{"id":50011844,"date":"2021-01-14T19:35:47","date_gmt":"2021-01-15T00:35:47","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/en-que-consisten-los-gwas\/"},"modified":"2024-10-21T15:02:03","modified_gmt":"2024-10-21T19:02:03","slug":"en-que-consisten-los-gwas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/es\/en-que-consisten-los-gwas\/","title":{"rendered":"En qu\u00e9 consisten los GWAS"},"content":{"rendered":"

\u00bfDe qu\u00e9 va eso de la raz\u00f3n de momios? A continuaci\u00f3n presentamos una simplificaci\u00f3n excesiva de los estudios GWAS, acompa\u00f1ada, por qu\u00e9 no, de una dosis de sarcasmo.<\/span><\/p>\n

\u00bfQu\u00e9 nos cuentan los estudios de asociaciones de genoma completo (GWAS, por sus siglas en ingl\u00e9s) acerca de las enfermedades? \u00bfDe qu\u00e9 sirve hacer ensayos con m\u00e1s de un mill\u00f3n de caracter\u00edsticas independientes del genoma y soportar el abuso de la infinidad de ensayos? La respuesta no tiene ning\u00fan secreto: por dos razones muy simples. En primer lugar, cada regi\u00f3n candidata asociada a los genes (tambi\u00e9n conocida como locus<\/i>) nos permite ampliar el alcance de nuestros conocimientos sobre una enfermedad. En segundo lugar, todos esos peque\u00f1os efectos acumulativos que se observan, cada uno de los cuales supone un aumento marginal del riesgo gen\u00e9tico, nos ayudan a predecir mejor el riesgo y a afinar los criterios de diagn\u00f3stico. Se dice que los GWAS no parten de ninguna hip\u00f3tesis, pero en realidad s\u00ed parten de una, a saber: \u00abque una variante o conjunto de variantes del genoma podr\u00eda tener efectos nocivos…. tenemos que investigarlo m\u00e1s a fondo\u00bb.<\/span><\/p>\n

A un nivel muy b\u00e1sico, un GWAS no es m\u00e1s que una serie de ecuaciones, cada una de las cuales examina una variante gen\u00f3mica. Desglosemos esta definici\u00f3n aplic\u00e1ndola a la enfermedad de Parkinson.<\/span><\/p>\n

Enfermedad de Parkinson (1 si s\u00ed, 0 si no) ~ \u03b2<\/span><\/i>0<\/span><\/i> + \u03b2<\/span><\/i>1<\/span><\/i>variante + \u03b2<\/span><\/i>2<\/span><\/i>sexo + \u03b2<\/span><\/i>3<\/span><\/i>edad + \u03b2<\/span><\/i>4<\/span><\/i>PC1 + \u03b2<\/span><\/i>5<\/span><\/i>PC2<\/span><\/i><\/p>\n

Si tiene nociones de estad\u00edstica, habr\u00e1 observado que la f\u00f3rmula est\u00e1ndar de un GWAS corresponde a una simple f\u00f3rmula de regresi\u00f3n m\u00faltiple. Esta ecuaci\u00f3n en particular pone a prueba si podemos predecir si una persona tiene la enfermedad de Parkinson o no a partir de la presencia de una variante espec\u00edfica en el genoma de esa persona. Adem\u00e1s de la variante analizada, incluimos otros factores como el sexo, la edad y los componentes principales que explican la herencia gen\u00e9tica a nivel individual.\u00a0<\/span><\/p>\n

Ahora enfoqu\u00e9monos en la raz\u00f3n de momios y las betas. En la ecuaci\u00f3n anterior, los t\u00e9rminos \u00ab\u03b2<\/span>n<\/span>\u00bb delante de las variables corresponden a coeficientes. Estos nos indican cu\u00e1nto aumenta o disminuye la probabilidad estimada o el \u00abriesgo\u00bb de padecer la enfermedad de Parkinson en funci\u00f3n de la presencia de esa variable. En los manuscritos de los GWAS, estos tama\u00f1os de efecto de las variantes se presentan como valores beta o raz\u00f3n de momios. Veamos un ejemplo para interpretar ambos. En el GWAS sobre EP m\u00e1s reciente y m\u00e1s amplio hasta la fecha (Nalls 2019), una de las nuevas variantes que se ha asociado significativamente a la EP es la variante rs76116224 en el cromosoma 2. El valor beta asociado a esta variante es de 0.110. La raz\u00f3n de momios es de 1.12 (intervalo de confianza: 1.08\u20131.16). El valor beta hace referencia al aumento o disminuci\u00f3n por unidad del resultado. As\u00ed que, en este estudio:<\/span><\/p>\n