GP2学習プラットフォーム
トレーニングはGP2の中核をなすものであり、このプロジェクトを通してパーキンソン病遺伝学に関連する様々なトピックでオンライントレーニングコースを提供します。このプラットフォームはどなたでもご利用になれます。参加するには、次のフォームに記入してください。
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このフォームを提出すると、GP2とASAPの最新情報がメールで届きます。GP2のトレーニング機会に関するご質問は[email protected]までご連絡ください。
開講コース
以下は、学習プラットフォームからアクセス可能なGP2の現在の開講コースです。GP2の学習プラットフォームからコースにアクセスするには、上記のフォームに必要事項を入力してください。コースとトレーニングは常時アップデートされています。随時ご確認ください。
- Terraとか何か？
- AMP® PD 及びTerraから利用可能なリソース
- ノートブック入門
- Googleクラウドプラットフォーム入門
- Terraノートブックでのデータクエリ
- VCFアクセスと関連ファイル
- 価格
- デモ：Terraノートブックでの分析
- 評価：知識のチェック：Terraを使用したデータアクセス＆分析
- 遺伝子型同定品質管理
- インピュテーション
- バイナリと質的特性のための全ゲノム関連研究
- パーキンソン病のポリジェニックリスクスコア
- 全エクソーム・ゲノム配列を使った変異種優先化
- 翻訳遺伝学のためのネットワーク分析の応用
- 次のステップ
- パーキンソン病の遺伝学入門編：過去、現在、未来
- 基礎的な遺伝学概念の理解
- モノジェニックパーキンソン病：家族研究
- 臨床パーキンソン病遺伝学
- パーキンソン病遺伝学研究のための最新技術
- 散発性ＰＤの遺伝学：ゲノムワイド関連研究とリスク予測
- 進行と発症年齢の遺伝学的理解
- 非定型パーキンソニズムの遺伝学
- これまで取り上げられてこなかった人口集団の遺伝学：利点と課題
- GWAS時代後のPD遺伝学：因果関係を理解するためのメンデル無作為化法の使用
- GWAS時代後のPD遺伝学：ファインマッピング、コローカリゼーション、データ統合
- 薬品開発におけるパーキンソン病遺伝学
- パーキンソン病の構造的な遺伝的変異
- 結論
- 統計の基本
- 統計の解釈および仮説のテスト
- 研究デザイン
- 統計分析
- 全体的レビューとメタ分析
- 研究方法入門
- 統計の解釈方法を学ぶ
- 様々な研究デザインの適用方法を理解する
- 導入およびTerraデモ
- 現在のAMPおよびGP2データとコスト管理入門
- アップロード、アクセス、データへのコピー
- 臨床データの扱い
- 例 1:非ヨーロッパ系集団における多遺伝子リスクスコア
- 例 2:単一遺伝子分析
- ワークフローおよびWDL入門
- パーキンソン病進行に関するGenome-Wide Association研究
- パーキンソン病における遺伝的変異の累積的影響の検討
- ジェノタイピングデータに基づくコピー数変異と同型接合性実行の探索
- パーキンソン病のリスクに関するPost-Genome-Wide Association研究 I
- パーキンソン病のリスクに関するPost-Genome-Wide Association研究 II
パイソンを使ったプログラム入門
パイソンの構文と意味理解
データと運用構成：条件付きステートメントとループ
機能、ストリング操作、通常表現
パッケージとモジュール
データの可視化、エラー、例外
バイオ医療データにおけるパイソン応用
パーキンソン病の臨床遺伝子テスト：なぜ、いつ、どのように？
AMP-PD動画シリーズ
- パート１：AMP-PDとリソース入門
- パート2a：Googleクラウドプラットフォーム入門
- パート2b:BigQuery
- パート3a:研究者ワークベンチ（Terra）
- パート3b:AMP-PDワークスペース
- パート4：NIH Strides概要
