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发表政策

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2023年6月版

总体而言，全球帕金森病遗传学研究计划（GP2） 旨在制定“不出意外”政策，以公开透明的方式协调和交流分析、项目和手稿。GP2希望数据可以尽可能被更广泛和公开地使用。

  • 对于联盟主导的手稿[例如大型全基因组关联研究（GWAS）] ，所有参与的研究员都会被列为作者，手稿在提交前的两周会在整个GP2网络内分享。
  • 对于使用GP2数据（例如基因/基因座的研究）做子分析的GP2成员，只有做出积极贡献的研究员将会被列入作者名单，但是名单中会出现GP2的标志，所有的GP2研究员都将被列为协作作者，在 PubMed上可以检索到。手稿在提交前的两周会在整个GP2网络内分享。
  • 对于外部非GP2成员主导的稿件（例如外部用户分析或汇总统计子分析），我们要求您在致谢部分中承认GP2，并通过引用AMP PD数据库和所用数据集的版本发布来承认您的数据可用性声明中使用了GP2数据集。稿件发布后请发送电子邮件至[email protected]与我们分享。期待阅读您的稿件！对于所有GP2成员主导的稿件，如果您使用了GP2数据，则必须在提交给期刊以供审阅开放获取出版物时进行预印本上传（例如通过bioRxiv），必须共享代码。我们强烈鼓励使用GP2数据的外部手稿也这样做。

简介

全球帕金森病遗传学研究计划（GP2）是一项国际性工作，旨在深入了解帕金森病（PD）的遗传基础，并实现结果和数据获取的大众化。GP2由帕金森科学联盟（ASAP，https://gp2.org/）资助，该计划的战略目标是支持协作，创造资源并实现数据的大众化。传播GP2代码和数据是GP2的主要目标，ASAP鼓励广泛、快速和公开地发布结果。

概述

制定该政策是为了确保实现以下目标：

  • GP2数据和结果可以被完整、准确和快速地传播。
  • GP2研究成员在研究设计、数据采集和分析以及生物样本收集方面的努力可以得到认可。
  • GP2的发表作品是可追踪的，形成了一份完整的GP2研究发现的纪录。
  • GP2数据分析结果都是免费地、尽可能地向公众公布。

开放取用

由GP2指导委员会、工作组和任何接受GP2资助的人发表的论文需要遵守ASAP和迈克尔·j·福克斯基金会（MJFF）开放取用政策点击这里查看 和 www.michaeljfox.org/openaccesspolicy这意味着所有由GP2撰写的出版物都将：

  1. 作品一经出版，即可在线免费获取，受赠方通过CC BY 4.0许可协议（或等效许可）保留版权，可无限重复使用作品。
  2. 手稿提交到期刊进行审阅后（或更早），将发布在OA预印本存储库中。
  3. 所有研究成果(数据、协议、代码)存放在可公开获取的资料库中，并在出版物中引用。
  4. 对GP2资助的论文应予以恰当署名。

为了促进结果的公开共享，我们强烈建议未获得GP2资助的GP2数据的外部用户也遵守ASAP和MJFF开放取用政策。

成果与代码分享

根据ASAP和MJFF的开放取用政策，GP2指导委员会、工作组和任何其他接受GP2资助的人员将公开所有成果和代码，无论是编策的还是通过分析GP2数据产生的，都可通过公开取用的存储库在网上轻松获取。

GP2将把数据存入数据平台，如“加速药物伙伴关系“平台。帕金森病（AMP® PD）平台和https://www.ebi.ac.uk/gwas/。GP2将通过https://www.protocols.io/ 等平台分享协议，并在可行的情况下尽早通过https://github.com/ 等平台分享代码。其中包括适当的摘要统计信息、元数据、文档和预期的计算用例，视情况而定。关于代码共享指南，请参见GP2最佳实践和代码标准化实践采用文件，以了解更多细节。请注意，对于文章提交，应使用持久标识符注册代码，以便在通过Zenodo提交文章时捕获代码。为了推广公开分享结果和代码，我们强烈建议不受GP2资助的GP2数据的外部用户也在在线平台上公开他们的结果和代码。

行政审查

所有使用GP2数据的手稿、预印本和摘要/海报在提交给任何期刊、公共数据库或会议前必须交由GP2行政审查。GP2将在两周内对所有提交的资料作出回应。请注意，预印本文章必须在提交给任何期刊时（或更早）发布。如需提交手稿或摘要/海报给GP2指导委员会，请发邮件至邮件[email protected]。

致谢

所有使用GP2数据产生的手稿、预印本和摘要/海报必须使用以下语言向ASAP和GP2致谢：

“撰写本文时使用的[数据和/或代码]来自全球帕金森病遗传学计划 (GP2)。GP2项目由帕金森病科学联盟 (ASAP)支持，由迈克尔· J ·福克斯帕金森研究基金会实施 (https://gp2.org)。有关GP2成员的完整列表，请参阅 https://gp2.org 。”

由GP2支持但非明确使用GP2数据而产生手稿、预印本和摘要/海报必须使用以下语言向ASAP和GP2致谢：

“本项目由全球帕金森病遗传学项目（GP2）支持。GP2项目由帕金森病科学联盟 (ASAP)支持，由迈克尔· J ·福克斯帕金森研究基金会实施 (https://gp2.org)。有关GP2成员的完整列表，请参阅 https://gp2.org 。”

作者资格

只要符合GP2数据使用协议，研究者可以将GP2数据用于任何项目/分析。GP2发表作品分三类：

由联盟主导，以GP2为重点的论文

1）对于由GP2指导委员会或工作组发表的且主要基于GP2合作数据集的论文，所有GP2会员都将是共同作者，联盟名[全球帕金森基因计划（GP2）] 将放在资深作者名之后（取决于期刊指南）。所有署名作者可在论文提交前查看、评论、并同意提交论文。作者可以主动提出不出现在作者名单中，任何共同作者如果两周之内不回应手稿的评论要求，或不提供期刊要求的信息的话，将自动被从作者名单上移除，并且移至致谢部分。

间接使用GP2数据的论文

2)对于间接地使用GP2数据库的个人基因型数据的分析（例如，复制非联盟的数据或重点突出基因/基因座的结果的手稿），主要分析和写作小组的成员会被列为作者。其他人都会被，列在联盟名之下，以联盟名收录到作者名单中, 在第一作者和末尾作者之间。列在联盟名下的作者在PubMed审核之后就可以在PubMed上被检索到。所有名单和脚注中的作者可在论文提交前查看、评论、并同意提交论文。作者可以主动提出不出现在作者名单中，任何共同作者如果两周之内不回应手稿的评论要求，或不提供期刊要求的信息，将自动被从作者名单上移除，并且移至致谢部分。

外部论文

3）非联盟成员发表的作品可能不会出现联盟名。对于这些发表作品，联盟成员不会出现在PubMed里。

有关上文提及的致谢部分，所有使用GP2数据的论文必须在致谢部分提及ASAP和GP2。

非常规情况

上文提及的政策适用于大部分的GP2数据用户。GP2期望研究员会遵从这些指南，也期望大部分分析都能达到高质量。但是，GP2预计可能会出现一些非常情况。

极差的手稿

如果GP2指导委员审阅手稿后认为论文的语言、科学问题、分析方法、写作水平或是清晰度极差，则GP2指导委员会可以建议作者必须进行重大修改，否则不要提交。如果作者坚持提交手稿，GP2指导委员会有三个选择：1）要求不得署集体作者名 2）要求作者发表声明，说明尽管手稿使用了GP2数据，但是GP2认为手稿质量没有达到发表水准；3）撤销其未来使用GP2数据的资格。

违反GP2数据使用协议

如果用户无意间违反GP2数据使用协议，一旦发现违规，用户可能会自我改正。如果用户故意违反协议，GP2唯一的制裁选择是撤销用户获取GP2数据的资格。

遵守会议规则

作者证明，提交给会议和活动的展示其工作/小组工作的工作和材料是他们自己的，并且根据会议和/或专业的道德准则，正确承认、归属并引用了其他作者/小组（包括 GP2）的工作和材料。

数据的欺诈性使用

线上注册即可开源使用，让有些人可以假借正当名义获得数据。如果GP2指导委员会发现有人发表通过欺诈手段获得的GP2数据，GP2指导委员会会与研究员或他们的导师、负责监督的个人/委员会和/或管理机构沟通，以对用户进行制裁。一旦GP2指导委员会注意到任何违反数据使用协议，会立即采取行动纠正或终止违规行为。GP2的行动可能包括中止用户访问数据和/或将违规行为报告给相关个人/组织。

迈克尔·J·福克斯基金会、ASAP和GP2指导委员会保留修改本协议条款并在此网页发布有关此类修改的通知的权力。所做的任何修改在发布修改后立即生效（除非另有说明）。您应该定期访问此页面以查看当前的使用协议条款。