بناءً على الدروس المستفادة من أساليب البحث الأولى، يتعمق هذا المساق في بروتوكولات استخراج الحمض النووي في المختبر، وكيفية تحديد كمية الحمض النووي وشحنه قبل مراجعة طرق مراقبة جودة الحمض النووي وإعداد المكتبة وتسلسل Oxford Nanopore قبل الانتهاء بإلقاء نظرة على أفضل ممارسات GP2 لجمع البيانات السريرية وتخزينها باستخدام REDCap.
الوحدات:
- استخراج الحمض النووي (الدنا) وحساب الكميات
- جودة الحمض النووي (الدنا): التنقية وفحص جودة العينات من خلال Femto pulse and tapestation.
- تهيئة المحتويات والتسلسل من أجل استخدام أوكسفورد نانوبور
- الممارسات الفضلى لجمع البيانات السريرية لبرنامج GP2 وتخزينها باستخدام REDCap
الوحدات النمطية
في هذه الوحدة الأولى، سوف تتعلم عن بروتوكولات استخراج الحمض النووي في المختبر من أنواع مختلفة من العينات، وكيفية تحديد كمية الحمض النووي، وكيفية شحن عينات الحمض النووي بالإضافة إلى بعض الإجراءات المختبرية القياسية عند التعامل مع الحمض النووي.
ستأخذك هذه الوحدة الثانية من خلال مقدمة إلى تسلسل القراءة الطويلة والحمض النووي الجزيئي العالي، تليها معلومات حول استخراج الحمض النووي عالي الوزن الجزيئي وطرق مراقبة الجودة بالإضافة إلى نصائح لمراقبة الجودة المذكورة. وأخيرًا، ستغطي هذه الوحدة بشكل موجز بعض الاقتراحات المتعلقة بتخزين الحمض النووي للمساعدة في الحفاظ على جودة الحمض النووي.
ستأخذك هذه الوحدة عبر عملية تحضير تسلسل القراءة الطويلة والتسلسل لـ Oxford Nanopore. وسوف يتناول أيضًا خيارات الاتصال الأساسي وسير عمل تحليل البيانات الذي تم إنشاؤه بواسطة اتحاد CARD والذي يمكن تنفيذه على بياناتك.
ستقدم لك الوحدة الأخيرة من الدورة تعريفًا بمنصة REDCap وكيفية استخدامها لجمع وتنظيم وإدارة البيانات السريرية GP2.
