نسخة تموز/يوليو 2023

بالمجمل، يهدف البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 إلى أن ينتهج سياسة «لا للمفاجآت» حيث يتم تنسيق الدراسات التحليلية والمشاريع والوثائق بكل شفافية ووضوح. يود البرنامج العالمي GP2 أن يتم استخدام هذه البيانات بشكل مفتوح وعلى أوسع نطاق ممكن.

  • بالنسبة للمخطوطات التي يقودها الائتلاف (مثلا دراسة جينومات واسعة النطاق)، سوف يتم اعتبار كافة الباحثين المشاركين مؤلفين وسيتم مشاركة المخطوطة مع شبكة GP2 الكاملة قبل أسبوعين من تسليمها للنشر. 
  • بالنسبة لأعضاء البرنامج العالمي GP2 الذين يقومون بدراسات تحليلية فرعية باستخدام بيانات GP2(مثلاً دراسة خاصة بجين وراثي/موقع وراثي معين)، سيتم فقط إدراج أسماء الباحثين المساهمين فعليا كمؤلفين على قائمة المؤلفين، لكن سيتم أيضاً تضمين شعار البرنامج العالمي GP2 في قائمة المؤلفين بالتالي يصبح كافة المؤلفين لدى GP2 مؤلفين استكماليين ويمكن البحث عنهم على PubMed. سيتم مشاركة المخطوطة مع شبكة البرنامج العالمي GP2 الكاملة قبل أسبوعين من التسليم للنشر.
  • بالنسبة للمخطوطات التي يقودها أفراد من غير أعضاء برنامج GP2 (مثل تحاليل المستخدمين الخارجيين أو ملخص الإحصائيات أو الدراسات التحليلية الفرعية)، نطلب من هؤلاء ذكر البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 في قسم الشكر والتقدير وذكر مجموعات بيانات GP2 التي تم استخدامها في بيان توفر البيانات، وذلك من خلال الإشارة إلى قاعدة بيانات AMP PD ودفعة البيانات التي تشتمل على مجموعة البيانات المستخدمة. يُرجى مشاركة مخطوطتك معنا عند نشرها على العنوان التالي: [email protected]. يسرنا أن نعرف المزيد عنها! وبالنسبة للمخطوطات التي يقودها أعضاء GP2 الذين يستخدمون بيانات البرنامج في عملهم، فإنهم ملزمون بتحميل نسخ ما قبل الطباعة (مثل bioRxiv) عند التسليم لمجلة بغرض المراجعة ومشاركة الرموز. كما نشجع وبشدة أصحاب المخطوطات الخارجية الذين يستخدمون بيانات برنامج GP2 على اتباع الخطوات ذاتها.

مقدمة

إن البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 هو جهد دولي يهدف إلى الخروج بمعلومات هامة حول الأساس الجيني لداء باركنسون وإتاحة البيانات والنتائج للجميع. هذا البرنامج ممول من مبادرة تسخير العلم من أجل مرض باركنسون (ASAP، https://parkinsonsroadmap.org/ ) ويشكل جزءاً من الأهداف الاستراتيجية للبرنامج لدعم التعاون، وتوليد المراجع، وإتاحة البيانات للجميع. إن تعميم شيفرة وبيانات البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون هو من الأهداف الرئيسية للبرنامج وتشجع مبادرة (ASAP) على نشر النتائج بشكل مفتوح، وسريع، وواسع النطاق.

لمحة عامة

تهدف هذه السياسة إلى ضمان ما يلي:

  • نشر بيانات ونتائج GP2 بشكل كامل، دقيق، وسريع.
  • الإشارة إلى أسماء أعضاء دراسة GP2 لجهودهم في تصميم الدراسة، والحصول على المعلومات، وتحليل البيانات وجمع العينات الحيوية.
  • إمكانية تتبّع منشورات GP2 لتطوير سجل كامل من الاستخلاصات ونتائج جهود البرنامج العالمي GP2
  • إتاحة نتائج تحليل بيانات البرنامج العالمي GP2 وتوفيرها للجمهور بشكل مجاني حيثما أمكن

النفاذ المفتوح

سوف تتبع المنشورات التي ألفها أعضاء اللجنة التوجيهية للبرنامج العالمي GP2، ومجموعات العمل، أو أي أشخاص آخرين حصلوا على تمويل من البرنامج العالمي GP2 سياسات ASAP ومؤسسة مايكل ج. فوكس للنفاذ المفتوح المدرجة هناوعلى www.michaeljfox.org/openaccesspolicyعلى التوالي. هذا يعني بأن كل المنشورات المؤلفة من قبل برنامج GP2 ينطبق عليها ما يلي:

  1. الوصول المجاني المباشر للشبكة الإلكترونية لدى نشر البحث مع الحفاظ على حقوق الملكية الفكرية للمستفيدين من المنحة من خلال رخصة CC BY 4.0 (أو ما يوازيها) لإعادة الاستخدام بشكل غير مقيد.
  2. يتم نشر المخطوطات في إطار سياسة النفاذ المفتوح على مستودع ما قبل الطباعة فور تقديمها لمجلة من أجل المراجعة (أو قبل ذلك).
  3. يتم إيداع كافة مخرجات البحث (البيانات، البروتوكولات، الشيفرة) في مستودعات متاحة للعموم ويتم ذكرها في المنشور.
  4. يتم عزو الأعمال الممولة من مبادرة «ASAP» بالشكل المناسب.

لتعزيز المشاركة العامة للنتائج، نشجع المستخدمين الخارجيين لبيانات البرنامج العالمي GP2، ممّن لم يحصلوا على تمويل من البرنامج، أن يتبعوا سياسات ASAP ومؤسسة مايكل ج. فوكس للنفاذ المفتوح.

مشاركة النتائج والرموز (الشيفرة)

وفقاً لسياسات ASAP ومؤسسة مايكل ج. فوكس للنفاذ المفتوح، فإن على اللجنة التوجيهية للبرنامج العالمي GP2، ومجموعات العمل، وأي شخص آخر حصل على تمويل من برنامج GP2 أن يجعل كافة النتائج والرموز، سواء تم تنسيقها أو توليدها من خلال تحليل بيانات GP2، متاحة للجميع ويمكن الوصول إليها بسهولة عبر الإنترنت بواسطة مستودعات متاحة للعموم.

سوف يقوم برنامج GP2 بإيداع البيانات على منصات البيانات ذات الصلة مثل منصة تعزيز شراكة تطوير أدوية مرض باركنسون (AMP® PD) ومنصة https://www.ebi.ac.uk/gwas/. سوف يشارك برنامج GP2 البروتوكولات بواسطة منصات مثل https://www.protocols.io/، كما يشارك الرموز على منصات مثل https://github.com في أقرب فرصة وحيثما كان ذلك ممكناً. يشمل ذلك ملخص الإحصائيات، والبيانات الوصفية، والتوثيق، والحالات المخصصة للاستخدام الحاسوبي، حيثما كان ذلك مناسباً. لتعليمات مشاركة الرموز (الشيفرة) يرجى العودة إلى «الممارسات النموذجية وممارسات توحيد الرموز (الشيفرة) التي يجب اعتمادها» لمزيد من التفاصيل. في حالة تسليم المقالات، يُرجى الانتباه إلى وجوب تسجيل الرمز بمعرف ثابت يعكس الرمز المستخدم عند تسليم المقال بواسطة Zenodo. لتعزيز المشاركة المفتوحة للنتائج والرموز (الشيفرة)، نشجع المستخدمين الخارجيين لبيانات البرنامج العالمي GP2 الذين لا يحصلون على تمويل من برنامج GP2 أن يشاركوا هذه النتائج على منصات إلكترونية للبيانات متاحة للعموم أيضاً.

المراجعة الإدارية

يجب أن يتم إرسال كافة المخطوطات، ما قبل الطباعة، والملخصات/الملصقات التي تستخدم بيانات البرنامج العالمي GP2 إلى البرنامج للمراجعة الإدارية قبل تسليمها لأي مجلة، أو قاعدة بيانات عامة، أو مؤتمر. سيقوم البرنامج العالمي GP2 بالإجابة على كافة الطلبات خلال أسبوعين. يُرجى الانتباه إلى أنه يجب تحميل نسخ ما قبل النشر من المقالات عند تسليمها لأي مجلة (أو حتى قبل ذلك). لتسليم مخطوطة أو ملخص/ملصق للجنة التوجيهية للبرنامج العالمي GP2، يرجى إرسالها بالبريد آلإلكتروني إلى [email protected].

الشكر والتقدير

على كل المخطوطات، والنسخ ما قبل الطباعة، والملخصات/ الملصقات الناتجة عن استخدام مسارات تحليل البيانات التابعة للبرنامج العالمي GP2 أن تذكرASAP وGP2 على النحو التالي:

«تم الحصول على البيانات المستخدمة في إعداد هذا المقال من البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2. البرنامج العالمي GP2 ممول من مبادرة «تسخير العلم من أجل داء باركنسون» ASAP وتم تنفيذه من قبل مؤسسة مايكل ج. فوكس لأبحاث باركنسون (https://gp2networkstg.org). للاطلاع على القائمة الكاملة لأعضاء برنامج GP2، يُرجى مراجعة الرابط التالي https://gp2.org.

على كل المخطوطات، والنسخ ما قبل الطباعة، والملخصات/ الملصقات الناتجة عن استخدام مسارات تحليل البيانات التابعة للبرنامج العالمي GP2 أن تذكرASAP وGP2 على النحو التالي:

«تم دعم هذا المشروع من قبل البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2». البرنامج العالمي GP2 ممول من مبادرة «تسخير العلم من أجل داء باركنسون» ASAP وتم تنفيذه من قبل مؤسسة مايكل ج. فوكس لأبحاث باركنسون (https://gp2networkstg.org). للاطلاع على القائمة الكاملة لأعضاء برنامج GP2، يُرجى مراجعة الرابط التالي https://gp2.org.

التأليف

يمكن للباحثين استخدام بيانات البرنامج العالمي GP2 لأي مشاريع/تحليل ذات أهمية وتمتثل لاتفاقية استخدام بيانات البرنامج العالمي GP2. سوف يكون هناك ثلاثة أنواع من منشورات البرنامج العالمي GP2:

أوراق تركز على البرنامج العالمي GP2، يقودها الائتلاف

1) بالنسبة للأوراق التي تؤلفها اللجنة التوجيهية أو فرق العمل والتي تستند بشكل رئيسي إلى مجموعة البيانات التعاونية للبرنامج العالمي GP2، سيكون الأعضاء مؤلفين مشاركين وسوف يرد اسم الائتلاف (البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2) بعد كبار المؤلفين (وفقا لتعليمات المجلة العلمية). يجب أن يراجع الورقة كافة المؤلفين الذين ترد أسماؤهم فيها، ويعلقوا عليها ويوافقوا على تقديمها قبل تسليمها للنشر. يمكن للمؤلفين أن يختاروا عدم إدراج اسمائهم في قائمة المؤلفين، ويمكن شطب اسم أي من المؤلفين المشاركين الذين لا يستجيبون خلال أسبوعين من إرسال طلب التعليق على مخطوطة أو توفير المعلومات المطلوبة من المجلة العلمية من قائمة المؤلفين ونقلها إلى قائمة الشكر والتقدير.

الأوراق التي تستخدم بيانات GP2 بشكل ثانوي

2) بالنسبة للتحليل الذي يستخدم بيانات النموذج الوراثي من قاعدة بيانات GP2 بشكل ثانوي (مثلاً لتكرار النتائج من بيانات من خارج الائتلاف أو مخطوطة تركز على الجين الوراثي/الموقع الوراثي)، يتم تسمية أعضاء التحليل الأولي ومجموعات الكتابة كمؤلفين. يتم وضع أسماء كل الأشخاص الآخرين في قائمة تحت اسم الائتلاف والذي سوف يرد في قائمة المؤلفين بين اسم المؤلف الأول والأخير. سوف تظهر أسماء المؤلفين في القائمة تحت اسم الائتلاف في البحث على PubMed بعد معالجة الأسماء من قبل PubMed. يجب أن يقوم كافة المؤلفين الذين وردت أسماؤهم إما في الحاشية أو في قائمة المؤلفين بمراجعة الورقة، والتعليق عليها والموافقة على تقديمها قبل تسليمها للنشر. يمكن للمؤلفين أن يختاروا عدم إدراج أسمائهم في قائمة المؤلفين، ويمكن شطب اسم أي من المؤلفين المشاركين الذين لا يستجيبون خلال أسبوعين من إرسال طلب التعليق على مخطوطة أو توفير المعلومات المطلوبة من المجلة العلمية من قائمة المؤلفين ونقلها إلى قائمة الشكر والتقدير.

الأوراق الخارجية

3) يمكن أن لا يرد اسم الائتلاف على قائمة المؤلفين في المنشورات التي يؤلفها أفراد من خارج الائتلاف. بالنسبة لهذه المنشورات، لن يتم إدراج أسماء أعضاء الائتلاف في PubMed.

وفقاً لقسم التقدير أعلاه، فإن كل المنشورات التي تستخدم بيانات GP2 يجب أن يرد فيها إشارة تقدير لـ ASAP وGP2.

أوضاع غير اعتيادية

نتوقع أن تغطي السياسات المذكورة أعلاه أغلبية المستخدمين لبيانات البرنامج العالمي GP2. يتوقع البرنامج العالمي GP2 أيضاً أن يقوم الباحثون باتباع هذه التعليمات بنوايا حسنة وأن أغلب الدراسات سوف تكون ذات جودة عالية. بيد أن البرنامج العالمي GP2 يتوقع أيضاً إمكانية حدوث أوضاع غير اعتيادية.

مخطوطات رديئة جدا

إذا تبين بعد قيام اللجنة التوجيهية للبرنامج العالمي GP2 بمراجعة مخطوط معين بأنه رديء جدا من حيث اللغة، أو الفرضية العلمية، أو أساليب التحليل، أو الكتابة، أو الوضوح، يمكن أن توصي اللجنة التوجيهية للمؤلفين بعدم تسليمه إلا بعد مراجعته بشكل متعمق. إذا اختار المؤلفون تسليم المخطوطة بكل الأحوال، يكون أمام اللجنة التوجيهية ثلاثة خيارات: 1) طلب حجب الإشارة إليها في قائمة المؤلفين، 2) الطلب من المؤلفين نشر بيان يقول بأنه، ومع أن هذا البحث استخدم بيانات البرنامج العالمي GP2، إلا أن البرنامج العالمي لم يجد أن هذه المخطوطة تستحق التسليم للنشر، أو 3) رفض إعطائهم إمكانية استخدام بيانات GP2 في المستقبل.

الإخلال باتفاقية البرنامج العالمي GP2 لاستخدام البيانات

إذا قام المستخدمون بشكل غير مقصود بالإخلال باتفاقية البرنامج العالمي GP2 لاستخدام البيانات، من الأرجح أن يقوموا بتصحيح هذه الاختلالات بشكل تلقائي لدى اكتشافها. إذا قام المستخدمون بانتهاك هذه الاتفاقيات بشكل مقصود، فإن العقوبة الوحيدة المتاحة لدى GP2 هي رفض إعطائهم رخصة الولوج إلى بيانات GP2.

الالتزام بقواعد المؤتمرات

يجب أن يشهد المؤلفون بأن العمل والمادة المقدمين في الاجتماعات والفعاليات، واللذين يعرضان عملهم/عمل مجموعتهم، هما من أعمالهم الأصيلة. كما يتعهد المؤلفون بذكر أعمال ومواد المؤلفين الآخرين/المجموعات الأخرى، بما في ذلك برنامج GP2، وعزوها لهم والاستشهاد بها وفقاً لمدونة أخلاقيات المؤتمر و/أو المهنة.

الاستخدام الاحتيالي للبيانات

تتيح سياسة النفاذ المفتوح التي تستخدم فقط التسجيل الإلكتروني إمكانية حصول الأفراد على البيانات لأغراض احتيالية. إذا اكتشفت اللجنة التوجيهية محاولة نشر باستخدام بيانات GP2 تم الحصول عليها بشكل احتيالي، سيتم معاقبة المستخدم من خلال تواصل اللجنة التوجيهية مع الباحث أو المشرفين عليه، و/أو الأشخاص/اللجان المسؤولة عن الإشراف، و/أو الهيئات المسؤولة. فور تناهي هذا الخرق لاتفاقية استخدام البيانات إلى علم اللجنة التوجيهية، سيتم اتخاذ خطوات فورية لتصحيح هذا الخرق ووضع حد له. قد يشمل ذلك وقف تصريح دخول ذلك المستخدم إلى البيانات، و/أو رفع تقرير بهذا الانتهاك إلى الفرد/المؤسسة المعنية.

تحتفظ مؤسسة مايكل ج. فوكس، وASAP واللجنة التوجيهية للبرنامج العالمي GP2 بحق تعديل شروط هذه الاتفاقية، ويمكن أن يقوموا بذلك من خلال نشر إعلان بهذه التعديلات على هذه الصفحة. تصبح هذه التعديلات نافذة فور نشرها (إلا في حال ورد ما هو غير ذلك). عليكم زيارة هذه الصفحة بشكل دوري لمراجعة شروط الاستخدام.