{"id":50011857,"date":"2021-03-31T20:23:33","date_gmt":"2021-04-01T00:23:33","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/gp2-et-amp-pd-platform-partners-for-progress-partenaires-de-plateformes-pour-le-progres-dans-la-recherche-sur-la-maladie-de-parkinson\/"},"modified":"2024-10-21T15:05:10","modified_gmt":"2024-10-21T19:05:10","slug":"gp2-et-amp-pd-platform-partners-for-progress-partenaires-de-plateformes-pour-le-progres-dans-la-recherche-sur-la-maladie-de-parkinson","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/fr\/gp2-et-amp-pd-platform-partners-for-progress-partenaires-de-plateformes-pour-le-progres-dans-la-recherche-sur-la-maladie-de-parkinson\/","title":{"rendered":"GP2 et AMP PD : Platform Partners for Progress (Partenaires de plateformes pour le progr\u00e8s) dans la recherche sur la maladie de Parkinson"},"content":{"rendered":"

Programme mondial sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson (GP2) et Partenariat pour l\u2019acc\u00e9l\u00e9ration des traitements (Accelerating Medicines Partnership) : les membres de Parkinson’s Disease (<\/span>AMP PD<\/span><\/a>) unissent leurs forces pour devenir le guichet unique des donn\u00e9es sur la g\u00e9n\u00e9tique parkinsonienne (GP2) et g\u00e9nomique (AMP PD) et vous permettre de dynamiser vos travaux de recherche sur les nouvelles substances pharmaceutiques et les biomarqueurs, acc\u00e9l\u00e9rant ainsi la d\u00e9couverte de nouveaux m\u00e9dicaments contre la maladie de Parkinson. A cela s\u2019ajoute la collaboration informatique bas\u00e9e sur le nuage que nous avons cr\u00e9\u00e9e afin de connecter entre elles ces deux bases de donn\u00e9es de tr\u00e8s grande envergure.<\/span><\/p>\n

Nous offrons un point d\u2019acc\u00e8s \u00e0 la fois unique et s\u00fbr \u00e0 une quantit\u00e9 massive de donn\u00e9es stock\u00e9es sur le nuage, en utilisant <\/span>Terra<\/span><\/a> comme squelette d\u2019analyse de donn\u00e9es, stockage de donn\u00e9es et authentification de chercheur. Terra fait passer les op\u00e9rations informatiques \u00e0 une dimension sup\u00e9rieure gr\u00e2ce aux espaces collaboratifs qui comprennent blocs notes et flux de travail originaux sur le nuage. L\u2019utilisation de l\u2019informatique en nuage signifie que vous pouvez analyser les donn\u00e9es dans un cadre plus s\u00e9curis\u00e9, sans les inconv\u00e9nients des transferts de donn\u00e9es on\u00e9reux et chronophages. Terra utilise la structure intuitive du bloc note de Jupyter pour une analyse claire et interactive. Terra vous permet aussi de publier votre espace de travail ainsi que vos r\u00e9sultats pour garantir une recherche reproductible et transparente. Les d\u00e9veloppements \u00e0 venir incluent l\u2019interop\u00e9rabilit\u00e9 avec d\u2019autres espaces de travail et plateformes consacr\u00e9s aux maladies neurod\u00e9g\u00e9n\u00e9ratives pour mieux optimiser les valeurs des donn\u00e9es.<\/span><\/p>\n

Pourquoi situer ces deux programmes au m\u00eame endroit ? Parce qu\u2019ils sont compl\u00e9mentaires. Si vous voulez vous immerger dans dix mille \u00e9chantillons ayant diverses logiques mutliomiques harmonis\u00e9es, comprenant le s\u00e9quen\u00e7age d\u2019ARN et le s\u00e9quen\u00e7age g\u00e9nomique, AMP PD est la base de donn\u00e9es qu\u2019il vous faut. Si vous cherchez \u00e0 explorer les associations g\u00e9n\u00e9tiques de populations diverses \u00e0 l\u2019\u00e9chelle d\u2019une biobanque, le GP2 est ce qu\u2019il vous faut. Le GP2 et l\u2019AMP PD incluent \u00e9galement l\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es cliniques longitudinales pertinentes sur la plupart des participants.<\/span>De fa\u00e7on g\u00e9n\u00e9rale, nous utilisons le GP2 comme base de donn\u00e9es de recherche pour les analyses \u00e0 grande \u00e9chelle (g\u00e9n\u00e9rant des hypoth\u00e8ses) et poursuivons avec une fine analyse exploratoire de ces d\u00e9couvertes sur les cohortes harmonis\u00e9es d\u2019AMP PD.<\/p>\n

L\u2019avantage majeur tient au fait que la proc\u00e9dure d\u2019acc\u00e8s et le point d\u2019entr\u00e9e sont les m\u00eames pour acc\u00e9der aux deux bases de donn\u00e9es, avec une architecture unique et la vaste documentation disponible pour r\u00e9duire la courbe d\u2019apprentissage. Nous avons d\u00e9velopp\u00e9 ce graphique pour illustrer les cas d\u2019utilisation des donn\u00e9es du GP2 et AMP PD.<\/span><\/p>\n

\"\"<\/p>\n

Ce blog a \u00e9t\u00e9 \u00e9crit par les membres du GP2 et de l\u2019AMP PD :<\/em><\/p>\n

Mike A. Nalls, docteur \u00e8s sciences
\n<\/b><\/em>Data Tecnica International | Etats-Unis <\/span><\/em>.
\nMike a fond\u00e9 Data Tecnica au d\u00e9but de l\u2019ann\u00e9e 2017 apr\u00e8s avoir pass\u00e9 plus de dix ans \u00e0 \u00e9tudier m\u00e9thodes et analyses de donn\u00e9es dans le domaine de la sant\u00e9 et autres domaines scientifiques. Il compte \u00e0 son actif plus de 350 publications scientifiques (avant l\u2019\u00e2ge de 40 ans) portant sur les statistiques appliqu\u00e9es aux grands jeux de donn\u00e9es, aux maladies c\u00e9r\u00e9brales et \u00e0 la g\u00e9nomique. C\u2019est un fervent d\u00e9fenseur de la science ouverte, du travail collaboratif et de la transparence dans les sciences.<\/span><\/em><\/p>\n

Hampton Leonard, master en sciences
\n<\/b><\/em>Data Tecnica International \/ National Institutes of Health | Etats-Unis <\/span><\/em>.
\nHampton a une formation en science des donn\u00e9es et d\u2019apprentissage machine qu\u2019elle applique \u00e0 de grands jeux de donn\u00e9es \u00ab multi-omiques \u00bb dans le domaine des maladies neurod\u00e9g\u00e9n\u00e9ratives. Elle se passionne pour la recherche portant sur les diff\u00e9rences entre les niveaux cliniques et \u00ab omiques \u00bb et sur l\u2019incidence de ces divergences sur les r\u00e9sultats des essais.<\/span><\/em><\/p>\n

Matt Bookman
\n<\/b><\/em>Verily Life Sciences | Etats-Unis<\/span> .
\nMatt est concepteur de solutions pour l\u2019\u00e9quipe Terra chez Verify. Vice-pr\u00e9sident du groupe de travail AMP PD, il a travaill\u00e9 aux c\u00f4t\u00e9s des autres collaborateurs du groupe au traitement des donn\u00e9es g\u00e9nomiques et transcriptomiques pour les mettre \u00e0 la disposition des chercheurs qualifi\u00e9s \u00e0 Terra. Matt est dipl\u00f4m\u00e9 en math\u00e9matiques appliqu\u00e9es de l\u2019UCLA et a un Master en sciences de l\u2019informatique et biologie informatique de l\u2019Universit\u00e9 de Stanford.<\/span><\/em><\/p>\n

Eline Appelmans
\n<\/b><\/em>Foundation for the National Institutes of Health | Etats-Unis
\n<\/span><\/em>Au titre de directrice des Partenariats pour la recherche en neurosciences, le prof. Appelmans travaille en coordination avec les National Institutes of Health, organismes \u00e0 but non-lucratif, responsables de secteurs et de projets FNIH sur la mise en \u0153uvre de programmes tels que l\u2019Accelerating Medicines Partnership (AMP) for Alzheimer\u2019s Disease (AMP-AD) (Partenariat pour acc\u00e9l\u00e9rer la recherche m\u00e9dicale sur la maladie de Parkinson), AMP for Parkinson\u2019s Disease (AMP-PD), AMP for Schizophrenia (AMP-SCZ), Alzheimer\u2019s Disease Neuroimaging Initiative 3 Private Partner Scientific Board (ADNI3 PPSB) et le Biomarkers Consortium Neuroscience Steering Committee (BC NSC), ainsi que d\u2019autres projets en cours de d\u00e9veloppement.<\/span><\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Nous avons l\u2019intention d\u2019ajouter une couche informatique qui permettra de relier entre elles deux bases donn\u00e9es de grande envergure. Mike Nalls, Hampton Leonard, Matt Bookman et Eline Appelmans incarnent le partenariat entre le Programme mondial sur la g\u00e9n\u00e9tique de la maladie de Parkinson (GP2) et le Partenariat pour l\u2019acc\u00e9l\u00e9ration des traitements (Accelerating Medicines Partnership) : Parkinson’s Disease (AMP PD) est en passe de devenir le point d\u2019entr\u00e9e unique donnant acc\u00e8s aux donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques et g\u00e9nomiques de la maladie de Parkinson. A lire dans ce blog.<\/p>\n","protected":false},"author":0,"featured_media":50010683,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":"","_links_to":"","_links_to_target":""},"class_list":["post-50011857","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","post-type-collaboration-en-matiere-de-recherche","post-type-valeurs-du-gp2","topic-research-collaboration-5"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50011857","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=50011857"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50011857\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/50010683"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=50011857"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}