Basándose en los aprendizajes de Métodos de investigación I, este curso profundiza en los protocolos de extracción de ADN de laboratorio, cómo cuantificar y enviar ADN antes de revisar los métodos de control de calidad del ADN y la preparación y secuenciación de la biblioteca de Oxford Nanopore antes de concluir con una mirada a las mejores prácticas de GP2 para la recopilación y almacenamiento de datos clínicos utilizando REDCap.
Módulos:
- Extracción y cuantificación del ADN
- Calidad del ADN: purificación, Femto Pulse y TapeStation
- Preparación de biblioteca y secuenciación por nanoporos Oxford
- Mejores prácticas del GP2 para la recogida y el almacenaje de datos clínicos con REDCap
Módulos
En este primer módulo, aprenderá sobre los protocolos de extracción de ADN de laboratorio de diferentes tipos de muestras, cómo cuantificar el ADN, cómo enviar muestras de ADN, así como algunos procedimientos de laboratorio estándar al manipular ADN.
Este segundo módulo lo guiará a través de una introducción a la secuenciación de lectura larga y al ADN de alto peso molecular, seguido de información sobre extracciones de ADN de alto peso molecular y métodos de control de calidad, así como consejos para dicho control de calidad. Por último, este módulo cubrirá brevemente algunas sugerencias de almacenamiento de ADN para ayudar a preservar la calidad del ADN.
Este módulo lo guiará a través de la preparación de la secuenciación de lectura larga y la secuenciación para Oxford Nanopore. También cubrirá opciones de basecalling y un flujo de trabajo de análisis de datos generado por el consorcio CARD que se puede implementar en sus datos.
El último módulo del curso le presentará la plataforma REDCap y cómo puede utilizarla para la recopilación, organización y gestión de datos clínicos de GP2.
