El Hackathon 2025 del GP2 fue uno de los elementos de un programa de capacitación del GP2 más amplio, diseñado para fomentar el aprendizaje práctico, la colaboración y la mentoría entre los investigadores emergentes. Del 27 al 29 de agosto de 2025, 16 becarios se reunieron en Lübeck (Alemania) para participar en un dinámico evento de tres días organizado por la profesora Christine Klien en la Universidad de Lübeck.
El Hackathon combinó horas de trabajo intenso en proyectos con los últimos datos del GP2 con actividades interactivas de capacitación y networking. Varios equipos usaron Verily Workbench para acceder a los conjuntos de datos del GP2 y ejecutaron análisis directamente en un entorno basado en la nube.
Los becarios también tuvieron la oportunidad de establecer conexiones y recibir consejos de miembros del equipo directivo del GP2, que estaban presentes en el mismo lugar asistiendo a otra reunión. Estas interacciones suscitaron conversaciones de valor sobre desarrollo profesional, oportunidades de colaboración y formas en que el GP2 puede seguir apoyando a los becarios en el futuro.
Participación global
La cohorte del Hackathon de este año estuvo compuesta por becarios de 13 países y 6 continentes, un inequívoco reflejo del compromiso del GP2 con la investigación inclusiva y de carácter mundial.
- América del Norte: EE. UU.
- África: Sudáfrica, Ghana, Argelia
- América Latina: México, Chile, Brasil
- Asia: Malasia, Armenia
- Europa: Reino Unido, Eslovenia, Ucrania
- Oceanía: Australia
* Participantes del Hackathon 2025, directores de proyecto y miembros del Grupo de Trabajo de Docencia y Desarrollo del GP2
Resumen de los proyectos
Los participantes se dividieron en cuatro grupos, cada uno de ellos dedicado a un proyecto de análisis con el apoyo de un mentor experto.
- Proyecto 1: Dirigido por Lara M. Lange, desarrollo de una herramienta de navegación LRRK2, una interfaz centralizada y fácil de usar para explorar los datos genéticos y funcionales relacionados con el gen LRRK2 y sus variantes en múltiples cohortes con enfermedad de Parkinson.
- Proyecto 2: Dirigido por Mary Makarious, evaluación del puntaje de riesgo poligénico a partir de las estadísticas resumen de meta-GWAS europeos recientes del GP2; comparación de su rendimiento con modelos anteriores.
- Proyecto 3: Dirigido por Hampton Leonard, análisis del enriquecimiento específico de señales genéticas por tipo de célula para identificar qué tipos de células cerebrales presentan vínculos más fuertes con las variantes asociadas a la EP.
- Proyecto 4: Dirigido por Zih-Hua Fang, detección de expansiones repetidas en todo el genoma con ExpansionHunter Denovo, con el objetivo de identificar expansiones repetidas conocidas o nuevas que puedan explicar los loci GWAS sin resolver.
Testimonios
«El Hackathon tuvo un gran impacto en el desarrollo de mis habilidades, especialmente teniendo en cuenta mi trayectoria clínica. Me ayudó a adquirir experiencia en planificación, distribución de tareas y organización de equipos, y también me permitió conocer herramientas bioinformáticas de extracción de datos y análisis de variantes». – Elías Fernández-Toledo, representante de becarios del GP2 de América Latina [Grupo 1 del Hackathon] * De izquierda a derecha: Vesna van Midden, becaria del GP2; Elías Fernandez-Toledo, becario del GP2; Lara Lange, directora del proyecto 1
«La oportunidad de hablar con otros becarios me abrió nuevas perspectivas sobre cómo presentar nuestros hallazgos con eficacia. Al trabajar con Verily Workbench, aprendí a resolver problemas técnicos y a ejecutar scripts de manera más eficiente». – Lucas Faria Costa, representante de becarios del GP2 de América Latina [Grupo 2 del Hackathon] * De izquierda a derecha: Ana Jimena Hernández-Medrano, becaria del GP2; Mariam Isayan, becaria del GP2; Mary Makarious, directora del proyecto 2
«El Hackathon me permitió desarrollar habilidades en genómica funcional para mi trayectoria profesional. ¡Fue muy relevante para mí!» – Alexandra Zirra, representante de becarios del GP2 de Europa [Grupo 3 del Hackathon] * De izquierda a derecha: Solomiia Bandrivska, becaria del GP2; Alexandra Zirra, becaria del GP2; Hampton Leonard, director del proyecto 3; Paula Reyes, becaria del GP2
«Nunca había trabajado con WGS, así que fue un magnífico aprendizaje. Creo que las presentaciones de Mary Makarious y Spencer Grant sobre mejores prácticas de publicación de artículos, así como la introducción sobre conjuntos de datos disponibles al público, fueron muy buenas porque nos brindaron capacitación adicional relevante para los análisis que llevamos a cabo». – Kathryn Step, representante de becarios del GP2 de África [Grupo 4 del Hackathon] * De izquierda a derecha: Yasser Mecheri, becario del GP2; Kathryn Step, becaria del GP2, Zih-Hua Fang, directora del proyecto 4; Carlos Hernández, becario del GP2; Víctor Flores Ocampo, becario del GP2
«La actividad relámpago de networking fue una gran oportunidad para que los becarios se conocieran y rompieran el hielo con los organizadores. Estableció un espacio seguro para el diálogo sobre el futuro de las oportunidades de capacitación del GP2 y nos ayudó a entender cómo podemos aprovechar la oportunidad y seguir ampliando nuestro aprendizaje en el marco de la red de becarios». – Charlotte Andrews, coordinadora del Grupo de Trabajo de Capacitación y Desarrollo del GP2 * Sesión relámpago de networking entre becarios del GP2, directores de proyecto y miembros del equipo directivo del GP2
De cara al futuro
Con esta edición del Hackathon se pusieron en marcha varios proyectos prometedores basados en las publicaciones y conjuntos de datos recientes del GP2. Ahora que los análisis siguen su curso, las colaboraciones que se iniciaron en Lübeck seguirán desarrollándose durante los próximos meses.
Tenemos previsto organizar más hackathones en un futuro cercano. Si desea participar en uno u obtener más información, ¡no dude en ponerse en contacto con nosotros!
* Programa de Capacitación 2025 del GP2: becarios del GP2, directores de proyecto del Hackathon, miembros del Grupo de Trabajo de Capacitación y Desarrollo, miembros del equipo directivo del GP2 * Todas las fotografías son de Christoph Westenberger, miembro de la Red monogénica del GP2.
