{"id":50011916,"date":"2022-01-10T07:57:06","date_gmt":"2022-01-10T12:57:06","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/los-componentes-de-la-primera-aportacion-de-datos-del-gp2\/"},"modified":"2024-10-21T15:13:20","modified_gmt":"2024-10-21T19:13:20","slug":"los-componentes-de-la-primera-aportacion-de-datos-del-gp2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/es\/los-componentes-de-la-primera-aportacion-de-datos-del-gp2\/","title":{"rendered":"Los componentes de la primera aportaci\u00f3n de datos del GP2"},"content":{"rendered":"

En diciembre del 2021, el GP2 anunci\u00f3 su primera aportaci\u00f3n de datos del GP2 en la plataforma <\/span>AMP\u00ae<\/strong>\u00a0PD<\/strong><\/span><\/a>. Los datos disponibles hacen referencia a 4908 participantes (3434 con EP y 1474 sin EP) de las cohortes de CORIELL, Baylor College of Medicine (BCM) y BCM-University of Maryland (UMD). La ascendencia determinada gen\u00e9ticamente de los participantes del GP2 se categoriza en ocho grupos. En la siguiente tabla presentamos los detalles de la ascendencia determinada gen\u00e9ticamente de los participantes de la primera aportaci\u00f3n del GP2.<\/span> \"\" En futuras aportaciones, seguiremos ampliando la diversidad de los participantes. Les invitamos a visitar <\/span>nuestro panel<\/strong><\/span><\/a> para conocer nuestro progreso. <\/span><\/p>\n

Datos genotipados<\/h3>\n

Todos los datos se genotiparon en Illumina NeuroBooster Array, una matriz espec\u00edficamente dise\u00f1ada para genotipar variantes de enfermedades neurodegenerativas en poblaciones diversas. Los datos se procesaron de acuerdo con los protocolos est\u00e1ndares de Illumina. El control de calidad de los datos corri\u00f3 a cargo del GP2, que implement\u00f3 un flujo de CC de c\u00f3digo abierto. Luego, los datos se imputaron con TOPMed, separados por grupos de ascendencia. Todos los duplicados conocidos se descartaron, pero las muestras relacionadas no se eliminaron, en aras de facilitar la flexibilidad en los an\u00e1lisis comunitarios. <\/span> Para m\u00e1s informaci\u00f3n sobre nuestro proceso de CC, encontrar\u00e1 el flujo de trabajo detallado en nuestra p\u00e1gina asociada de GitHub<\/a><\/strong>.<\/span><\/p>\n

Datos cl\u00ednicos<\/h3>\n

Se armonizaron los datos cl\u00ednicos para crear un conjunto de datos cl\u00ednicos del GP2 unificado. Los requisitos m\u00ednimos de los datos cl\u00ednicos incluyen la informaci\u00f3n demogr\u00e1fica, la categor\u00eda de reclutamiento y los antecedentes familiares. <\/span>Para m\u00e1s informaci\u00f3n sobre los niveles de requisitos de los datos b\u00e1sicos del GP2, v\u00e9ase el documento <\/span>\u00abClinical Data Core Data Set<\/a>\u00bb, en la secci\u00f3n de <\/span>recursos de nuestro sitio web<\/a><\/strong>.<\/span> Se puede acceder a los datos a trav\u00e9s de la plataforma Terra<\/a><\/strong>.\u00a0<\/span> Para instrucciones sobre c\u00f3mo acceder a los datos del GP2, consulte nuestro art\u00edculo de blog \u00ab<\/span>Applying for GP2 Data Access on the AMP\u00ae PD Platform<\/a><\/strong>\u00bb. Los productos de datos siguientes est\u00e1n disponibles en Terra, y forman parte de la primera aportaci\u00f3n del GP2:<\/span><\/p>\n