基于研究方法 I 所学知识,本课程深入研究实验室 DNA 提取方案、如何量化和运送 DNA,然后回顾 DNA 质量控制方法以及牛津纳米孔的文库制备和测序,最后介绍 GP2 使用 REDCap 进行临床数据收集和存储的最佳实践。
模块:
- DNA 提取和定量
- DNA 质量:纯化、Femto Pulse系统和Tapestation系统
- 牛津纳米孔文库制备和测序
- 使用 REDCap 收集和存储 GP2 临床数据的最佳实践
模块
在第一个模块中,您将了解从不同样本类型中提取 DNA 的实验室协议、如何量化 DNA、如何运送 DNA 样本以及处理 DNA 时的一些标准实验室程序。
第二个模块将引导您了解长读测序和高分子 DNA,然后提供有关高分子量 DNA 提取和质量控制方法的信息以及上述质量控制的技巧。最后,本模块将简要介绍一些 DNA 存储建议,以帮助保持 DNA 质量。
该模块将引导您完成牛津纳米孔的长读测序准备和测序。它还将涵盖可在您的数据上实施的碱基调用选项和由 CARD 联盟生成的数据分析工作流程。
课程的最后一个模块将向您介绍 REDCap 平台以及如何使用它来收集、组织和管理 GP2 临床数据。