Maladie complexe - groupe de travail Analyse des données

Notre mission est de réaliser des analyses fondamentales pour identifier la base génétique des formes complexes sur le plan génétique de la maladie de Parkinson.

Le but général est de soutenir la pérennisation, la démocratisation et l’accélération des analyses relatives à l’écosystème d’analyse et d’entreposage de base, au contrôle de la qualité des données, y compris l’effacement des informations protégées en matière de santé, l’harmonisation de l’imputation, les mises à jour régulières des résultats des études d’association pangénomique (GWAS) et du contrôle de la qualité des données, et les prédictions par apprentissage automatique pour tous les résultats pertinents. Nous fournirons également un soutien analytique aux chercheurs dont les projets sont approuvés.

Groupes de travail
Mike A. Nalls, docteur ès sciences
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Mike A. Nalls, docteur ès sciences

Data Tecnica International | Etats-Unis
Hampton Leonard, diplômée en sciences
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Hampton Leonard, diplômée en sciences

Data Technica International / National Institutes of Health | Etats-Unis
Sara Bandres-Ciga, docteur en pharmacie, docteur ès sciences
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Sara Bandres-Ciga, docteur en pharmacie, docteur ès sciences

National Institutes of Health | EUA
Cornelis Blauwendraat, docteur ès sciences
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Cornelis Blauwendraat, docteur ès sciences

National Institutes of Health | Etats-Unis
Jean-Christophe Corvol, docteur en médecine, docteur ès sciences
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Jean-Christophe Corvol, docteur en médecine, docteur ès sciences

Institut du Cerveau | France
Faraz Faghri, docteur ès sciences
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Faraz Faghri, docteur ès sciences

Data Technica International / National Institutes of Health | Etats-Unis
Hirotaka Iwaki, docteur en médecine, docteur ès sciences
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Hirotaka Iwaki, docteur en médecine, docteur ès sciences

Data Technica International / National Institutes of Health | Etats-Unis
Jeff J. Kim, Master
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Jeff J. Kim, Master

National Institutes of Health | EUA
Mathew Koretsky, diplômé en sciences
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Mathew Koretsky, diplômé en sciences

National Institutes of Health | Etats-Unis
Nicole Kuznetsov
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Nicole Kuznetsov

National Institutes of Health | États-Unis
Kristin Levine, master en sciences
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Kristin Levine, master en sciences

Data Tecnica International | Etats-Unis
Mary B. Makarious, diplôme de sciences
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Mary B. Makarious, diplôme de sciences

National Institutes of Health | EUA
Ignacio Fernandez Mata, docteur ès sciences
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Ignacio Fernandez Mata, docteur ès sciences

Clinique de Cleveland | Etats-Unis
Yeajin Song, M.Sc.
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Yeajin Song, M.Sc.

Data Tecnica International | Etats-Unis
Dan Vitale, diplômé en sciences
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Dan Vitale, diplômé en sciences

Data Tecnica International | EUA
Nigel Williams, docteur ès sciences
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Nigel Williams, docteur ès sciences

Cardiff University | Royaume-Uni
Étapes
Bilan actuel
  • Pipeline de CQ automatisée et exécutée à l’échelle dans le nuage
  • Partage des données au niveau des participants au GP2 sur Terra
  • Collaboration avec d’autres groupes de travail ayant permis de partager du code, des résultats et du matériel pédagogique
Autres objectifs à atteindre pour la troisième année
  • Appui aux examens des propositions de projet
  • Amélioration de la qualité de la production de données et ajout de nouveaux types de données
  • GWAS du GP2 intégralement ouvert (open source) et dont les statistiques synthétiques sont consultables

Nous contacter

Pour obtenir le lien vers le site Basecamp et participer à ces travaux, veuillez envoyer un courriel à :[email protected]