سياسة النشر

بالمجمل، يهدف البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 إلى اتباع سياسة «تجنب المفاجآت» حيث يتم تنسيق الدراسات التحليلية والمشاريع والوثائق بكل شفافية ووضوح. ويأمل برنامج GP2 أن تُستخدم هذه البيانات بانفتاح وعلى أوسع نطاق ممكن.

• بالنسبة للمخطوطات التي يقودها الائتلاف (مثل دراسة ارتباط الجينات ببعض الأمراض)، سوف يتم اعتبار كافة الباحثين المشاركين مؤلفين، وسيتم مشاركة المخطوطة مع شبكة GP2 الكاملة قبل أسبوعين من تسليمها للنشر.
• بالنسبة لأعضاء برنامج GP2 ممّن يقومون بدراسات تحليلية فرعية باستخدام بيانات GP2(مثل دراسة خاصة بجين وراثي/موقع وراثي معين)، سيتم إدراج أسماء الباحثين المساهمين الذين يعملون عليها بشكلٍ مباشرٍ فقط كمؤلفين على قائمة المؤلفين، لكن سيتم تضمين يافطة أسماء المؤلفين في برنامج GP2، وبالتالي يصبح كافة مؤلفي برنامج GP2 مؤلفين إضافيين، ويمكن البحث عنهم على PubMed. سيتم مشاركة المخطوطة مع كل أعضاء شبكة برنامج GP2 قبل أسبوعين من التسليم للنشر.
• بالنسبة للمخطوطات التي يقودها أفراد من غير أعضاء برنامج GP2 (مثل تحاليل المستخدمين الخارجيين أو ملخص الإحصائيات أو الدراسات التحليلية الفرعية)، نطلب من هؤلاء ذكر البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 في قسم الشكر والتقدير، وذكر مجموعات بيانات GP2 التي تم استخدامها في تقرير توفر البيانات، وذلك من خلال الإشارة إلى قاعدة بيانات AMP PD ودفعة البيانات التي تشتمل على مجموعة البيانات المستخدمة. يُرجى مشاركة مخطوطتك معنا عند نشرها على العنوان التالي:[email protected]. يسرنا أن نعرف المزيد عنها! وبالنسبة للمخطوطات التي يقودها أعضاء GP2 ممّن يستخدمون بيانات البرنامج في عملهم، فإنهم ملزمون بتحميل نسخ ما قبل الطباعة (مثل bioRxiv) عند التسليم لمجلة بغرض المراجعة، والالتزام بالنشر في مطبوعات متاحة للجميع وبمشاركة الرموز (الشيفرة). كما نشجع وبشدة أصحاب المخطوطات الخارجية الذين يستخدمون بيانات برنامج GP2 على اتباع الخطوات ذاتها.

مقدمة

إن البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 هو جهد دولي يهدف إلى الخروج بمعلومات هامة حول الأساس الجيني لداء باركنسون، وإتاحة البيانات والنتائج للجميع. هذا البرنامج مُموَّل من مبادرة تسخير العلم من أجل داء باركنسون «أساب» ( https://gp2.org/)، ويُشكّل جزءًا من الأهداف الاستراتيجية للبرنامج لدعم التعاون، وتوليد المراجع، وإتاحة البيانات للجميع. إن تعميم بيانات البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون هو من الأهداف الرئيسية للبرنامج، وتشجع مبادرة «أساب» على نشر النتائج بانفتاح وسرعة وعلى نطاقٍ واسع.

لمحة عامة

تهدف هذه السياسة إلى ضمان ما يلي:

• نشر بيانات برنامج GP2 ونتائجه بشكلٍ كامل، ودقيق، وسريع.
• الاعتراف بجهود أعضاء دراسة GP2 في تصميم الدراسة، والحصول على المعلومات، وتحليل البيانات وجمع العينات الحيوية.
• إمكانية تتبّع منشورات GP2 لتطوير سجل كامل من الاستخلاصات ونتائج جهود برنامج GP2
• إتاحة نتائج تحليل بيانات برنامج GP2 وتوفيرها للجمهور بشكلٍ مجاني حيثما أمكن

النفاذ المفتوح

سوف تتبع المنشورات التي ألفها أعضاء اللجنة التوجيهية لبرنامج GP2، ومجموعات العمل، أو أي أشخاص آخرين حصلوا على تمويل من البرنامج، سياسات «أساب» ومؤسسة مايكل ج. فوكس للنفاذ المفتوح المدرجة هنا وهناwww.michaeljfox.org/openaccesspolicyعلى التوالي. هذا يعني بأن كل المنشورات المؤلفة من قبل برنامج GP2 ينطبق عليها ما يلي:

1. الإتاحة المجانية المباشرة عبر الإنترنت فور نشر البحث مع الحفاظ على حقوق الملكية الفكرية للمستفيدين من المنحة من خلال رخصة CC BY 4.0 (أو ما يوازيها) لإعادة الاستخدام بشكل غير مقيد.
2. يتم نشر المخطوطات في إطار سياسة النفاذ المفتوح على مستودع ما قبل الطباعة فور تقديمها لمجلة من أجل المراجعة (أو قبل ذلك).
3. يتم إيداع كافة مخرجات البحث (البيانات، البروتوكولات، الشيفرة) في مستودعات متاحة للعموم ويتم ذكرها في المنشور.
4. تتم الإشارة إلى التمويل من برنامج GP2 بالشكل المناسب.

لتعزيز المشاركة العامة للنتائج، نشجع المستخدمين الخارجيين لبيانات البرنامج العالمي GP2، ممّن لم يحصلوا على تمويل من البرنامج، أن يتبعوا سياسات ASAP ومؤسسة مايكل ج. فوكس للنفاذ المفتوح.

مشاركة النتائج والرموز (الشيفرة)

وفقاً لسياسات «أساب» ومؤسسة مايكل ج. فوكس للنفاذ المفتوح، على اللجنة التوجيهية لبرنامج GP2، ومجموعات العمل، وأي شخص آخر حصل على تمويل من البرنامج أن يجعل كافة النتائج والرموز (الشيفرة)، سواء تم تنسيقها أو توليدها من خلال تحليل بيانات GP2، متاحة للجميع ويمكن الوصول إليها بسهولة عبر الإنترنت بواسطة مستودعات موثوقة ومقبولة لدى مجتمع الباحثين. سوف يقوم برنامج GP2 بإيداع البيانات على منصات البيانات ذات الصلة مثل منصة تعزيز الشراكة لتسريع تطوير أدوية داء باركنسون (AMP® PD) ومنصة https://www.ebi.ac.uk/gwas/. سوف يشارك برنامج GP2 البروتوكولات بواسطة منصات مثل https://www.protocols.io/، كما يشارك الرموز (الشيفرة) على منصات مثل https://github.com/ في أقرب فرصة وحيثما كان ذلك ممكنًا. يشمل ذلك ملخص الإحصائيات، والبيانات الوصفية، والتوثيق، والحالات المخصصة للاستخدام الحاسوبي، حيثما كان ذلك مناسبًا. لتعليمات مشاركة الرموز (الشيفرة)، يرجى العودة إلى «الممارسات النموذجية وممارسات توحيد الرموز (الشيفرة) التي يجب اعتمادها» لمزيد من التفاصيل. في حالة تسليم المقالات، يُرجى الانتباه إلى وجوب تسجيل الرمز (الشيفرة) بمعرف ثابت يعكس الرمز المستخدم عند تسليم المقال بواسطةZenodo. نشجع المستخدمين الخارجيين لبيانات برنامج GP2، ممّن لم يحصلوا على تمويل من البرنامج على مشاركة هذه النتائج على منصات إلكترونية للبيانات متاحة للعموم أيضًا، وذلك لتعزيز المشاركة المفتوحة للنتائج والرموز (الشيفرة).

المراجعة الإدارية

يجب أن يتم إرسال كافة المخطوطات، ما قبل الطباعة، والملخصات/الملصقات التي تستخدم بيانات برنامج GP2 إلى البرنامج لغايات المراجعة الإدارية قبل تسليمها لأي مجلة، أو قاعدة بيانات عامة، أو مؤتمر. وسيقوم برنامج GP2 بالرد على كافة الطلبات خلال أسبوعين. يُرجى الانتباه إلى أنه يجب تحميل نسخ ما قبل النشر من المقالات عند تسليمها لأي مجلة (أو حتى قبل ذلك). فيما يلي عنوان البريد الإلكتروني لإرسال أي مخطوطة أو ملخص/ملصق للجنة التوجيهية لبرنامج GP2 :[email protected].

الشكر والتقدير

يجب أن تشير كل المخطوطات التي تحتوي على يافطة أسماء المؤلفين في برنامج GP2 أو تلك التي استفادت من دعم البرنامج (سواء كانت تحتوي على يافطة أسماء المؤلفين أم لا) إلى مبادرة «أساب» وبرنامج GP2 بالصيغة التالية: «حظي هذا المشروع بالدعم في إطار البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 (https://gp2.org)، وهو برنامج بحثي تابع لمبادرة «تسخير العلم من أجل داء باركنسون (أساب)» (https://ror.org/03zj4c476). يتولى ائتلاف تسخير العلم إدارة مبادرة «أساب» (https://ror.org/00rf4ez40). وتلعب مؤسسة مايكل ج. فوكس لأبحاث داء باركنسون (https://ror.org/03arq3225) دور الشريك المُموِّل والإستراتيجي». وعند استخدام بيانات برنامج GP2 و/أو شيفرته بشكلٍ صريح، يجب إضافة العبارات التالية: توفر البيانات«تم الحصول على البيانات المستخدمة في إعداد هذا المقال من البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون (GP2; https://gp2.org). وقد استخدمنا (المستوى الأول/الثاني، اختاروا واحدًا فقط) من بيانات الدفعة (اذكروا رقم الدفعة) من برنامج GP2 على وجه التحديد ([أدخلوا المُعرّف الرقمي للدفعة على منصة ZENODO]). يمكن التقدم بطلب الحصول على بيانات برنامج GP2 من خلال AMP PD (https://amp-pd.org). [قواعد بيانات أخرى]” توفر الشيفرة“إن جميع الشيفرات التي تم إنشاؤها لهذا المقال، بالإضافة إلى المعرّفات الخاصة بجميع البرامج والحزم البرمجية المستخدمة، متوفرة على منصة (GitHub) [أدخل رابط منصة GitHub]، وقد تم منحها مُعرّفًا رقميًا ثابتًا عبر منصة (Zenodo) [أدخلوا المُعرّف الرقمي الثابت على منصة ZENODO].”

التأليف

يمكن للباحثين استخدام بيانات برنامج GP2 لأي مشاريع/تحليل ذات أهمية، وتمتثل لاتفاقية استخدام بيانات برنامج GP2. سوف يكون هناك ثلاثة أنواع من منشورات برنامج GP2:

أوراق تركز على برنامج GP2، ويقودها الائتلاف

1) بالنسبة للأوراق التي تؤلفها اللجنة التوجيهية أو فرق العمل والتي تستند بشكل رئيس إلى مجموعة البيانات التعاونية لبرنامج GP2، سيكون كل أعضاء برنامج GP2 مؤلفين مشاركين وسوف يرد اسم الائتلاف (البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2) بعد كبار المؤلفين (وفقًا للقواعد التوجيهية للمجلة العلمية المعنية). يجب أن يراجع الورقة كافة المؤلفين الذين ترد أسماؤهم فيها، ويعلقوا عليها ويوافقوا على تقديمها قبل تسليمها للنشر. يمكن للمؤلفين أن يختاروا عدم إدراج أسمائهم في قائمة المؤلفين، وقد يُحذف اسم أي من المؤلفين المشاركين من القائمة ويُنقل إلى قائمة الشكر والتقدير، وذلك في حال لم يردوا على طلب التعليق على المخطوطة أو يقوموا بتوفير المعلومات المطلوبة من المجلة العلمية خلال أسبوعين.

الأوراق التي تستخدم بيانات GP2 بشكل ثانوي

2) بالنسبة للتحليل الذي يستخدم بيانات النموذج الوراثي من قاعدة بيانات GP2 بشكل ثانوي (مثلًا لتكرار النتائج من بيانات من خارج الائتلاف أو مخطوطة تركز على الجين الوراثي/الموقع الوراثي)، يتم تسمية أعضاء التحليل الأولي ومجموعات الكتابة كمؤلفين. يتم وضع أسماء كل الأشخاص الآخرين في قائمة تحت اسم الائتلاف، والذي سوف يرد في قائمة المؤلفين بين اسم المؤلف الأول والأخير. سوف تظهر أسماء المؤلفين في القائمة تحت اسم الائتلاف في البحث على PubMed بعد معالجة الأسماء من قبل PubMed. يجب أن يقوم كافة المؤلفين الذين وردت أسماؤهم إما في الحاشية أو في قائمة المؤلفين بمراجعة الورقة، والتعليق عليها والموافقة على تقديمها قبل تسليمها للنشر. يمكن للمؤلفين أن يختاروا عدم إدراج أسمائهم في قائمة المؤلفين، وقد يُحذف اسم أي من المؤلفين المشاركين من القائمة ويُنقل إلى قائمة الشكر والتقدير في حال لم يردوا على طلب التعليق على المخطوطة أو يقوموا بتوفير المعلومات المطلوبة من المجلة العلمية خلال أسبوعين.

الأوراق الخارجية

3) يُسمح بعدم ذكر اسم الائتلاف على قائمة المؤلفين في المنشورات التي يؤلفها أفراد من خارج الائتلاف. لن يتم إدراج أسماء أعضاء الائتلاف في PubMed فيما يخص هذه المنشورات. بالنسبة لقسم الشكر والتقدير أعلاه، يجب أن تتضمن كل المنشورات التي تستخدم بيانات GP2 شكر وتقدير لـ «أساب» وبرنامج GP2.

أوضاع غير اعتيادية

نتوقع أن تغطي السياسات المذكورة أعلاه أغلبية المستخدمين لبيانات برنامج GP2. كما يتوقع البرنامج أن يتبع الباحثون هذه التعليمات بنوايا حسنة، وأن تكون أغلب الدراسات عالية الجودة. بيد أن البرنامج العالمي GP2 يتوقع أيضاً إمكانية حدوث أوضاع غير اعتيادية.

مخطوطات رديئة جدًا

إذا تبين بعد قيام اللجنة التوجيهية للبرنامج العالمي GP2 بمراجعة مخطوط معين بأنه رديء جداً من حيث اللغة، أو الفرضية العلمية، أو أساليب التحليل، أو الكتابة، أو الوضوح، يمكن أن توصي اللجنة التوجيهية للمؤلفين بعدم تسليمه إلا بعد مراجعته بشكل متعمق. وإذا اختار المؤلفون تسليم المخطوطة بغض النظر عن التوصية، يكون أمام اللجنة التوجيهية ثلاثة خيارات: 1) طلب حجب الإشارة إليها في قائمة المؤلفين، 2) الطلب من المؤلفين نشر بيان يقول بأنه، ومع أن هذا البحث استخدم بيانات GP2، إلا أن البرنامج لم يجد أن هذه المخطوطة تستحق التسليم للنشر، أو 3) رفض السماح لهم باستخدام بيانات GP2 في المستقبل.

الإخلال باتفاقية البرنامج العالمي GP2 لاستخدام البيانات

إذا قام المستخدمون بالإخلال باتفاقية برنامج GP2 لاستخدام البيانات بشكلٍ غير مقصود، فمن المرجح أن يعملوا على تصحيح هذا الخلل تلقائياً فور اكتشافه. أما إذا قام المستخدمون بانتهاك هذه الاتفاقيات بشكلٍ مقصود، فإن العقوبة الوحيدة المتاحة لدى GP2 هي سحب التصريح المُعطى لهم للوصول إلى بيانات GP2.

الالتزام بقواعد المؤتمرات

يجب أن يشهد المؤلفون بأن الأعمال والمواد المقدمة في الاجتماعات والفعاليات، والتي تعرض عملهم/عمل مجموعتهم، هي من تأليفهم. كما يتعهد المؤلفون بذكر أعمال ومواد المؤلفين الآخرين/المجموعات الأخرى، بما في ذلك برنامج GP2، وعزوها لهم والاستشهاد بها وفقًا لمدونة أخلاقيات المؤتمر و/أو المهنة.

الاستخدام الاحتيالي للبيانات

قد تتيح سياسة النفاذ المفتوح، التي تتطلب التسجيل الإلكتروني فقط للأفراد، إمكانية استخدام البيانات بصفة احتيالية. إذا اكتشفت اللجنة التوجيهية محاولة نشر باستخدام بيانات GP2 تم الحصول عليها بشكل احتيالي، فستتم معاقبة المستخدم من خلال تواصل اللجنة التوجيهية مع الباحث أو المشرفين عليه، و/أو الأشخاص/اللجان المسؤولة عن الإشراف، و/أو الهيئات المسؤولة. فور تناهي هذا الخرق لاتفاقية استخدام البيانات إلى علم اللجنة التوجيهية، سيتم اتخاذ خطوات فورية لتصحيح هذا الخرق ووضع حد له. قد يشمل ذلك وقف تصريح دخول ذلك المستخدم إلى البيانات، و/أو رفع تقرير بهذا الخرق إلى الفرد/المؤسسة المعنية. تحتفظ مؤسسة مايكل ج. فوكس، و«أساب» واللجنة التوجيهية لبرنامج GP2 بحق تعديل شروط هذه الاتفاقية، ويمكن أن يقوموا بذلك من خلال نشر إعلان بهذه التعديلات على هذه الصفحة. تصبح هذه التعديلات نافذة فور نشرها (إلا في حال ورد خلاف ذلك). ينبغي لكم زيارة هذه الصفحة بشكلٍ دوري لمراجعة شروط الاستخدام.

 

تحميل