A grandes rasgos, el Global Parkinson’s Genetics Program (GP2) se rige por una política de «evitar sorpresas», en virtud de la cual análisis, proyectos y manuscritos se coordinan y comunican de manera abierta y transparente. Es la voluntad del GP2 que los datos se usen de la manera más generalizada y abierta posible.
- En el caso de los manuscritos liderados por un consorcio (por ejemplo, un GWAS grande), todos los investigadores contribuyentes se incluirán como autores y el manuscrito se compartirá dentro de toda la red GP2 dos semanas antes del envío.
- Para los miembros de GP2 que realizan subanálisis utilizando datos de GP2 (por ejemplo, estudios específicos de genes/locus), solo los investigadores que contribuyan activamente y trabajen en el subanálisis o la redacción se incluirán como autores nombrados en la lista de autores; sin embargo, el banner de GP2 se incluirá en la lista de autores y, por lo tanto, todos los investigadores de GP2 serán autores complementarios, que se podrán buscar en PubMed. El manuscrito deberá compartirse con toda la red del GP2 dos semanas antes de su envío para publicación.
- Para los manuscritos externos no dirigidos por miembros de GP2 (por ejemplo, análisis de usuarios externos o subanálisis de estadísticas de resumen), le solicitamos que reconozca a GP2 en su sección de reconocimiento y que reconozca los conjuntos de datos de GP2 utilizados en su declaración de disponibilidad de datos haciendo referencia a la base de datos AMP PD y la versión de lanzamiento del conjunto de datos utilizado. Por favor comparta su manuscrito con nosotros una vez que esté publicado en [email protected]. ¡Nos encantaría que lo compartiera con nosotros! Para todos los manuscritos dirigidos por miembros de GP2, si está trabajando con datos de GP2, las cargas de preimpresiones (por ejemplo, bioRxiv) al momento del envío a una revista para revisión, las publicaciones de acceso abierto y el intercambio de códigos son obligatorios. Recomendamos encarecidamente que los manuscritos externos que usen datos del GP2 hagan lo propio.
Introducción
El Global Parkinson’s Genetics Program (GP2) es un programa internacional que tiene por objeto generar conocimientos reveladores sobre la base genética de la enfermedad de Parkinson (EP) y democratizar el acceso a resultados y datos. GP2 está financiado por la iniciativa Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP, https://gp2.org/ ) y es parte de los objetivos estratégicos de este programa apoyar la colaboración, generar recursos y democratizar los datos. La difusión de los datos del GP2 es una de las metas principales del GP2, y ASAP fomenta la publicación de resultados rápida, accesible y a gran escala.
Resumen
El objetivo de esta política es garantizar que
- los datos y resultados del GP2 se difundan de manera integral, precisa y con celeridad.
- se reconozca a los miembros del estudio del GP2 por su trabajo en el diseño del estudio, la adquisición y el análisis de datos y la recogida de muestras biológicas.
- se pueda llevar un registro de las publicaciones del GP2 para elaborar una lista completa de los hallazgos derivados de las iniciativas del GP2.
- los resultados de los análisis de datos del GP2 sean accesibles y estén disponibles al público gratuitamente cuando sea posible.
Acceso libre
Las publicaciones creadas por el Comité Directivo del GP2, los Grupos de Trabajo y cualquier otro destinatario de fondos del GP2 seguirán las Políticas de Acceso Abierto de ASAP y de la Fundación Michael J. Fox (MJFF) publicadas aquí y en www.michaeljfox.org/openaccesspolicy, respectivamente. Esto significa que todas las publicaciones creadas con GP2 tendrán:
- Acceso inmediato y gratuito en línea tras la publicación, los beneficiarios conservarán los derechos de autor en virtud de una licencia CC BY 4.0 (o equivalente), que permite la reutilización de la publicación sin restricciones.
- Los manuscritos se publican en un repositorio de prepublicaciones de acceso libre tras su envío a una revista para su revisión (o antes).
- Todos los resultados de la investigación (datos, protocolos, código) deben depositarse en repositorios de acceso público y citarse en la publicación.
- Atribuciones adecuadas de los trabajos financiados por el GP2.
Para promover el libre intercambio de resultados, se ruega a los usuarios externos de datos del GP2 que no reciban fondos del GP2 que también se adhieran a las políticas de acceso libre de ASAP y MJFF.
Compartir resultados y código
De acuerdo con las políticas de acceso libre de ASAP y la MJFF, el Comité Directivo del GP2, sus grupos de trabajo y todos los beneficiarios financiados por el GP2 deben asegurarse de que los resultados y el código tanto extraídos como desarrollados a partir de análisis con datos del GP2 se compartan públicamente y sean fácilmente accesibles en línea a través de repositorios públicos, confiables y aceptados por la comunidad.
GP2 depositará datos en plataformas de datos como la Asociación para Acelerar los Medicamentos: Plataforma de la enfermedad de Parkinson (AMP® PD) y en https://www.ebi.ac.uk/gwas/. GP2 compartirá protocolos a través de plataformas como https://www.protocols.io/ y compartirá código a través de plataformas como https://github.com/ tan pronto como sea posible y cuando sea factible. Esta política se aplicará a estadísticas, metadatos, documentación y casos de uso computacionales, según proceda. Para conocer las pautas para compartir código, consulte el documento Mejores prácticas de GP2 y Prácticas de estandarización de código a adoptar para obtener más detalles. Tenga en cuenta que para el envío de artículos, el código debe registrarse con un identificador persistente para capturar el código en el momento del envío del artículo a través de Zenodo. Para promover el libre intercambio de resultados y códigos, instamos a los usuarios externos de datos del GP2 que no reciban fondos del GP2 a compartir también sus resultados y código en plataformas de datos en línea de acceso público.
Revisión administrativa
Todos los manuscritos, preimpresiones y resúmenes/pósteres que usen datos del GP2 deberán someterse a una revisión administrativa por parte del GP2 antes de ser enviados como propuesta a una revista, base de datos pública o conferencia. El GP2 responderá a todas las propuestas recibidas en un plazo máximo de dos semanas. Tenga que en cuenta que deberá haber prepublicado el artículo en el momento de presentarlo a una revista (o antes). Para enviar un manuscrito o resumen/póster al Comité Directivo del GP2, envíe un correo electrónico a [email protected].
Reconocimientos
Todos los manuscritos, prepublicaciones y resúmenes/pósteres derivados del uso de datos o código del GP2 deben citar a ASAP y al GP2 con la formulación siguiente:
“[Los datos y/o códigos] utilizados en la preparación de este artículo se obtuvieron del Programa Global de Genética de Parkinson (GP2). GP2 está financiado por la iniciativa Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP) e implementado por la Fundación Michael J. Fox para la Investigación del Parkinson ( https://gp2.org ). Para obtener una lista completa de los miembros de GP2, consulte https://gp2.org ”.
Todos los manuscritos, prepublicaciones y resúmenes/pósteres que hayan contado con el apoyo del GP2, pero que no se deriven explícitamente del uso de datos del GP2 deben citar a ASAP y al GP2 con la formulación siguiente:
“Este proyecto fue apoyado por el Programa Global de Genética de Parkinson (GP2). GP2 está financiado por la iniciativa Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP) e implementado por la Fundación Michael J. Fox para la Investigación del Parkinson ( https://gp2.org ). Para obtener una lista completa de los miembros de GP2, consulte https://gp2.org ”.
Autoría
Los investigadores pueden usar datos del GP2 para cualquier proyecto/análisis de su interés siempre que se cumpla con el acuerdo de uso de datos del GP2. Las publicaciones del GP2 pueden ser de tres tipos:
Artículos dirigidos por el consorcio, enfocados en el GP2
1) En artículos firmados por el Comité Directivo o los grupos de trabajo o de proyecto del GP2 y enfocados principalmente en los conjuntos de datos colaborativos del GP2, todos los miembros del GP2 constarán como coautores y el nombre del consorcio (Global Parkinson’s Genetics Program [GP2]) se incluirá después de los autores principales (siguiendo las convenciones de la revista). Todos los autores mencionados tendrán la oportunidad de ver, hacer comentarios y expresar su acuerdo con el contenido del artículo antes de su entrega para publicación. Los autores pueden pedir que no se les incluya en la lista de autores. Si, tras pedirles que aporten sus comentarios sobre el manuscrito o que proporcionen información solicitada por la revista, un coautor no responde en un plazo de dos semanas, dicho coautor no se incluirá en la línea de autores, pero se mencionará en la sección de agradecimientos.
Artículos que incorporan datos del GP2 de modo secundario
2) Para análisis donde los datos de genotipos individuales de la base de datos del GP2 se empleen de modo secundario (en el caso de que se repliquen resultados de datos procedentes de otra fuente o en manuscritos enfocados en un gen/locus, por ejemplo), los miembros del análisis primario y los grupos de redacción se considerarán autores. Los demás se incluirán bajo el nombre del consorcio, que aparecerá en la lista de autores entre el primer y el último autor. Los autores incluidos bajo el nombre del consorcio aparecerán y podrán buscarse en PubMed una vez la plataforma haya procesado el artículo por completo. Todos los autores mencionados en el artículo o en las notas a pie de página tendrán la oportunidad de ver, hacer comentarios y expresar su acuerdo con el contenido del artículo antes de su entrega para publicación. Los autores pueden pedir que no se les incluya en la lista de autores. Si, tras pedirle que aporte sus comentarios sobre el manuscrito, un coautor no responde en un plazo de dos semanas, dicho coautor no se incluirá en la línea de autores, pero se mencionará en la sección de agradecimientos.
Artículos externos
3) El nombre del consorcio no deberá incluirse en la línea de autores en publicaciones firmadas por autores no miembros. Para dichas publicaciones, los miembros del consorcio tampoco aparecerán en las búsquedas de PubMed.
En consonancia con el punto sobre reconocimiento de más arriba, todas las publicaciones que usen datos del GP2 deben incluir un reconocimiento a ASAP y el GP2.
Situaciones inusuales
Creemos que estas políticas cubren la mayoría de los supuestos de uso de datos del GP2. GP2 confía en que los investigadores sigan estas normas y en que la mayoría de los análisis sean de calidad. Sin embargo, GP2 también anticipa que pueden ocurrir situaciones inusuales.
Manuscritos de calidad insatisfactoria
Si la revisión de un manuscrito por parte del Comité Directivo del GP2 revela que un manuscrito es de mala calidad en lo que respecta al lenguaje, la pregunta científica, los métodos analíticos, la redacción o la claridad, el Comité Directivo del GP2 puede recomendar a los autores que el manuscrito no se presente para publicación sin una revisión exhaustiva. Si los autores deciden presentar el manuscrito de todos modos, el Comité Directivo del GP2 tendrá tres opciones: 1) pedir que no se incluya al GP2 en los créditos como autor grupal; 2) pedir que los autores publiquen una declaración que indique que, si bien emplearon datos del GP2, el GP2 sometió el manuscrito a revisión y concluyó que no era apto para publicación; o 3) revocar a los autores el privilegio de usar datos del GP2 en el futuro.
Incumplimiento del acuerdo de uso de datos del GP2
Si un usuario incumple involuntariamente el acuerdo de uso de datos del GP2, es posible que pueda corregir el error cuando se revele la infracción. Si un usuario incumple los acuerdos a sabiendas, la única sanción al alcance del GP2 será revocarle el acceso a los datos del GP2.
Cumplimiento de las reglas de conferencias
Los autores afirman que los artículos y materiales presentados a reuniones y eventos que representen su trabajo o el de su grupo son propios. Además, mencionan, atribuyen ideas y citan correctamente cualquier trabajo o materiales de otros autores/grupos, incluido el GP2, en consonancia con el Código Ético de la conferencia y/o de la profesión.
Uso fraudulento de datos
El acceso libre mediante registro en línea plantea la posibilidad de que un usuario pueda obtener acceso a los datos con falsos pretextos. Si el Comité Directivo del GP2 descubre que un usuario está tratando de publicar un artículo derivado de datos del GP2 obtenidos de manera fraudulenta, se sancionará al usuario en cuestión mediante la denuncia por parte del Comité Directivo del GP2 al investigador o sus supervisores, las personas/comités responsables de la supervisión del proyecto y los organismos reguladores. En el momento en que el Comité Directivo del GP2 descubra que se ha producido una infracción del acuerdo de uso de datos, se tomarán medidas inmediatas para remediar o poner fin a la infracción. Dichas medidas podrían incluir interrumpir el acceso del usuario a los datos o denunciar el incumplimiento a personas/organizaciones pertinentes.
La Michael J. Fox Foundation, ASAP y el Comité Directivo del GP2 se reservan el derecho de modificar las condiciones de este acuerdo, y podrán hacerlo mediante la publicación de un aviso de las modificaciones en esta página. Las modificaciones entrarán en vigor inmediatamente después de su publicación (a menos que se indique lo contrario). Es importante que regrese a esta página periódicamente para estar al día de las condiciones vigentes del acuerdo de uso.