Groupe de travail sur la diffusion des données et des codes
Le groupe de travail sur la diffusion des données et du code s'efforce de permettre une science ouverte en partageant des données significatives, du code analytique et des résultats.
About the Groupe de travail sur la diffusion des données et des codes
Notre objectif est de favoriser la science ouverte en partageant des données utiles, des codes d’analyse et des résultats tout en respectant la vie privée des participants, les réglementations et la sécurité des données.
Le GP2 a établi un partenariat avec « Accelerating Medicines Partnership : Maladie de Parkinson (AMP-PD), une plateforme de recherche en génétique de la maladie de Parkinson, pour distribuer les données de la cohorte GP2. Les données du GP2 peuvent être consultées et analysées via AMP-PD.
Vous pouvez visiter GP2 GitHub pour en savoir plus. Pour des outils supplémentaires de génomique et d’apprentissage automatique, visitez GenoML.
Étapes
Complété
- Établir les meilleures pratiques et politiques de codage en utilisant les projets existants comme référence
- Mettre en place des heures d’ouverture régulières pour servir de point de contact pour les commentaires sur les plateformes publiques
Actif
- Engager la communauté GP2 à travers des réunions bimensuelles, en mettant l’accent sur la collaboration avec les groupes URM et monogéniques
- Coordonner les publications de données et de produits de code pour assurer la cohérence
- Réaliser une surveillance du paysage des outils et navigateurs en développement au sein de GP2
- Promouvoir la collaboration sur GitHub et maintenir les normes de codage grâce à un examen collaboratif des pipelines analytiques au sein du réseau de chercheurs GP2
- Établissement de ponts entre les utilisateurs de données GP2 internes et externes
- Organisez et normalisez les ressources, y compris les tutoriels, la documentation et les logiciels
Pas commencé
- Mettre en œuvre des processus de clôture de projet via le groupe de propositions de projet
- Développer un JupyterBook centralisé sur les meilleures pratiques d’utilisation des données et du code DCD