{"id":50012094,"date":"2024-01-18T18:21:59","date_gmt":"2024-01-18T23:21:59","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/etude-dassociation-pangenomique-de-la-maladie-de-parkinson-a-pluri-ascendance\/"},"modified":"2024-10-21T15:48:47","modified_gmt":"2024-10-21T19:48:47","slug":"etude-dassociation-pangenomique-de-la-maladie-de-parkinson-a-pluri-ascendance","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/fr\/etude-dassociation-pangenomique-de-la-maladie-de-parkinson-a-pluri-ascendance\/","title":{"rendered":"Etude d’association pang\u00e9nomique de la maladie de Parkinson \u00e0 pluri-ascendance"},"content":{"rendered":"

La maladie de Parkinson a fait l\u2019objet de recherche g\u00e9n\u00e9tique \u00e0 grande \u00e9chelle. Les chercheurs ont identifi\u00e9 plus de 90 variants g\u00e9n\u00e9tiques susceptibles d\u2019influer sur le degr\u00e9 de risque de d\u00e9velopper un Parkinson, et ont ainsi r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que c\u2019est une maladie complexe impliquant plusieurs voies mol\u00e9culaires. \u00a0<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

Il n\u2019a cependant pas \u00e9t\u00e9 possible d\u2019obtenir une vision d\u2019ensemble, une compr\u00e9hension englobante de la maladie de Parkinson en raison du manque de diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique dans les \u00e9tudes r\u00e9alis\u00e9es sur la maladie Parkinson, lesquelles \u00e9taient grandement ax\u00e9es sur les populations d\u2019ascendance europ\u00e9enne. Quels seraient les variants g\u00e9n\u00e9tiques de la maladie de Parkinson \u00e0 l\u2019origine du lien de causalit\u00e9 ? Quels variants seraient les plus pertinents pour toutes les populations, d\u2019un point de vue clinique? Pour pouvoir r\u00e9pondre \u00e0 ces questions, il nous faut n\u00e9cessairement une plus grande diversit\u00e9 de donn\u00e9es d\u2019ascendance.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

Une collaboration mondiale : Ascendance diversifi\u00e9e et grande \u00e9chelle
\n<\/span><\/b>La <\/span>nouvelle \u00e9tude collaborative publi\u00e9e dans\u00a0Nature Genetics<\/i><\/em><\/span><\/a>\u00a0offre une compr\u00e9hension plus inclusive et mondiale du paysage g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson. Il s\u2019agit de l\u2019\u00e9tude la plus \u00e9tendue et la plus diversifi\u00e9e en son genre gr\u00e2ce, en grande partie, \u00e0 la collaboration mondiale et aux efforts de partage de donn\u00e9es engag\u00e9s par le<\/span>Programme mondial sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson (GP2)<\/span><\/a>. Cette \u00e9tude analyse les donn\u00e9es de 49 049 sujets atteints de parkinsonisme, 18 785 personnes dont les parents sont atteints ou ont \u00e9t\u00e9 atteints de parkinsonisme, et plus de 2 millions de personnes neurologiquement en bonne sant\u00e9, d\u2019ascendance europ\u00e9enne, d\u2019Asie de l\u2019Est, d\u2019Am\u00e9rique latine et d\u2019Afrique.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

Les chercheurs du NIH, du GP2, du 23andMe ainsi que des collaborateurs aux Etats-Unis, au Royaume-uni, au P\u00e9rou et \u00e0 Singapour ont sourc\u00e9 cette diversit\u00e9 de donn\u00e9es sur <\/span>FinnGen<\/span><\/a>, <\/span>23andMe<\/span><\/a>,<\/span>UK Biobank<\/span><\/a> et autres bases de donn\u00e9es en acc\u00e8s libre. A l\u2019aide de ces donn\u00e9es, ils ont pu identifier 78 positions du g\u00e9nome (\u00ab loci \u00bb) clairement associ\u00e9es \u00e0 la maladie de Parkinson.\u00a0<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

L\u2019analyse des donn\u00e9es \u00e0 partir de multiples groupes d\u2019ascendance repr\u00e9sente un vrai d\u00e9fi, mais l\u2019\u00e9mergence de nouveaux logiciels et outils d\u2019analyse permettent de tirer parti de la diversit\u00e9 grandissante des donn\u00e9es. Gr\u00e2ce \u00e0 ces outils et efforts de collaboration d\u2019un bout \u00e0 l\u2019autre de la plan\u00e8te, les chercheurs peuvent d\u00e9sormais identifier des positions g\u00e9n\u00e9tiques associ\u00e9es au risque de parkinsonisme sur des populations d\u2019ascendance vari\u00e9e. Il est probable que ces positions contiennent des variants de causalit\u00e9.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

Pour cette \u00e9tude, les chercheurs ont utilis\u00e9 une approche dite m\u00e9ta-analyse pang\u00e9nomique \u00e0 pluri-ascendance. <\/span>L\u2019association pang\u00e9nomique <\/span><\/a> est une m\u00e9thode qui implique de r\u00e9pertorier les g\u00e9nomes de plusieurs sujets, de chercher les s\u00e9quences de variants sp\u00e9cifiques sur les positions g\u00e9nomiques (\u00ab loci \u00bb) que l\u2019on retrouve plus fr\u00e9quemment chez ceux souffrant d\u2019une maladie sp\u00e9cifique compar\u00e9 \u00e0 ceux qui n\u2019en souffrent pas. Les chercheurs ont r\u00e9cup\u00e9r\u00e9 les donn\u00e9es de plusieurs \u00e9tudes d\u2019association pang\u00e9nomiques pass\u00e9es et plusieurs bases de donn\u00e9es pour ajouter de la force et de la solidit\u00e9 statistique \u00e0 la recherche sur les facteurs de risques associ\u00e9s \u00e0 la maladie de Parkinson.\u00a0<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

En incluant les donn\u00e9es de populations non-europ\u00e9ennes, les chercheurs ont pu identifier plusieurs nouveaux loci <\/i>g\u00e9n\u00e9tiques qui n\u2019avaient pas \u00e9t\u00e9 observ\u00e9s dans les populations d\u2019ascendance europ\u00e9enne. Si la majorit\u00e9 des 78 positions de la maladie de Parkinson identifi\u00e9es dans cette \u00e9tude correspond aux positions d\u00e9j\u00e0 associ\u00e9es \u00e0 cette maladie, 12 d\u2019entre elles occupent de nouvelles positions. Il semble que ces nouvelles positions impliquent des g\u00e8nes qui participent \u00e0 la d\u00e9composition ou \u00e0 la m\u00e9tabolisation des prot\u00e9ines, au contr\u00f4le de l\u2019activit\u00e9 des mitochondries et au transport des r\u00e9ponses immunitaires dans le cerveau.\u00a0<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

La plupart des positions identifi\u00e9es \u00e9taient associ\u00e9s au risque de Parkinson sur toutes les lign\u00e9es \u00e9tudi\u00e9es, y compris les populations europ\u00e9ennes. Ces r\u00e9sultats semblent indiquer que les nombreuses voies mol\u00e9culaires \u00e0 l\u2019origine de la maladie de Parkinson sont communes \u00e0 toutes les populations.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

Vers une m\u00e9decine personnalis\u00e9e : Cartographie fine et implications fonctionnelles
\n<\/span><\/b>Les chercheurs ont \u00e9galement pu d\u00e9gager le variant g\u00e9n\u00e9tique de causalit\u00e9 sp\u00e9cifique dans au moins 6 des positions identifi\u00e9es, selon un processus dit de cartographie fine. La cartographie fine permet de faire une estimation des variants sp\u00e9cifiques au sein de chaque locus susceptible de d\u00e9clencher un risque de maladie dans une population donn\u00e9e.\u00a0<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

\u00ab L\u2019un des probl\u00e8me des \u00e9tudes d\u2019association pang\u00e9nomique est que l\u2019on ne sait jamais quel variant sp\u00e9cifique est de nature fonctionnelle ou causale sur un locus identifi\u00e9 \u00bb regrette<\/span>Ignacio \u201dNacho\u201d Mata<\/span><\/a> chercheur au Learner Research Institute, professeur assistant en m\u00e9decine mol\u00e9culaire \u00e0 l\u2019\u00e9cole de m\u00e9decine Cleveland Clinic Learner et auteur de l\u2019\u00e9tude. \u00ab Pour chaque position ou point GWAS du g\u00e9nome clairement associ\u00e9 \u00e0 la maladie, il peut y avoir des centaines de variants candidats potentiels.\u00bb\u00a0<\/span>\u00a0<\/span>\u200b<\/span><\/p>\n

Identifier les variants fonctionnels sur un locus GWAS significatif et la fa\u00e7on dont ils affectent l\u2019expression g\u00e9n\u00e9tique est essentiel pour le suivi des \u00e9tudes et le d\u00e9veloppement d\u2019une th\u00e9rapeutique cibl\u00e9e de la maladie de Parkinson.\u00a0<\/span><\/p>\n

\u00ab En int\u00e9grant des s\u00e9ries de donn\u00e9es de lign\u00e9es diverses, nous avons pu r\u00e9duire le nombre de variants fonctionnels pour certains des g\u00e8nes sur le locus identifi\u00e9 \u00bb explique Nacho. \u00ab Les donn\u00e9es de lign\u00e9es diverses permettent, par exemple, d\u2019identifier des variants pouvant \u00eatre sp\u00e9cifiques \u00e0 la population et vous permettent aussi d\u2019identifier des variants qui sont significatifs d\u2019une population \u00e0 l\u2019autre et donc susceptibles d\u2019\u00eatre porteur d\u2019un facteur de risque plus \u00e9lev\u00e9. \u00bb\u00a0<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

Certains des loci<\/i> identifi\u00e9s avaient des effets diff\u00e9rents selon les populations, soulignant l\u2019importance des \u00e9tudes g\u00e9n\u00e9tiques se consacrant aux facteurs de risque d\u2019ascendances sp\u00e9cifiques. Deux des loci<\/i> identifi\u00e9s uniquement aupr\u00e8s des populations latino am\u00e9ricaines et africaines se trouvaient proches des g\u00e8nes<\/span>JAK1<\/span><\/i> et <\/span>HS1BP3<\/span><\/i>. Ces g\u00e8nes sont tous deux impliqu\u00e9s dans les signaux inflammatoires et peuvent alimenter le r\u00f4le de l\u2019inflammation dans la maladie de Parkinson.<\/span>\u00a0<\/span> <\/b><\/p>\n

Implications et orientations futures
\n<\/span><\/b>Les conclusions des cette \u00e9tude soulignent combien il est important d\u2019inclure des ascendances vari\u00e9es dans la recherche g\u00e9n\u00e9tique. Cette inclusivit\u00e9 renforce la pr\u00e9cision de la pr\u00e9diction du risque g\u00e9n\u00e9tique et le d\u00e9veloppement de traitements personnalis\u00e9s. Le GP2 est en partenariat avec des institutions qui travaillent avec des populations sous-repr\u00e9sent\u00e9es afin de g\u00e9n\u00e9rer des donn\u00e9es sur ces communaut\u00e9s qui ont \u00e9t\u00e9 n\u00e9glig\u00e9es partout dans le monde.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

\u00ab Nous avons vu des personnes du monde entier travailler ensemble et apprendre les unes des autres \u00bb dit Nacho. \u00ab Selon moi, cette collaboration est ce qu\u2019il y a eu de mieux dans cette \u00e9tude et ses promesses \u00e0 venir \u00bb.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

D\u2019autres \u00e9tudes de laboratoires seront n\u00e9cessaires pour confirmer combien les loci<\/i> identifi\u00e9s dans cette \u00e9tude touchent les voies de la maladie de Parkinson et les manifestations de la maladie. Ce travail n\u2019en reste pas moins une base solide sur laquelle pourront s\u2019appuyer les \u00e9tudes \u00e0 venir.<\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

\"\"<\/p>\n

Ce travail a b\u00e9n\u00e9fici\u00e9 du soutien de : Intramural Research Program of the National Institutes of Health (NIH), National Institute on Aging (NIA), NIH, Department of Health and Human Services; National Institute of Neurological Disorders and Stroke; Parkinson\u2019s Foundation; Michael J Fox Foundation; Aligning Science Across Parkinson\u2019s Global Parkinson\u2019s Genetic Project (ASAP-GP2); American Parkinson\u2019s Disease Association; National Medical Research Council Singapore; and Singapore Ministry of Education Academic Research Fund.\u00a0<\/span><\/i>\u00a0<\/span><\/p>\n

Cette \u00e9tude pu \u00eatre men\u00e9e en utilisant les sources de la biobanque du Royaume-uni sous le num\u00e9ro de dossier 33601. Nous tenons \u00e0 remercier les participants et les chercheurs de l\u2019\u00e9tude du FinnGen. Nous remercions les participants aux travaux et les employ\u00e9s de 23andMe. Les donn\u00e9es utilis\u00e9es dans la pr\u00e9paration de cet article sont issues du Programme mondial sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson (GP2). Le GP2 est financ\u00e9 par l\u2019initiative Aligning Science Against Parkinson\u2019s (ASAP) et mis en \u0153uvre par la Fondation Michael J. Fox pour la recherche sur la maladie de Parkinson (<\/span><\/i>https:\/\/gp2.org<\/span><\/i><\/a>).<\/span><\/i><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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