このコースでは、研究方法 I の学習内容を基に、実験室の DNA 抽出プロトコル、DNA の定量化と出荷方法について詳しく説明した後、DNA 品質管理方法とライブラリの準備および Oxford Nanopore の配列決定について確認し、最後に REDCap を使用した臨床データの収集と保存に関する GP2 のベスト プラクティスについて説明します。
モジュール:
- DNA抽出と定量化
- DNAの質：純化、フェムトパルスとテープステーション
- ライブラリの準備とオックスフォードナノポアのシーケンシング
- REDCapと使用した、GP2臨床データ収集とストレージのベストプラクティス
モジュール
この最初のモジュールでは、さまざまなサンプル タイプからの実験室 DNA 抽出プロトコル、DNA の定量化方法、DNA サンプルの発送方法、および DNA を取り扱う際の標準的な実験室手順について学習します。
この 2 番目のモジュールでは、ロング リード シーケンスと高分子 DNA の概要を説明し、続いて高分子 DNA 抽出と品質管理方法に関する情報と、品質管理のヒントについて説明します。最後に、このモジュールでは、DNA の品質を維持するための DNA 保存に関する提案について簡単に説明します。
このモジュールでは、Oxford Nanopore のロングリードシーケンスの準備とシーケンスについて説明します。また、CARD コンソーシアムによって生成され、データに実装できるベースコーリング オプションとデータ分析ワークフローについても説明します。
コースの最後のモジュールでは、REDCap プラットフォームと、それを GP2 臨床データの収集、整理、管理にどのように使用できるかを紹介します。
