{"id":50012105,"date":"2024-04-23T00:48:51","date_gmt":"2024-04-23T04:48:51","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/elements-de-la-septieme-edition-des-donnees-du-gp2\/"},"modified":"2024-10-21T15:50:59","modified_gmt":"2024-10-21T19:50:59","slug":"elements-de-la-septieme-edition-des-donnees-du-gp2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/fr\/elements-de-la-septieme-edition-des-donnees-du-gp2\/","title":{"rendered":"El\u00e9ments de la septi\u00e8me \u00e9dition des donn\u00e9es du GP2"},"content":{"rendered":"<h2><span style=\"font-weight: 400;\">Aper\u00e7u g\u00e9n\u00e9ral<\/span><\/h2>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">En avril 2024, le GP2 a annonc\u00e9 la septi\u00e8me publication des donn\u00e9es sur les plateformes Terra et Verily\u00ae Workbench<\/span> <span style=\"font-weight: 400;\">, en collaboration avec l\u2019AMP<\/span><span style=\"font-weight: 400;\">\u00ae<\/span><span style=\"font-weight: 400;\"> PD.<\/span> <span style=\"font-weight: 400;\">Cette publication comprend plus de 9 000 participants suppl\u00e9mentaires au g\u00e9notype r\u00e9pertori\u00e9.<\/span><\/p>\n<ul>\n<li>La palette de donn\u00e9es de g\u00e9notypes, y compris les \u00e9chantillons restreints localement, atteignent d\u00e9sormais un total de 54 180 participants \u00e0 g\u00e9notype r\u00e9pertori\u00e9 (28 729 atteints de Parkinson, 15 834 cas t\u00e9moins et 9 617 \u00ab autres \u00bb ph\u00e9notypes).\n<ul>\n<li>Si l\u2019on soustrait les \u00e9chantillons restreints, le nombre total atteint 40 740 cas (soit 20 507 cas de Parkinson, 11 841 cas t\u00e9moins et 8 392 \u00ab autres \u00bb ph\u00e9notypes).<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li>Au total, 17 496 personnes r\u00e9pertori\u00e9es pour le ph\u00e9notypage clinique le sont \u00e9galement pour les informations g\u00e9n\u00e9tiques.<\/li>\n<\/ul>\n<h2><span style=\"font-weight: 400;\">Quoi de neuf dans cette publication?<\/span><\/h2>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Des \u00e9chantillons de g\u00e9notypes imput\u00e9s suppl\u00e9mentaires.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Donn\u00e9es cliniques suppl\u00e9mentaires pour 4 911 personnes.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<h3><b>Echantillons restreints localement par le RGPD via Verily Viewpoint Workbench<\/b><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Nous continuons \u00e0 essayer d\u2019obtenir l\u2019acc\u00e8s aux \u00e9chantillons restreints localement, connus \u00e9galement comme \u00e9chantillons soumis au R\u00e8glement g\u00e9n\u00e9ral sur la protection des donn\u00e9es (RGPD), gr\u00e2ce \u00e0 notre collaboration avec Verily Viewpoint Workbench.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">A ce stade, alors que le GP2 continue de d\u00e9ployer ses solutions de partage de donn\u00e9es pour les donn\u00e9es prot\u00e9g\u00e9es par le RGPD, la septi\u00e8me \u00e9dition ne sera disponible que pour les membres du consortium GP2 et ses partenaires. Au fur et \u00e0 mesure de la poursuite des tests et de la mise en \u0153uvre, en 2024, ces solutions seront mises \u00e0 la disposition d\u2019un plus grand nombre de chercheurs. Tous les \u00e9chantillons de la septi\u00e8me \u00e9dition se trouvent sur Workbench, tandis que tous ceux non r\u00e9gis par le RGPD sont disponibles sur Terra (comme pour les \u00e9ditions pass\u00e9es). Pour avoir acc\u00e8s \u00e0 l\u2019int\u00e9gralit\u00e9 des publications sur VWB, vous devez : <\/span><\/p>\n<ol>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Disposer d\u2019une autorisation d\u2019acc\u00e8s GP2 de cat\u00e9gorie 2<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Remplir le formulaire de demande <\/span><strong><a href=\"https:\/\/forms.gle\/XrZthT18CYbGjifp7\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">d\u2019\u00e9chantillons r\u00e9gis par le RGPD<\/a><\/strong>.<\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">\u00catre membre du consortium du GP2 (contribution de cohorte, partenaire GP2 ou \u00e9quipe de projet d\u2019analyses).<\/span><\/li>\n<\/ol>\n<h3><b>Donn\u00e9es cliniques<\/b><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Cette publication comprend les donn\u00e9es cliniques pr\u00e9cises des ph\u00e9notypes de 4 911<\/span> <span style=\"font-weight: 400;\">personnes suppl\u00e9mentaires. Cette information comprend les donn\u00e9es suivantes :<\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">\u00c2ge au moment du diagnostique<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Diagnostique primaire, actuel et suivant<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Examens cognitifs tels que le Mini-Mental State Examination (MMSE) et le Montreal Cognitive Assessment (MoCA)<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">R\u00e9vision de l\u2019\u00e9chelle UPDRS parrain\u00e9e par la Movement Disorder Society<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">D\u00e9tail des \u00abautres\u00bb ph\u00e9notypes, tels que la d\u00e9mence \u00e0 corps de Lewy<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Dans cette \u00e9dition, chacune des<\/span> <span style=\"font-weight: 400;\">17 496 personnes ayant un dossier clinique a \u00e9galement le dossier g\u00e9n\u00e9tique correspondant.<\/span><\/p>\n<h3><b>Donn\u00e9es individuelles:<\/b><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\"> Nous disposons d\u00e9sormais des donn\u00e9es de 87 cohortes, dont 14 sont nouvelles dans cette \u00e9dition. Veuillez consulter le <a href=\"https:\/\/gp2.org\/fr\/cohort-dashboard-advanced\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">tableau de bord des cohortes du GP2<\/a> pour obtenir des informations compl\u00e9mentaires au sujet des cohortes qui ont \u00e9t\u00e9 partag\u00e9es.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Les participants au GP2 atteints de maladies complexes ont leur ascendance g\u00e9n\u00e9tiquement d\u00e9termin\u00e9e et r\u00e9partie en onze groupes ; le tableau ci-dessous d\u00e9taille l&rsquo;ascendance des participants \u00e0 cette \u00e9dition qui ont pass\u00e9 le contr\u00f4le de qualit\u00e9 et ont \u00e9t\u00e9 comptabilis\u00e9s. Ces chiffres inclus les \u00e9chantillons des \u00e9ditions pr\u00e9c\u00e9dentes qui ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9organis\u00e9s selon une nouvelle m\u00e9thode de classement des dossiers et ont \u00e9t\u00e9 soumis \u00e0 un contr\u00f4le de qualit\u00e9, ainsi que de nouveaux \u00e9chantillons de g\u00e9notypes, sp\u00e9cifiques \u00e0 cette \u00e9dition.<\/span><\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter wp-image-50004229 size-large\" src=\"https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-1018x1024.jpg\" alt=\"\" width=\"1018\" height=\"1024\" srcset=\"https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-1018x1024.jpg 1018w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-298x300.jpg 298w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-150x150.jpg 150w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-768x773.jpg 768w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-1527x1536.jpg 1527w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-2036x2048.jpg 2036w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-256x258.jpg 256w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-512x515.jpg 512w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-716x720.jpg 716w, https:\/\/gp2.org\/wp-content\/uploads\/2024\/04\/102049-010_GP2Blogs_DataChart_7_1024x1030_v1r2-120x120.jpg 120w\" sizes=\"auto, (max-width: 1018px) 100vw, 1018px\" \/><\/p>\n<h3><b>S\u00e9quen\u00e7age entier du g\u00e9nome appel\u00e9 DeepVariant-GLnexus<\/b><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Les donn\u00e9es de s\u00e9quen\u00e7age suppl\u00e9mentaires du GP2 devraient \u00eatre publi\u00e9es au troisi\u00e8me trimestre de 2024.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Les futures \u00e9ditions de donn\u00e9es contribueront \u00e0 renforcer la diversit\u00e9 des participants disponibles. Vous pouvez consulter <a href=\"https:\/\/gp2.org\/fr\/cohort-dashboard-advanced\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">notre tableau de bord<\/a> pour suivre nos progr\u00e8s. Les utilisateurs ayant un acc\u00e8s de cat\u00e9gorie 2 peuvent d\u2019ores et d\u00e9j\u00e0 explorer les donn\u00e9es sur notre <a href=\"https:\/\/gp2-cohort-browser-dot-gp2-release-terra.uc.r.appspot.com\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">navigateur de cohortes<\/a>, dont nous avons parl\u00e9 dans un pr\u00e9c\u00e9dent <a href=\"https:\/\/gp2.org\/fr\/zoom-presentation-de-notre-nouvelle-application-le-navigateur-de-recherche-de-cohortes-du-gp2\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">blog<\/a><\/span>.<\/p>\n<p><b>Comme toujours, veuillez consulter le document README qui accompagne chaque publication du GP2 pour obtenir plus d\u2019informations sur les canaux, les donn\u00e9es et les analyses !<\/b><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Aper\u00e7u g\u00e9n\u00e9ral En avril 2024, le GP2 a annonc\u00e9 la septi\u00e8me publication des donn\u00e9es sur les plateformes Terra et Verily\u00ae Workbench , en collaboration avec l\u2019AMP\u00ae PD. 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