Arbeitsgruppe Data and Code Dissemination (Daten- und Code-Verbreitung)

Unser Ziel ist es, Open Science zu ermöglichen, indem wir einerseits relevante Daten, Analysecode und Ergebnisse teilen und anderseits auf Datenschutz, Vorschriften und Datensicherheit achten.

GP2 arbeitet in Partnerschaft mit Accelerating Medicines Partnership: Parkinson’s Disease (AMP-PD), eine Parkinson-Genetik-Forschungsplattform zur Verbreitung von GP2-Kohortendaten. Der Zugriff und die Analyse von GP2-Daten kann über AMP-PD erfolgen.

Wenn Sie mehr erfahren möchten, besuchen Sie GP2 GitHub. Weitere Tools aus dem Bereich Genomik und Maschinelles Lernen finden Sie unter GenoML.

Arbeitsgruppe
Bradford Casey, PhD
Biografie

Bradford Casey, PhD

Michael J. Fox Foundation | USA
Mary B. Makarious, BSc
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Mary B. Makarious, BSc

National Institutes of Health | USA
Jeff J. Kim, BA
Biografie

Jeff J. Kim, BA

National Institutes of Health | USA
Meilensteine
Bisherige Fortschritte
  • Prüfung bewährter Praktiken im Austausch von Daten und Code
  • Erarbeitung der GP2-Code-Richtlinien gemeinsam mit dem Datenanalyse-Team. 
  • Abschluss der Vereinbarung und Auswahl von Partnerschaften mittels umfassender Due Diligence
Verbleibende Ziele für Jahr 1
  • Enge Zusammenarbeit mit den GP2-Analyse-Gruppen, um deren Daten und Code zugänglich und replizierbar zu machen
  • Fortsetzung der Arbeit am inkrementellen Ausbau einer Partnerschaftsplattform
  • Zusammenarbeit mit der Arbeitsgruppe Operations and Compliance (Betrieb und Compliance) an einer Vorlage für Bereitsteller von Daten, um den Daten- und Codebestand zur endgültigen Verbreitung zu bewerten und zu dokumentieren
  • Freigabe der ersten Daten- und Code-Tranche

Kontakt

Bei allgemeinen Fragen zu AMP-PD und damit verbundenen Analysetools wenden Sie sich bitte an [email protected].