Hackathons sind temporeiche Events, bei denen die Teilnehmenden in Teams zusammenarbeiten, um innovative Lösungen für bestimmte Herausforderungen oder Probleme zu entwickeln. Diese Veranstaltungen erfreuen sich in der wissenschaftlichen Gemeinde zunehmender Beliebtheit, da sie Networking-Gelegenheiten bieten und den Erwerb von Kenntnissen über verschiedene Analysetechniken erleichtern. Hackathons haben sich auch für die Gemeinschaft des Global Parkinson’s Genetics Program (GP2) als äußerst effektiv erwiesen. Sie bringen GP2-Mitglieder aus der ganzen Welt zusammen, die so gemeinsam an Herausforderungen im Zusammenhang mit der Parkinson-Krankheit arbeiten und das vielfältige Fachwissen innerhalb der Initiative nutzen. Ein Beispiel dafür war der IPDGC/GP2 Virtual Hackathon 2021, bei dem die verschiedenen Teams Datenanalysetools und -ressourcen speziell für die Parkinson-Forschung entwickelten.
Am Ende des GP2-Jahrestreffens der Forscher im August 2023 in Kopenhagen nahmen 32 GP2-Auszubildende und -Organisatoren einen Zug nach Malmö, Schweden, wo sie die nächsten zwei Tage damit verbringen würden, verschiedene Projekte zur Genetik der Parkinson-Krankheit in Angriff zu nehmen. Weitere 16 Teilnehmende waren virtuell aus aller Welt zugeschaltet. Insgesamt waren 48 Personen aus 23 verschiedenen Ländern dabei.
Die Teilnehmer wurden je nach Interesse, Fachwissen und Zeitzone in acht Teams aufgeteilt : fünf Teams vor Ort und drei Teams, die virtuell teilgenommen haben. Jedes Projekt war so konzipiert, dass es mit den derzeit verfügbaren GP2-Daten zu Analyseergebnissen führte. Jedes Projekt wurde auf Terra durchgeführt, was die Lernmöglichkeiten für die Interaktion mit und direkte Analysen auf der Plattform bot, auf der sowohl die GP2-Daten als auch die Daten der Accelerating Medicines Partnership in Parkinson’s Disease (AMP PD) gespeichert sind. Die acht Projekte wurden zuvor von der GP2-Arbeitsgruppe für Projektvorschläge genehmigt und lauteten wie folgt:
- Bewertung einzelner Gene (ABCB1)
- Bewertung einzelner Gene (COMT)
- Screening von GBA1-Varianten in verschiedenen Abstammungsgruppen mit WGS-Daten
- Träger*innen von pathogenen Parkinson-Varianten
- Bewertung einzelner Gene (DNAJC13)
- Haplotyp-Analyse (MAPT)
- scRNA-seq-Analyse
- Homozygotie-Läufe (Runs of Homozygosity, ROH)
Während der zweitägigen Veranstaltung lernten sich die Teams kennen und arbeiteten zusammen, um die Daten und den Code vorzubereiten, die sie für jedes Projekt benötigten. Am Ende jedes Tages berichteten alle Teams kurz über die Fortschritte und mögliche Herausforderungen, auf die sie gestoßen waren. Obwohl zwei Tage nicht ausreichen, um ein ganzes Analyseprojekt abzuschließen, hat jedes Team in der kurzen Zeit signifikante Fortschritte gemacht. Der GP2-Hackathon 2023 ist inzwischen abgeschlossen, aber die Teams werden auch in Zukunft an ihren Projekten weiterarbeiten und die Ergebnisse in Form von Kurzberichten, Leserbriefen oder anderen für ihre Erkenntnisse geeigneten Formaten veröffentlichen.
Für die Zukunft sind weitere Hackathons geplant, als Präsenz- und als virtuelle Veranstaltungen. Halten Sie Ausschau nach weiteren Events dieser Art. Vielleicht können auch Sie dabei sein!
