{"id":50012050,"date":"2023-08-25T20:35:41","date_gmt":"2023-08-26T00:35:41","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/la-science-collaborative-permet-la-decouverte-du-gba1\/"},"modified":"2024-11-26T14:07:08","modified_gmt":"2024-11-26T19:07:08","slug":"la-science-collaborative-permet-la-decouverte-du-gba1","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/fr\/la-science-collaborative-permet-la-decouverte-du-gba1\/","title":{"rendered":"La science collaborative permet la d\u00e9couverte du GBA1"},"content":{"rendered":"

La premi\u00e8re d\u00e9couverte du nouveau facteur de risque de maladie de Parkinson chez les personnes d\u2019ascendance africaine t\u00e9moigne de l\u2019importance que repr\u00e9sente l\u2019inclusion des populations sous-repr\u00e9sent\u00e9es.<\/span><\/h2>\n

La d\u00e9couverte du premier facteur de risque g\u00e9n\u00e9tique propre aux personnes d\u2019ascendance africaine est prometteuse d\u2019une \u00e9volution des connaissance sur la maladie de Parkinson. Il est d\u00e9sormais permis d\u2019esp\u00e9rer que ce domaine aura bient\u00f4t une vision compl\u00e8te des facteurs g\u00e9n\u00e9tiques li\u00e9s aux risques de Parkinson et \u00e0 son \u00e9volution, et que ces r\u00e9sultats g\u00e9n\u00e9tiques profiterons bient\u00f4t \u00e0 ceux que ont longtemps \u00e9t\u00e9 sous-repr\u00e9sent\u00e9s dans la recherche et sous-estim\u00e9s dans la m\u00e9decine. Le <\/span>Programme mondial sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson (GP2) <\/span><\/a>ouvre la voie \u00e0 des d\u00e9couvertes r\u00e9volutionnaires comme celle-ci, gr\u00e2ce \u00e0 son mod\u00e8le de recherche inclusif et collaboratif.<\/span><\/p>\n

Pour r\u00e9sumer, nous savions d\u00e9j\u00e0 que les variants du g\u00e8ne<\/span>GBA1<\/span><\/i>augmentent le risque de d\u00e9velopper la maladie de Parkinson. Ces variants sont le plus souvent identifi\u00e9s chez les personnes d\u2019ascendance europ\u00e9enne et juive ashk\u00e9naze. Aujourd\u2019hui, le GP2 annonce la d\u00e9couverte d\u2019un nouveau variant<\/span>GBA1<\/span><\/i>, propre aux personnes d\u2019ascendance africaine et m\u00e9tisse. Ce variant indique un risque de d\u00e9velopper la maladie de Parkinson 1,5 fois sup\u00e9rieur avec 1 copie du variant h\u00e9rit\u00e9 et 3 \u00e0 4 fois sup\u00e9rieur si les 2 copies du variant sont h\u00e9rit\u00e9es. Ce variant est commun dans la cohorte nig\u00e9riane mais il reste extr\u00eamement rare chez les autres populations de la plan\u00e8te, c\u2019est pourquoi il \u00e9tait pass\u00e9 inaper\u00e7u jusqu\u2019\u00e0 maintenant.<\/span><\/p>\n

Qu\u2019est-ce que le GP2 ?<\/i><\/h4>\n

Le GP2 a \u00e9t\u00e9 lanc\u00e9 en 2019 comme le premier programme source de l\u2019initiative Aligning Science Across Parkinson\u2019s (ASAP). Il a pour objectif de multiplier les connaissances sur les fondements g\u00e9n\u00e9tiques de la maladie de Parkinson et de rendre ces connaissances mondialement accessibles gr\u00e2ce au g\u00e9notypage de plus de 150 000 volontaires dans le monde entier, ce qui, une fois achev\u00e9, ferait de ce jeu de donn\u00e9es sur la maladie de Parkinson, le plus important en nombre et en diversit\u00e9 d\u2019ascendance. Le programme a \u00e9t\u00e9 con\u00e7u dans une d\u00e9marche intentionnelle visant \u00e0 combler les lacunes majeures des connaissances actuelles en mati\u00e8re de Parkinson, o\u00f9 \u00e0 l\u2019instar d\u2019autres maladies, les proc\u00e9dures ne refl\u00e8tent pas la diversit\u00e9 des personnes touch\u00e9es par la maladie, ce qui rend notre compr\u00e9hension de la maladie lacunaire Les retomb\u00e9es sur le d\u00e9veloppement de m\u00e9dicaments, la conception de tests cliniques ainsi que sur les disparit\u00e9s dans la sant\u00e9, en aval, sont majeures.\u00a0<\/span><\/p>\n

Ce qui m\u2019enthousiasme au sujet de ce programme ne tient pas seulement \u00e0 la port\u00e9e et \u00e0 l\u2019\u00e9chelle du travail, mais \u00e9galement \u00e0 la strat\u00e9gie utilis\u00e9e par le GP2 pour concr\u00e9tiser ce programme et en faire une r\u00e9alit\u00e9. Sous l\u2019orientation des Dr. Andrew Singleton and Cornelis Blauwendraat, ils ont \u00e9tabli une approche r\u00e9alisable dans laquelle le GP2 servira \u00e0 la fois de moteur pour la d\u00e9couverte et le renforcement des capacit\u00e9s – afin d\u2019\u00e9quiper un collectif mondial de recherche avec un ensemble de qualifications, outils et infrastructure pour r\u00e9pondre rapidement et efficacement aux besoins et questions \u00e9mergentes en mati\u00e8re de recherche. Le GP2 dispose de collaborateurs dans plus de 55 sites sur six continents, qui chacun contribuent par l\u2019envoi de leurs \u00e9chantillons. C\u2019est \u00e0 la fois une entreprise de taille et un pas important dans la bonne direction, \u00e9tant donn\u00e9 que la majeure partie des travaux de d\u00e9couverte g\u00e9n\u00e9tique \u00e0 grande \u00e9chelle a \u00e9t\u00e9 men\u00e9 jusqu\u2019\u00e0 cette date sur des sujets d\u2019ascendance europ\u00e9enne (les estimations vont de <\/span>86 <\/span><\/a>\u00e0<\/span> 96<\/span><\/a>%).\u00a0<\/span><\/p>\n

Quel est le principal flux de travail? Tous les chercheurs qualifi\u00e9s peuvent devenir membre du GP2 d\u00e8s lors qu\u2019ils sont pr\u00eats \u00e0 partager une cohorte ou \u00e0 partager leur expertise avec le r\u00e9seau. Le GP2 agit comme base centrale pour g\u00e9n\u00e9rer les donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques et harmoniser les donn\u00e9es cliniques correspondantes. Les donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques sont ensuite renvoy\u00e9es aux contributeurs et ins\u00e9r\u00e9es dans le syst\u00e8me informatique central du GP2. Tout membre du GP2 peut proposer une analyse et une demande technique ou une assistance informatique en vue d\u2019analyser les donn\u00e9es. Ces r\u00e9sultats, ainsi que les donn\u00e9es justificatives, sont ensuite partag\u00e9es avec l\u2019ensemble de la communaut\u00e9 de chercheurs.<\/span><\/p>\n

En r\u00e9trospective : Quel a \u00e9t\u00e9 notre parcours<\/i><\/b><\/h4>\n

Les deux premi\u00e8res ann\u00e9es du GP2 ont \u00e9t\u00e9 enti\u00e8rement consacr\u00e9es aux op\u00e9rations et au renforcement des capacit\u00e9s – collecter 147 cohortes de 59 pays \u00e0 cette date, en veillant \u00e0 mettre en place les consentements n\u00e9cessaires et les autorisations de partage des donn\u00e9es, en renfor\u00e7ant la confiance entre les diverses communaut\u00e9s dans le monde entier et en \u00e9tablissant les principaux flux de travail. Soulignons que l\u2019engagement pris \u00e0 l\u2019\u00e9gard de la diversit\u00e9 mondiale constitue la pierre angulaire de ce projet, de l\u2019augmentation des repr\u00e9sentations au sein de la direction du GP2 aux efforts de collecte de fonds dans les pays \u00e0 faible revenu et \u00e0 revenu interm\u00e9diaire ainsi que dans les populations sous-repr\u00e9sent\u00e9es des Etats-Unis. \u00a0<\/span><\/p>\n

L\u2019an dernier, apr\u00e8s les efforts consacr\u00e9s aux op\u00e9rations et \u00e0 l\u2019infrastructure, le GP2 est pass\u00e9 \u00e0 la g\u00e9n\u00e9ration de donn\u00e9es. L\u2019une des premi\u00e8res analyses pr\u00e9liminaires a \u00e9t\u00e9 men\u00e9e sur la cohorte nig\u00e9riane. Ce fut alors consid\u00e9r\u00e9 comme une opportunit\u00e9 de formation en bio-informatique, les r\u00e9sultats \u00e9tant attendus de longue date pour ce petit \u00e9chantillon (pr\u00e8s de 1000 cas). Dans les \u00e9tudes g\u00e9niques \u00e0 grande \u00e9chelle, le nombre de cas doivent se compter par dizaines, voire par centaines, de milliers, avant de pouvoir r\u00e9v\u00e9ler un facteur de risque. Quand il est apparu clairement que les r\u00e9sultats semblaient avoir identifi\u00e9 un nouveau variant \u00e0 risque, une nouvelle analyse a \u00e9t\u00e9 lanc\u00e9e pour en assurer la fiabilit\u00e9. Les r\u00e9sultats ont ensuite \u00e9t\u00e9 valid\u00e9s par une \u00e9tude ind\u00e9pendante sur les sujets qui participent au <\/span>BLAAC-PD <\/span><\/a>(<\/span>liens<\/b>entre les populations<\/span>africaines<\/b>et<\/span><\/b>noires-am\u00e9ricaines <\/span>et<\/b> la<\/span>maladie<\/b>de<\/span>Parkinson<\/b>), un effort de collecte de donn\u00e9e aid\u00e9 par le GP2 aux Etats-Unis pour les ascendances africaine et m\u00e9tiss\u00e9e, d\u00e9montrant que le variant de risque est pr\u00e9valent dans toutes les populations africaines au-del\u00e0 de l\u2019Afrique de l\u2019Ouest.<\/p>\n

Impact, questions et perspectives<\/i><\/b><\/h4>\n

Ce r\u00e9sultat <\/span><\/a>souligne le potentiel transformateur de tout engagement r\u00e9el dans la science inclusive visant des connaissances fondamentales en vue d\u2019am\u00e9liorer la sant\u00e9 humaine. Si ces r\u00e9sultats sont inattendus, le GP2 a cr\u00e9\u00e9 un \u00e9cosyst\u00e8me et une infrastructure favorables \u00e0 l\u2019\u00e9mergence de ces savoirs. Pr\u00e8s de 2% des sujets participant aux \u00e9tudes g\u00e9niques \u00e0 grande \u00e9chelle, quelles qu\u2019elles soient, sont d\u2019ascendance africaine [<\/span>Sirugo et al., Cell 2019<\/span><\/a>], alors qu\u2019ils ne repr\u00e9sentent que 18% de la population mondiale. En outre, la maladie de Parkinson est g\u00e9n\u00e9ralement consid\u00e9r\u00e9e comme \u00e9tant moins pr\u00e9valente chez les populations africaine et afro-am\u00e9ricaine (Bailey et al, 2020, Okubadejo 2007). Cependant, ces conclusions sont controvers\u00e9es car il existe des rapports souvent contradictoires et peu d\u2019\u00e9tudes qui tiennent compte de ces populations. \u00a0<\/span><\/p>\n

En tant que femme noire d\u2019ascendance nig\u00e9riane, ces r\u00e9sultats me concernent au premier chef. Je ne me vois pas souvent repr\u00e9sent\u00e9e dans les travaux de recherche g\u00e9n\u00e9tique, donc il est particuli\u00e8rement gratifiant d\u2019\u00eatre en premi\u00e8re place d\u2019une d\u00e9couverte ayant des implications concr\u00e8tes pour la communaut\u00e9 \u00e0 laquelle j\u2019appartiens et sur tous ceux de m\u00eame ascendance. Au fur et \u00e0 mesure que la pr\u00e9cision des tests th\u00e9rapeutiques se banalise, il est imp\u00e9ratif de combler les lacunes de diversit\u00e9 dans les grandes \u00e9tudes g\u00e9n\u00e9tiques, d\u2019autant que les r\u00e9sultats des \u00e9tudes d\u2019association pang\u00e9nomiques (GMAS) ne sont peut-\u00eatre pas r\u00e9plicables d\u2019un groupe ethnique \u00e0 l\u2019autre, comme le montrent les conclusions du GP2 et celles d\u2019autres \u00e9tudes se rapportant \u00e0 d\u2019autres maladies (ex. <\/span>les variants CYP2D6 <\/span><\/i>et les diff\u00e9rences de m\u00e9tabolisme li\u00e9s aux m\u00e9dicaments contre le cancer d\u2019une population \u00e0 l\u2019autre. [<\/span>Popejoy &Fullerton. Nature 2016<\/span><\/a>], les progr\u00e8s dans les traitements contre le cholest\u00e9rol [<\/span>inhibiteurs<\/span><\/i> PCSK9] ont b\u00e9n\u00e9fici\u00e9 de l\u2019inclusion des populations afro-am\u00e9ricaines dans les travaux de recherche [<\/span>Cohen et al., Nat Gen 2005<\/span><\/a>]). Ces r\u00e9sultats offrent de nouvelles possibilit\u00e9s th\u00e9rapeutiques pour les personnes d\u2019ascendance africaine.<\/span><\/p>\n

De nombreuses questions perdurent notamment sur la fa\u00e7on dont le <\/span>GBA1<\/span><\/i> peut contribuer \u00e0 la maladie de Parkinson. L\u2019un des premiers tests cliniques r\u00e9alis\u00e9s par Sanofi (Venglustat) ciblant le<\/span>GBA1<\/span><\/i> a conclu que le groupe cible<\/span> r\u00e9pondait moins bien que le groupe placebo<\/span><\/a>, laissant appara\u00eetre une compr\u00e9hension lacunaire de la m\u00e9canique de la maladie. L\u2019\u00e9tude des variants<\/span>GBA1<\/span><\/i> li\u00e9s \u00e0 la maladie, nous permet d\u2019am\u00e9liorer nos connaissances sur la fa\u00e7on dont<\/span>ils<\/span><\/i>d\u00e9clenchent la maladie et sur le renforcement du traitement cible par le recours \u00e0 cette voie. De plus, en \u00e9tudiant ces variants sur diff\u00e9rentes populations dans le monde, nous \u00e9largissons le champ des populations susceptibles de b\u00e9n\u00e9ficier de la th\u00e9rapeutique par le <\/span>GBA1. <\/span><\/i><\/p>\n

Au fur et \u00e0 mesure que le GP2 acc\u00e9l\u00e8re sa capacit\u00e9 de d\u00e9couverte vont appara\u00eetre d\u2019autres r\u00e9sultats sur d\u2019autres populations dans le monde qui vont changer notre approche des tests cliniques et enrichir notre compr\u00e9hension de l\u2019architecture g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson. A la lumi\u00e8re de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me cr\u00e9\u00e9 par le GP2, de la capacit\u00e9 que nous avons cr\u00e9\u00e9 et de la coalition de chercheurs que nous alimentons, il appara\u00eet clairement que la collaboration inclusive est un argument fort. Le r\u00e9cit que font les auteurs, \u00e0 savoir 78 auteurs repr\u00e9sentant 24 institutions nig\u00e9rianes, souligne la valeur de cet exemple de d\u00e9marche collaborative entre l\u2019\u00e9quipe du GP2, le Consortium international sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson (IPDGC), la d\u00e9l\u00e9gation nig\u00e9riane et la Fondation Michael J. Fox et 23andMe .\u00a0<\/span><\/p>\n

Ne perdez pas ce programme de vue, des nouveaut\u00e9s sont attendues !<\/span><\/p>\n

(Clause de non-responsabilit\u00e9 : Cette d\u00e9couverte repr\u00e9sente un v\u00e9ritable tournant dans la recherche sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson mais pour l\u2019instant, elle n\u2019a pas d\u2019implications dans la prise en charge. Read this FAQ<\/a> for more on what this finding might mean for you.)<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

La premi\u00e8re d\u00e9couverte du nouveau facteur de risque de maladie de Parkinson chez les personnes d\u2019ascendance africaine t\u00e9moigne de l\u2019importance que repr\u00e9sente l\u2019inclusion des populations sous-repr\u00e9sent\u00e9es. La d\u00e9couverte du premier facteur de risque g\u00e9n\u00e9tique propre aux personnes d\u2019ascendance africaine est prometteuse d\u2019une \u00e9volution des connaissance sur la maladie de Parkinson. Il est d\u00e9sormais permis d\u2019esp\u00e9rer […]<\/p>\n","protected":false},"author":16,"featured_media":50024692,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":"","_links_to":"","_links_to_target":""},"class_list":["post-50012050","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","post-type-collaboration-en-matiere-de-recherche","post-type-communication-de-la-recherche","post-type-populations-sous-representees","post-type-valeurs-du-gp2","topic-research-collaboration-5","topic-valeurs-du-gp2-fr"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50012050","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/16"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=50012050"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50012050\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/50024692"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=50012050"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}