يعتبر الهاكاثون من الفعاليات سريعة الوتيرة، حيث يعمل المشاركون في فرق لتطوير حلول مبتكرة لتحديات ومشاكل محددة. وقد ازدادت شعبية مثل هذه الفعاليات في أوساط مجتمع العلماء، لكونها توفر فرصاً للتشبيك وتطوير المهارات في تقنيات التحليل المختلفة. لقد أثبتت دورات الهاكاثون المختلفة فعاليتها في أوساط البرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2، حيث تجمع أعضاء البرنامج من حول العالم بهدف التعاون من أجل التغلب على التحديات المرتبطة بداء باركنسون والاستفادة من الخبرات المتنوعة في إطار هذه المبادرة. ومن بين الأمثلة على ذلك هاكاثون عام 2021 الخاص بالبرنامج العالمي حول الجينات المرتبطة بداء باركنسون GP2 والتحالف العالمي حول علم جينوم داء باركنسون IPDGC، والذي عُقِد عن بُعد، حيث قامت الفرق المختلفة بتطوير أدوات لتحليل البيانات وموارد مُصمَّمة خصيصاً لـأبحاث داء باركنسون خلال فترة انعقاده.
وفي نهاية آب/ أغسطس 2023، استقل 32 شخصاً من المنظمين والمتدربين في برنامج GP2 من المشاركين في اللقاء السنوي للباحثين في كوبنهاغن قطاراً متوجهاً إلى مالمو في السويد، حيث انخرطوا على مدار يومين في مشاريع مختلفة تركز على علم جينات داء باركنسون. كما انضم إليهم 16 مشاركاً إضافياً عبر الإنترنت من حول العالم. هكذا انضم إلينا ما مجموعه 48 مشاركاً من 23 دولة مختلفة.
وتم تقسيم المشاركين إلى ثمانية فرق وفقاً لاهتماماتهم ومستوى خبراتهم وومنطقتهم الزمنية: تم تشكيل خمسة فرق من المتواجدين شخصياً في اللقاء وثلاثة فرق من المشاركين عن بُعد. تم تصميم كل مشروع بطريقة تضمن أن ينتج التحاليل باستخدام البيانات المتاحة حالياً في إطار برنامج GP2. تم تنفيذ كل مشروع على منصة تيرا، ما خلق فرصاً لتعلم كيفية التفاعل مع التحاليل وتنفيذها مباشرة على المنصة التي تحتوي على بيانات برنامج GP2 والشراكة من أجل تسريع إنتاج الأدوية لداء باركنسون AMP PD. وتمت الموافقة على المشاريع الثمانية مسبقاً من قبل مجموعة عمل GP2 لكتابة مقترحات المشاريع وهي كالتالي:
- تقييم الجين المنفرد (ABCB1)
- تقييم الجين المنفرد (COMT)
- تقصي متغيرات GBA1 عبر كل السلالات في بيانات تسلسل الجينوم الكامل WGS.
- حاملو المتغيرات الممرضة المسببة لداء باركنسون.
- تقييم الجين المنفرد (DNAJC13)
- تحليل النمط الفرداني (MAPT)
- تحليل تسلسل الخلية الواحدة للحمض النووي الريبوزي (الرنا)
- تجارب في تجانس اللواقح
تعرف أعضاء الفرق على بعضهم البعض على مدار يومين، وعملوا سوياً لإعداد البيانات والشيفرات التي يحتاجون إليها لكل مشروع. وكان كل فريق يقدم ملخصاً في نهاية كل يوم عن التقدم المحرز وأي تحديات واجهتهم. على الرغم من أن اليومين لم يكونا كافيين للانتهاء من عملية التحليل، إلا أن كل فريق قد حقق تقدماً كبيراً في هذا الوقت القصير. انتهى هاكاثون GP2 لعام 2023، ولكن الفرق استمرت بالعمل على مشاريعها على أمل نشر النتائج على شكل تقارير مختصرة، أو رسائل للمحرر، أو أي شكل ملائم للنتائج التي سيتوصلون إليها.
نخطط أن نستضيف في المستقبل المزيد من فعاليات الهاكاثون الوجاهية والتي تُعقد عن بعد. انتظروا المزيد من الفعاليات المشابهة وتعرفوا على كيفية المشاركة!
