{"id":50012073,"date":"2023-10-25T22:23:52","date_gmt":"2023-10-26T02:23:52","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/temps-forts-du-hackathon-du-gp2-2023\/"},"modified":"2024-10-21T15:44:00","modified_gmt":"2024-10-21T19:44:00","slug":"temps-forts-du-hackathon-du-gp2-2023","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/fr\/temps-forts-du-hackathon-du-gp2-2023\/","title":{"rendered":"Temps forts du Hackathon du GP2 2023"},"content":{"rendered":"

Les hackathons portent bien leur nom : en un temps record, les participants d\u00e9veloppent des solutions innovantes en \u00e9quipe pour relever des d\u00e9fis bien pr\u00e9cis. Ce type d’\u00e9v\u00e9nement se g\u00e9n\u00e9ralise dans la communaut\u00e9 scientifique car il ouvre la voie \u00e0 la cr\u00e9ation de r\u00e9seaux et facilite l’acquisition de comp\u00e9tences dans les diff\u00e9rentes techniques d’analyse. Les hackathons ont d\u00e9montr\u00e9 leur efficacit\u00e9 pour la communaut\u00e9 du Programme mondial sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson (GP2), en rassemblant des membres du GP2 du monde entier et en mettant \u00e0 profit les comp\u00e9tences de chacun pour collaborer sur des probl\u00e9matiques li\u00e9es \u00e0 la maladie de Parkinson (MP). Par exemple, le hackathon virtuel de l’IPDGC\/GP2 de 2021 a permis aux participants de d\u00e9velopper des outils d’analyse des donn\u00e9es et des ressources adapt\u00e9es \u00e0 la la recherche sur la maladie de Parkinson<\/a>.<\/p>\n

\"\"\u00c0 la conclusion de la r\u00e9union annuelle des chercheurs du GP2 qui s’est tenue en ao\u00fbt 2023 \u00e0 Copenhague, 32 stagiaires et organisateurs du GP2 sont partis pour Malm\u00f6 en train, en Su\u00e8de, o\u00f9 ils ont consacr\u00e9 deux jours \u00e0 diff\u00e9rents projets ax\u00e9s sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson. Seize autres participants ont rejoint la conf\u00e9rence virtuellement depuis les quatre coins du monde. Au total, 48 participants originaires de 23 pays diff\u00e9rents ont particip\u00e9 \u00e0 l’\u00e9v\u00e9nement.<\/span><\/span>\u00a0<\/span><\/p>\n

Les participants ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9partis en huit \u00e9quipes en fonction de leurs int\u00e9r\u00eats, degr\u00e9 d’expertise et <\/span>fuseau horaire<\/span>: cinq \u00e9quipes ont particip\u00e9 en pr\u00e9sentiel et trois par visioconf\u00e9rence. Chaque projet a \u00e9t\u00e9 con\u00e7u pour produire des r\u00e9sultats d’analyse \u00e0 partir des donn\u00e9es du GP2 disponibles \u00e0 ce jour. La plateformeTerra<\/a> a \u00e9t\u00e9 retenue pour la conduite des projets de mani\u00e8re \u00e0 ce que les participants apprennent \u00e0 utiliser et \u00e0 r\u00e9aliser des analyses sur cette plateforme qui h\u00e9berge aussi les donn\u00e9es du GP2 et du Partenariat pour l\u2019acc\u00e9l\u00e9ration des traitements contre la maladie de Parkinson (AMP PD). Les huit projets approuv\u00e9s au pr\u00e9alable par le groupe de travail Propositions des projets du GP2 sont les suivants :<\/span><\/span><\/span><\/p>\n

    \n
  1. \u00c9valuation portant sur un seul g\u00e8ne (ABCB1)<\/li>\n
  2. \u00c9valuation portant sur un seul g\u00e8ne (COMT)<\/li>\n
  3. D\u00e9pistage des variants du GBA1 en fonction de l’ascendance et \u00e0 l’aide de donn\u00e9es de s\u00e9quen\u00e7age de l’ensemble du g\u00e9nome<\/li>\n
  4. Porteurs de variants pathog\u00e8nes de la MP<\/li>\n
  5. \u00c9valuation portant sur un seul g\u00e8ne (DNAJC13)<\/li>\n
  6. Analyse de l\u2019haplotype (MAPT)<\/li>\n
  7. Analyse scRNA-seq<\/li>\n
  8. Essais sur l\u2019homozygosit\u00e9<\/li>\n<\/ol>\n

    \"\"Au cours de ces deux journ\u00e9es, les membres des \u00e9quipes ont fait connaissance et ont collabor\u00e9 pour produire les donn\u00e9es et le code dont ils avaient besoin pour chaque projet. En fin de journ\u00e9e, toutes les \u00e9quipes dressaient un rapide bilan des progr\u00e8s accomplis et des difficult\u00e9s \u00e9ventuellement rencontr\u00e9es. Bien que deux jours ne suffisent pas \u00e0 terminer un projet d’analyse complet, toutes les \u00e9quipes ont r\u00e9alis\u00e9 des progr\u00e8s significatifs en peu de temps. L\u2019\u00e9dition de 2023 du hackathon est termin\u00e9e mais les \u00e9quipes poursuivront leurs projets dans le but de publier leurs <\/span>conclusions sous forme de rapports de synth\u00e8se, de lettres \u00e0 la r\u00e9daction ou tout autre format adapt\u00e9.<\/span><\/span><\/p>\n

    \u00c0 l’avenir, nous pr\u00e9voyons d’organiser d’autres hackathons en pr\u00e9sentiel et par visio-conf\u00e9rence. Ne manquez pas de vous renseigner sur les \u00e9v\u00e9nements de ce type et sur les modalit\u00e9s d’inscription !<\/span><\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    Les hackathons portent bien leur nom : en un temps record, les participants d\u00e9veloppent des solutions innovantes en \u00e9quipe pour relever des d\u00e9fis bien pr\u00e9cis. Ce type d’\u00e9v\u00e9nement se g\u00e9n\u00e9ralise dans la communaut\u00e9 scientifique car il ouvre la voie \u00e0 la cr\u00e9ation de r\u00e9seaux et facilite l’acquisition de comp\u00e9tences dans les diff\u00e9rentes techniques d’analyse. Les […]<\/p>\n","protected":false},"author":0,"featured_media":50024640,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":"","_links_to":"","_links_to_target":""},"class_list":["post-50012073","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","post-type-collaboration-en-matiere-de-recherche","post-type-valeurs-du-gp2","topic-research-collaboration-5"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50012073","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=50012073"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50012073\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/50024640"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=50012073"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}