de autores. Si, tras pedirles que aporten sus comentarios sobre el manuscrito o que proporcionen información solicitada por la revista, un coautor no responde en un plazo de dos semanas, dicho coautor no se incluirá en la línea de autores, pero se mencionará en la sección de agradecimientos.

Artículos que incorporan datos del GP2 de modo secundario

2) Para análisis donde los datos de genotipos individuales de la base de datos del GP2 se empleen de modo secundario (en el caso de que se repliquen resultados de datos procedentes de otra fuente o en manuscritos enfocados en un gen/locus, por ejemplo), los miembros del análisis primario y los grupos de redacción se considerarán autores. Los demás se incluirán bajo el nombre del consorcio, que aparecerá en la lista de autores entre el primer y el último autor. Los autores incluidos bajo el nombre del consorcio aparecerán y podrán buscarse en PubMed una vez la plataforma haya procesado el artículo por completo. Todos los autores mencionados en el artículo o en las notas a pie de página tendrán la oportunidad de ver, hacer comentarios y expresar su acuerdo con el contenido del artículo antes de su entrega para publicación. Los autores pueden pedir que no se les incluya en la lista de autores. Si, tras pedirle que aporte sus comentarios sobre el manuscrito, un coautor no responde en un plazo de dos semanas, dicho coautor no se incluirá en la línea de autores, pero se mencionará en la sección de agradecimientos.

Artículos externos

3) El nombre del consorcio no deberá incluirse en la línea de autores en publicaciones firmadas por autores no miembros. Para dichas publicaciones, los miembros del consorcio tampoco aparecerán en las búsquedas de PubMed.

En consonancia con el punto sobre reconocimiento de más arriba, todas las publicaciones que usen datos del GP2 deben incluir un reconocimiento a ASAP y el GP2.

Situaciones inusuales

Creemos que estas políticas cubren la mayoría de los supuestos de uso de datos del GP2. GP2 confía en que los investigadores sigan estas normas y en que la mayoría de los análisis sean de calidad. Sin embargo, GP2 también anticipa que pueden ocurrir situaciones inusuales.

Manuscritos de calidad insatisfactoria

Si la revisión de un manuscrito por parte del Comité Directivo del GP2 revela que un manuscrito es de mala calidad en lo que respecta al lenguaje, la pregunta científica, los métodos analíticos, la redacción o la claridad, el Comité Directivo del GP2 puede recomendar a los autores que el manuscrito no se presente para publicación sin una revisión exhaustiva. Si los autores deciden presentar el manuscrito de todos modos, el Comité Directivo del GP2 tendrá tres opciones: 1) pedir que no se incluya al GP2 en los créditos como autor grupal; 2) pedir que los autores publiquen una declaración que indique que, si bien emplearon datos del GP2, el GP2 sometió el manuscrito a revisión y concluyó que no era apto para publicación; o 3) revocar a los autores el privilegio de usar datos del GP2 en el futuro.

Incumplimiento del acuerdo de uso de datos del GP2

Si un usuario incumple involuntariamente el acuerdo de uso de datos del GP2, es posible que pueda corregir el error cuando se revele la infracción. Si un usuario incumple los acuerdos a sabiendas, la única sanción al alcance del GP2 será revocarle el acceso a los datos del GP2.

Cumplimiento de las reglas de conferencias

Los autores afirman que los artículos y materiales presentados a reuniones y eventos que representen su trabajo o el de su grupo son propios. Además, mencionan, atribuyen ideas y citan correctamente cualquier trabajo o materiales de otros autores/grupos, incluido el GP2, en consonancia con el Código Ético de la conferencia y/o de la profesión.

Uso fraudulento de datos

El acceso libre mediante registro en línea plantea la posibilidad de que un usuario pueda obtener acceso a los datos con falsos pretextos. Si el Comité Directivo del GP2 descubre que un usuario está tratando de publicar un artículo derivado de datos del GP2 obtenidos de manera fraudulenta, se sancionará al usuario en cuestión mediante la denuncia por parte del Comité Directivo del GP2 al investigador o sus supervisores, las personas/comités responsables de la supervisión del proyecto y los organismos reguladores. En el momento en que el Comité Directivo del GP2 descubra que se ha producido una infracción del acuerdo de uso de datos, se tomarán medidas inmediatas para remediar o poner fin a la infracción. Dichas medidas podrían incluir interrumpir el acceso del usuario a los datos o denunciar el incumplimiento a personas/organizaciones pertinentes.

La Michael J. Fox Foundation, ASAP y el Comité Directivo del GP2 se reservan el derecho de modificar las condiciones de este acuerdo, y podrán hacerlo mediante la publicación de un aviso de las modificaciones en esta página. Las modificaciones entrarán en vigor inmediatamente después de su publicación (a menos que se indique lo contrario). Es importante que regrese a esta página periódicamente para estar al día de las condiciones vigentes del acuerdo de uso.