オープンアクセスポリシー

ASAPでは、すべての出版が次の事項に従う必要があります：

• 即時無料アクセス：論文審査が済み、著者が承認した研究は、公開後すぐに制限期間なし（ゼロ制限期間）で自由に利用可能にする必要があります。
• 無制限の再利用権限：論文は、クリエイティブ・コモンズ表示ライセンスCC-BY 4.0、または属性を必要としないCC0ライセンス、またはそれと同等のライセンスで公開する必要があります。どちらのライセンスでも制限なく内容を再利用することができます。

複数の機関が資金提供する研究費の他の資金提供者がポリシー遵守に関して懸念を示す場合、ASAPはその懸念の内容を理解するために他の資金提供者と話し合いを行います。話し合いを進めたい方は[email protected] までご連絡ください。オープンアクセスポリシーへの遵守は監視されます。ポリシー違反が発生した場合は、出版前にお問い合わせ下さい。以下は、私たちの要件に準拠する方法の詳細です。

即時、無料アクセスを確保するには？

このガイダンスは、お客様オリジナルの研究出版物への即時、無料アクセスおよび無制限の利用という私たちの要件に準拠しながら、任意の学術誌で出版できるように作られています。

• ルート 1 (推奨)：ゴールドまたはハイブリッド学術誌で出版。学術論文の最終稿 (保存稿 [VoR]) の即時OAが提供され、CC BY または同等のライセンスを受け入れます。ほとんどのゴールドおよびハイブリッド学術誌は、CC BYライセンスを受け入れています。そうでない場合は、ルート2に従う必要があります。
  • ゴールド学術誌は、すべての論文に即時OAを提供します。
  • ハイブリッド学術誌では、一部の論文には追加料金で OA が提供されますが、すべての論文が自由にアクセスできるわけではありません。
• ルート2 (推奨されない)：サブスクリプション専用学術誌で出版。CC BYライセンス下でPubmed Centralで著者承認された原稿 (AAM；学術誌で承認された査読に続く原稿) をデポジットします。このオプション（「グリーン」オプションと呼ばれる）では、雑誌のVoR（最終的な引用可能出版物）の出版時にすぐに AAM が公開される必要があります。ハイブリッド学術誌には CC BY ライセンスを受け付けない場合もあることに注意してください。その場合、このルートに従う必要があります。AAM では、整理編集、更新や修正が論文に反映されないため、ルート 2 は望ましくありません。ただし、正規版を読んだり引用したい場合は、AAM を VoR にリンクすることができます。 このルートを検討している場合は、[email protected]にメールして、ルート1が不可能な理由について話し合ってください。

なお、資金面での考慮事項として、学術誌や出版社のタイトルや学術誌インパクトファクター（JIF）ではなく、論文の本質的なメリットを考慮します。これは、ASAPが署名している「研究評価に関するサンフランシスコ宣言 (DORA) に沿ったものです。

ASAPサポート：妥当な記事処理料金 (APC)の範囲

コンプライアンスを支援するため、ASAPはオープンアクセス研究論文やレビューのために妥当な記事処理料金 (APC) を支払います。ASAPは、私たちの実行パートナーであるマイケル・J・フォックス財団（MJFF）と協力し、APCに該当する場合はカバーします。応募するには被授与者がオンラインフォームに記入してください。  リクエストが受領されると、ASAPチームからMJFFを通じて受領確認メールが届きます。ASAPチームは3-4営業日以内にリクエストを確認し、リクエストに関する決定をメールで通知します。審査を円滑に行うために必要な追加情報が要求されることもあります。返信時間や提供される追加情報の内容によって、審査にかかる時間が延長される場合もあります。リクエストに対して肯定的な判断が届いた場合、出版者からASAPチームに通知を転送し、最終編集の承認時に支払いが必要である旨を伝えます。これには、支払い請求用のリンクが含まれる場合もあります。その後、出版者からMJFFへ支払い請求プロセスを開始し、直接支払いの手続きをすることができます。最後のステップでは、出版者から受け取った支払いの確認コピーをお送りします。

無制限の利用権限に対して適切なCCライセンスを確保するには？

出版物については、オリジナルの研究を報告する審査学術誌への提出から生じるすべての著者承認された原稿（AAM）に対して、クリエイティブ・コモンズ（CC）帰属ライセンスまたは公共ドメインライセンスを適用する必要があります。以下は、ASAP のオープンアクセス要件に準拠しているライセンスの種類です。

• CC BY 4.0はすべての研究論文にデフォルトで必要なライセンスです。 ライセンスは、あなたが著作物の帰属（知的所有権）を受けることを保証しますが、研究を自由に共有（任意の媒体または形式で再配布したり、将来の目的に適応）することができます。
• CC0 ライセンスは、政府機関所属の著者、または公共ドメインの他のコンテンツに適用されます。このライセンスでは、帰属は必要ありません。
• CC BY-ND は例外的な事例に適用できます。CC BY-NDライセンスでは、オリジナルコンテンツの派生物は許可されません（コンテンツ変更なし等）。このような場合、例外の理由を説明するために、出版承諾前に[email protected]にメールを送ってください。ご要望は事例ごとに検討します。

まれに、ライセンス要件および即時オンラインアクセス要件に関して出版者との間で意見が一致しない場合は、ASAP[email protected]までご連絡ください。適切なライセンスを確保するため、次のことを行ってください：

• 提出する原稿の謝辞セクション（プレプリントサーバーと出版者の両方）に、あなたの提出物が CC BY 公共著作権ライセンス（または CC0、必要に応じて CC BY-ND）を持っているという文言を含めます。必要な文言については、要件4の「謝辞」を参照してください。
• 学術誌に CC BY（または CC0、CC BY-ND）ライセンスを公開済みVoR（学術誌が公開する記録の最終版）に含めるかどうかを決定します。学術誌は通常、論文のライセンス条項を権利と許可、または著作権タブにリストします。この情報が見つからない場合は、発行者にメールを送信することもできます。
  • 学術誌に適切なライセンスがあり、その論文がオープンアクセス学術誌 (ゴールドまたはハイブリッド) で公開されている場合は、何もする必要はありません。学術誌は、出版時に論文をPubMedセントラル（PMC）またはヨーロッパPMCに提出します。
  • 学術誌に適切なライセンスがない、または学術誌がサブスクリプション専用の場合は、AAM を PubMed Central に送信し、VoR の発行と同時に表示されるようにします。

プレプリントは、正式な査読が行われていない原稿の完成稿ですが、学術誌への提出時、またはそれ以前に公開プレプリントサーバー (bioRxiv や medRXiv など) に提出する必要があります。プレプリント原稿は公開用に提出するバージョンと同一で、研究成果にリンクし、ここで説明された通りCCライセンスを付与されていなければなりません。

査読済み論文の出版時には、プレプリントはその論文にリンクする必要があります。 これは通常、殆どの学術誌で最終出版物が出た時に記事のタイトルが同じであればbioRxivまたはmedRxivが自動的に行います。  オープンアクセスオプションを持たないサブスクリプション学術誌で出版した場合、プレプリントは、PubMed Central に投稿された CC BY または同等のライセンスを持つ著者が承認した原稿にリンクします。

ASAPのオープンアクセスポリシーでは、プレプリントや出版原稿へのオープンアクセスを確保することに加え、資金提供を受けた研究者が研究データと基礎となる研究結果のコードの可用性を最大化することが求められています。

少なくとも、研究論文の根拠となるデータは、プレプリントおよび原稿の提出時点でコミュニティリポジトリの他の研究者が利用できる状態でなければなりません。また、データセットの表示や分析の複製に必要なオリジナルソフトウェアもすべて利用できるようにする必要があります。

根拠となるデータには、すべてのプライマリデータ、関連メタデータ（保護健康情報[PHI]、あるいは電子版健康情報[ePHI]は含まない）、また報告された調査結果を理解、評価、再現するために必要なその他すべての関連データが含まれます。データには、使用されるソフトウェア、データセット、プロトコル、ツール、試薬が含まれる場合があります。これは、他のユーザーが新しい方法でデータを検証、再現、再利用できるようにするために重要です。さらに、データとコードを慎重に記録・管理することで、将来問い合わせがあった場合に由来や保管情報を提供することができます。

これらのポリシーは、複数の出版者が要求しているデータ利用可能性ポリシーを含む、既存の業界ベストプラクティスに沿ったものです。

ASAPは2016年にScientific Dataに出版されたFAIR科学的データの管理とスチュワードシップのガイド原則に賛同します。これらのガイドラインはデジタルアセットの見つけやすさ、アクセス、相互運用性、そして再利用性を向上させるためのものです。

ASAPポリシーとFAIR原則の主な要件は以下の通りです：

1. 全ての関連データセットファイルは、適切なメタデータで表記される。
2. 全てのデータセットは、コアメタデータに含まれるグローバルに固有で一貫した識別子を持つ。
3. 一貫した識別子と適切なメタデータは信頼でき検索可能なリソース内に登録またはインデックス化される。
4. ASAP謝辞が確実にレポジトリ記録に含まれるようにする。

根拠となるデータとソフトウェアに対するリポジトリの選択

ASAPは、資金提供されたすべての研究が堆積される優先データリポジトリのリストを提供し、チームと協力して適切なプラットフォームを特定します。選択したデータリポジトリは、次の事項に従う必要があります：

• プレプリントと学術誌への原稿提出時に、研究の根拠となるデータへの即時オープンアクセスが可能であること；
• クリエイティブ・コモンズ属性 4.0 ライセンス (CC-BY 4.0) と同等もしくは制限の緩いライセンスで再利用を許可する；
• リンクや引用を容易にするために、DOI（デジタルオブジェクト識別子）など永続的で独自の識別子を使用してデータセットを割り当てる；
• ISOの信頼できるデジタルリポジトリ基準を満たすものなど、長期間の保管と保存ができる。

推奨リポジトリに関するご質問は、 [email protected]または[email protected]までメールでお問い合わせください。

プロトコル、ラボリソース、ソフトウェア用リポジトリ

プロトコル： ASAP資金による研究で採用している実験的プロトコルは、protocols.ioなどのプロトコル共有サービスを通じて一般に公開（必要に応じて更新）する必要があります。ASAPは、protocols.ioプラットフォームを使用する際、資金被授与者をサポートします。科学的手法を共有・議論することは、信頼性と再現性のある実験研究を達成するために不可欠です。

ソフトウェア： アルゴリズム、スクリプト、その他のコードベースの研究成果を含むソフトウェアはGitHub にようなコードリポジトリを通して利用可能であり、DOIをアサインされていなければなりません。コードリポジトリを通してDOIをアサインするのが難しい、または不可能な場合は、Zenodoを使って他の場所でホストされているコードにDOIをアサインすることができます。

ラボリソース： ASAPの資金提供を受けたツールおよび試薬、ASAP資金提供プロジェクトの結果であるツールまたは試薬は、再現性を支援し、さらなる研究を可能にする手段として、コミュニティが容易に利用できなければなりません。推奨リポジトリに関するご質問は、[email protected]までメールにてお問い合わせください。ラボリソースツールの引用サポートについては複数のリポジトリの情報を集め、出版物の引用識別子を提供するリソース識別ポータルをご覧ください。この要件は、細胞株、トランスジェニックモデル、プラスミド/クローン、抗体、その他の試薬に適用されます。

ASAPから一部または完全にサポートされている全出版物で、資金提供の間、または資金提供期間終了後のものは、GP2の研究であることを示さなければなりません。

謝辞

出版物の謝辞セクションには、次の文言を含んでください：

「この記事で使用されたデータは、Global Parkinson’s Genetics Program (GP2) から取得されました。GP2は、Aligning Science Against Parkinson’s (ASAP）イニシアチブより資金を受け、パーキンソン病研究のマイケル・J・フォックス財団によって実施されています (https://gp2.org）。GP2の完全なメンバーリストはこちらhttps://gp2.org」

著作

研究者は、GP2データ使用契約に準拠しているプロジェクト・分析のためにGP2データを使用できます。GP2の出版物には次の3種類があります：

コンソーシアム主導、GP2に焦点を当てた論文

1. GP2運営委員会またはワーキンググループが、主にGP2共同データセットに基づいて著作した論文は、すべてのGP2メンバーが共著者となり、コンソーシアム名（Global Parkinson’s Genetics Program (GP2)コンソーシアム）が上級著作者（学術誌ガイドラインに応じて）のあとに記載されます。名前の掲載される全ての著作者が、提出前に論文を読み、コメントし、提出に同意してください。著作者は、著作者リストに名前を掲載しないことも選択できます。また文書へのコメントや学術誌からの情報提供リクエストに2週間以内に回答しない共著者は、謝辞に含まれるリストから名前が削除されます。

GP2データを二次的に組み込んだ論文

1. GP2データベースからの個々の遺伝子型データが二次的な方法で使用された分析（例えば、非コンソーシアムデータまたは遺伝子・遺伝子座に焦点を当てた論文からの結果を複製するため等）の場合、一次分析および執筆に関与したメンバーが著作者と呼ばれます。その他の全研究者はコンソーシアム名でリストに掲載され、著作者リストに最初と最後の著作者の間に含まれています。コンソーシアム名の下にリストされている著作者は、PubMedによって完全に処理された後に、PubMedに表示され、検索可能になります。全ての記載されている、または脚注の著作者は、提出前に論文に目を通し、コメントをし、提出に同意するべきです。著作者は、自ら著作者リストに掲載されないことを選択できます。また、原稿へのコメントのリクエストに2週間以内に応答しない共著者もリストに名前が記載されない選択をすることになります。

外部論文

1. コンソーシアム以外のメンバーによって書かれた出版物には著作者名の行にコンソーシアムの名前が表示されない場合があります。これらの出版物については、コンソーシアムのメンバーもPubMedの中に記載されません。

特例

前述のポリシーは、GP2データのユーザーの大多数をカバーすることが期待されます。GP2は、研究員がこれらのガイドラインに誠意を持って従い、分析の殆どが高品質なものであることを期待しています。ただし、GP2は特例の可能性も予測しています。

極度に不十分な文書

GP2運営委員会による提出文書の審査において、言語、科学的質問、分析方法、執筆、または明快さの観点から極度に不十分であることが明らかになった場合、GP2運営委員会は著作者に対し、大幅な改訂なしでは提出しないことを推奨できます。推奨に反して著作者が文書の提出を選択した場合、GP2運営委員会には3つの選択肢があります：1）グループ著作者記載を差し控えるように要求する；2）GP2データが使用されたが、GP2研究では該当文書出版の正当な理由が見つからなかったという声明を著作者に公開するよう要求する；3）今後GP2データを使用する特権を取り消す。

GP2データ使用契約に従わなかった場合

ユーザーが誤ってGP2データ使用契約に違反した場合、違反が発覚次第、ユーザー自身が是正できる可能性があります。ユーザーが故意に契約に違反した場合、GP2の唯一の制裁措置は、GP2データへのアクセスを取り消すことです。

データの不正使用

オンライン登録のみを使用したオープンアクセスは、個人の偽りによりデータアクセスを取得する可能性を高めます。GP2運営委員会が不正に取得したGP2データを使用して公開する試みを発見した場合、ユーザーはGP2運営委員会から研究者または監督者、監督責任者・委員会、または管理当局への連絡を通じて制裁を受けます。GP2運営委員会がデータ使用契約の違反を発見次第、違反を是正するか違反を止めさせるための迅速な措置が取られます。これには、ユーザーのデータアクセスの中止、または関連する個人・組織への違反報告が含まれる場合があります。

マイケル・J・フォックス財団、ASAP、およびGP2運営委員会は、この契約の条件を変更する権利を持ち、変更は本ページに掲載・通知する事により可能です。変更がアップロードされ次第、有効になります（特に明記されている場合は例外）。このページに定期的にアクセスして、現在の使用契約条件を確認してください。