开放取用政策

ASAP开放取用政策指导原则

开放取用（OA）是一套允许研究成果在线免费分发，无成本或其它访问障碍的政策。ASAP旨在创造一个美好未来，即通过开展有意义的协作、提供研究资源并共享数据，帮我们找寻了解、诊断和治疗帕金森病所需要的答案。通过支持开放取用政策，我们推动科学观点的迅速、免费交流，确保我们所资助的研究能够推动未来更多发现。

ASAP开放取用政策的核心内容

ASAP的开放取用政策由以下五大核心内容构成：

  1. 作品一经出版，即可在线免费获取，受赠方通过CC BY 4.0许可协议（或等效许可）保留版权，可无限重复使用作品。
  2. 手稿在提交给期刊审阅之后（或之前），将发布在开放取用预印本存储库中。
  3. 所有的研究成果（数据、协议、代码）都存放在可公开访问的资料库中，并在出版物中加以引用。
  4. 对GP2资助的论文应予以署名

所有在ASAP部分或全部支持下发表的工作必须注明出处，并按照ASAP的开放取用政策发表。只有完全符合我们开放取用政策的受赠方才会在申请后续资助时予以考虑。

ASAP要求所有出版作品遵循以下原则：

  • 即时免费获取：经同行评议、作者认可的研究必须在出版后立即免费提供，不存在任何时滞期（零时滞）。
  • 无限制重复使用权:论文必须在知识共享许可协议（CC-BY 4.0）或CC0协议（无需署名）或等效协议下发表。两种许可均允许对材料进行无限制地重复使用。

如果同一资助金的其他资助者对于遵守ASAP政策心存疑虑，ASAP将与其展开讨论，了解他们的想法。讨论请联系[email protected]受赠方遵守开放取用政策的情况将受到严格监督。因此，我们强烈建议当出现违规情况时，请在文章发表之前与我们商议。以下是关于合规要求的具体内容：

如何确保即时免费获取？

本导则旨在允许在任何选择的期刊上进行发表作品，与此同时又能遵守我们对即刻免费访问和不受限制地使用原始研究出版物的要求。

  • 路径1（推荐路径）：在黄金期刊或混合期刊上发表文章，该期刊提供即时开放取用的最终编辑版本（称“记录版本”[VoR]），并接受CC BY许可或等效许可。大多数黄金期刊和混合期刊也接受CC BY许可。如果不接受，须遵循途径2。大多数黄金期刊和混合期刊也接受CC BY许可。如不接受，须遵循途径2。
    • 黄金期刊为所有文章提供即时开放取用。
    • 混合期刊仅为一些文章提供收费的开放取用，免费访问所有文章是不允许的
  • 路径2（不推荐）：在纯订阅的期刊上发表文章，并根据CC BY许可，将作者认可的稿件（AAM，即经同行评审后被期刊接受的版本）存放在PMC免费生命科学期刊全文数据库里。在该方案中（即“绿色”方案），作者接受的稿件（AAM）必须在期刊发表VoR（最终可引用的出版物）后立即向公众提供。请注意，少数混合型期刊不接受CC BY许可，在这种情况下，您需要采纳这一路径。路线2不推荐，因为AAM并不反映对论文的复制修改、更新或更正。但可将AAM链接到VoR，供那些希望阅读或引用经典版本的用户使用。如您在考虑这一路径，请发电子邮件至[email protected] 和我们讨论不选择路径1的理由。

注：在考量资助事宜时，我们考虑的是作品的内在价值，而不是期刊或出版商的标题或期刊影响因子（JIF）。这与我们签署的《旧金山研究评估宣言》（DORA）相一致。

ASAP支持：支付合理的文章处理费（APCs）

为促进合规，ASAP将为开放存取的研究文章和评论支付合理的文章处理费（APC）ASAP与我们的执行伙伴迈克尔-J-福克斯基金会（MJFF）合作，在适用的情况下支付APC。受赠方可通过填写在线表格，申请支付APC。  提交申请后，您会收到ASAP团队通过MJFF发送的电子邮件，确认收到申请。ASAP团队会在3-4个工作日内审核您的申请，并通过电子邮件告知您最终结果。审核过程中，我们可能会跟您联系，请您提供更多的信息以完成审核。取决于您的回复时间和提供的补充信息的质量，审核时间有可能需要延长。在收到对您的申请的肯定决定后，您可将出版商发送的论文的最终编辑接受稿的付款通知发给ASAP团队。这可能包括请求付款发票的链接。然后，我们可以开始要求出版商向MJFF提供付款发票，并代表您直接向他们付款。最后，我们将向您发送从出版商处收到的付款确认书。

如何确保适当的CC许可获得无限制的重复使用权？

对于任何发表作品，您必须将知识共享（CC）署名许可或公共领域许可协议应用于所有提交给报告原始研究的同行评审期刊而产生的作者确认版文稿（AAM）。以下类型的许可协议都符合ASAP的开放取用要求。

  • CC BY 4.0是所有研究论文所需的默认许可协议。该许可协议确保您获得著作归属权（知识所有权），但允许您的著作实现免费共享（以任何媒介或格式重新分发或改编以供将来使用）。
  • CC0许可协议适用于受雇于政府的作者或公共领域中的其它内容。该许可协议不要求归属权。
  • CC BY-ND 可用于特殊情况。在CC BY-ND许可协议下，不允许对原著内容进行任何改动（即保持原文内容不变）。在这种情况下，您必须在发表版本最终接受前发送电子邮件至[email protected] 解释为何改动内容。我们将视具体情况考虑您的要求。

在极少数情况下，如与出版商在许可要求和即时在线获取的要求方面存在分歧，请联系ASAP [email protected] ，便于我们提供协助。为确保您采用适当的许可协议，您必须：

  • 在提交（给预印服务器和出版商的）文稿的致谢部分提到您提交的论文带有CC BY公共版权许可（或是CC0或CC BY-ND）。具体语言参考要求4里的“致谢”部分。
  • 确定期刊发布的VoR（期刊最终发表版本）中是否包括CC BY (或 CC0、CC BY-ND) 许可协议。期刊通常会在权利和权限或版权标签下列出文章的许可条款。如果找不到此类信息，可向出版商发送电子邮件获取。
    • 如果该期刊有相应的许可条款，且文章发表于开放存取期刊（黄金刊或混合刊），则无须执行任何操作。该期刊会在你的文章发表后提交给PubMed Central（PMC）或Europe PMC。
    • 如果该期刊没有适当的许可，和/或如果该期刊是纯订阅制，请将AAM提交给PubMed Central，以便它在VoR发布的同时出现。

预印本是尚未经过正式同行评审的完整手稿，必须在向期刊投稿之后或之前提交至公共预印本服务器——如bioRxiv或medRxiv。预印本必须与提交发表的稿件相同并链接到研究成果，且采用上述适当的CC-BY许可协议。

经同行评审后的文章发表后，预印本必须与之链接。如果文章标题保持不变，当最终出版物发表于大多数期刊上时，bioRxiv或medRxiv通常会自动完成以上操作。请注意，如果您在没有开放取用选项的订阅期刊上发表文章，那么预印本将链接到作者认可的手稿，该手稿带有PubMed Central发布的CC BY或等效许可证。

除了确保预印本和发表版本的手稿可开放取用，ASAP的开放获取政策要求受资助的研究人员最大限度地提供研究数据和研究结果所依据的代码。

至少，在提交预印本和手稿时，必须向受认可的社区资料库中的其他研究人员提供支持研究论文的数据，以及查看数据集或复制分析所需的任何原始软件。

基础数据包含所有主要数据、关联的元数据（受保护的健康信息[PHI]或受保护的电子健康信息[(ePHI]除外），以及理解、评估和复制报告的研究结果所必需的任何其它相关数据。请注意，数据可包括软件、数据集、协议，工具和试剂。这对于允许其他人以新的方式验证、复制和重用数据至关重要。此外，对数据和代码的仔细记录和管理为将来的查询提供了出处和纪录。

这些政策符合现有的行业最佳实践，包括一些出版商所要求的数据可用性政策。

请注意，ASAP支持2016年在《科学数据》上发表的科学数据管理和治理的FAIR指导原则。 这些导则旨在提高数字资产的可查找性、可访问性、互操作性和可再利用性。

ASAP的政策和FAIR原则的核心要求有：

  1. 所有相关的数据集文件都由足够的元数据描述。
  2. 所有的数据集都有一个全球唯一的、持久的标识符，并包含在核心元数据中。
  3. 持久性标识符和充分的元数据在一个可靠的、可搜索的资源中注册或索引。
  4. 确保ASAP致谢被包括在存储库记录中。

基础数据和软件的存储库的选择

ASAP将提供存储所有受资助的研究论文的首选数据存储库清单，我们将与团队合作确定合适的平台。请注意，您所选择的数据存储库必须符合以下要求：

  • 在发表预印本并将手稿提交到期刊后，基础数据即刻实现开放获取；
  • 允许重复使用，且许可证不能比知识共享许可协议4.0(CC-BY 4.0)更严格；
  • 为数据集分配一个持久且唯一的标识符，如DOI（数字对象标识符），方便链接和引用；
  • 提供长期存储和保存，如符合ISO的可信的数字存储库标准的存储库。

关于推荐的存储库的问题，请发送电子邮件至[email protected]或[email protected]。

协议、实验室资源和软件的存储库

协议：必须通过协议共享服务，如protocols.io， 公开ASAP资助的研究中使用的实验协议（并根据需要进行更新）。ASAP将为受赠方提供使用protocols.io平台的支持。共享和讨论科学方法对于实现可靠、可重复的实验研究至关重要。

软件：软件，包括算法、脚本和其他基于代码的研究成果，必须通过GitHub 等代码库提供，并分配一个DOI。如果难以或无法通过代码库分配DOI，Zenodo也可以为托管在其他地方的代码分配DOI。

实验室资源：由ASAP资助或ASAP研究项目产生的所有工具或试剂和必须随时提供给科研界，并可以引用，作为支持可重复性和促进进一步研究的手段。关于推荐存储库的问题，请发送电子邮件至[email protected]。要在引用实验室资源工具方面获得帮助，请查看资源识别门户，该门户汇总了多个资源库的信息，并为出版物中的引用提供标识符。这一要求适用于细胞系、转基因模型、质粒/克隆、抗体和其他试剂。

所有经ASAP部分或全部支持而产出出版物–无论是在获奖期间，还是在资助期结束后–都必须注明GP2。

致谢

出版物的致谢部分必须包含以下文字：

“准备此文章使用的数据来自全球帕金森基因计划（GP2）。GP2项目由帕金森病科学联盟 (ASAP)支持，由迈克尔· J ·福克斯帕金森研究基金会实施 (www.gp2.org)。GP2的完整会员名单见http://www.gp2.org。”

作者资格

研究人员可将GP2数据用于任何符合GP2数据使用协议的项目/分析。GP2 的出版物分为三类：

由联盟主导，以GP2为重点的论文

  1. 对于由GP2指导委员会或工作组发表的且主要基于GP2合作数据集的论文，所有GP2会员都将是共同作者，联盟名【全球帕金森基因计划（GP2）】将放在资深作者名之后（取决于期刊指南）。所有署名作者可在论文提交前查看、评论、并同意提交论文。作者可以主动提出不出现在作者名单中，任何共同作者如果两周之内不回应手稿的评论要求，或不提供期刊要求的信息，将自动被从作者名单上移除，并且移至致谢部分。

间接使用GP2数据的论文

  1. 对于间接使用GP2数据库的个人基因型数据的分析（如复制非联盟的数据或重点突出基因/基因座的结果的手稿），主要分析和写作小组的成员会被列为作者。其他人都会被列在联盟名之下，以联盟名收录到作者名单中, 在第一作者和末尾作者之间。列在联盟名下的作者在PubMed审核之后就可以在PubMed上被检索到。所有名单和脚注中的作者可在论文提交前查看、评论、并同意提交论文。作者可以主动提出不出现在作者名单中，任何共同作者如果两周之内不回应手稿的评论要求，或不提供期刊要求的信息，即不出现在作者名单中。

外部论文

  1. 非联盟成员发表的作品可能不会出现联盟名。对于这些发表作品，联盟成员不会出现在PubMed里。

非常规情况

上文提及的政策适用于大部分的GP2数据用户。GP2期望研究员会遵从这些指南，也期望大部分分析都能达到高质量。但是，GP2预计可能会出现一些非常规情况。

极差稿件

如果GP2指导委员审阅手稿后认为论文的语言、科学问题、分析方法、写作水平或是表达清晰度极差，GP2指导委员会可建议作者在提交前作出重大修改。如果作者坚持提交手稿，GP2指导委员会有三个选择：1）要求不得署集体作者名 2）要求作者发表声明，说明尽管手稿使用了GP2数据，但是GP2认为手稿质量没有达到发表水准；3）撤销其未来使用GP2数据的资格。

违反GP2数据使用协议

如果用户无意间违反GP2数据使用协议，可能会在发现违规行为时自我纠正。如果用户故意违反协议，GP2可采取的唯一制裁措施是撤销用户获取GP2数据的资格。

数据的欺诈性使用

线上注册即可开源使用，给了个人可趁之机，假借正当名义获得数据。发表以欺诈手段获得的GP2数据的情况一经发现，GP2指导委员会将联系研究员或其导师、负责监督的个人/委员会和/或管理机构，对用户进行处罚。一旦GP2指导委员会注意到任何违反数据使用协议，会立即采取行动纠正或制止违规行为。具体行动可能包括中止用户访问数据和/或将违规行为报告给相关个人/组织。

迈克尔·J·福克斯基金会、ASAP和GP2指导委员会保留修改本协议条款并在此网页发布有关此类修改的通知的权力。所做的任何修改在发布修改后立即生效（除非另有说明）。您应该定期访问此页面，查看最新使用协议条款。

联系方式

如有任何问题，请发送邮件至[email protected]或 [email protected]。

注：这些政策最终将永久保存在ASAP网站上，并在资助金合同中予以引用。本文件将不时更新。

最后更新于：2022年10月4日