{"id":50011873,"date":"2021-03-31T20:23:33","date_gmt":"2021-04-01T00:23:33","guid":{"rendered":"https:\/\/gp2stg.wpenginepowered.com\/gp2-und-amp-pd-plattform-partnerschaft-fuer-den-fortschritt-in-der-parkinson-forschung\/"},"modified":"2024-11-13T22:34:13","modified_gmt":"2024-11-14T03:34:13","slug":"gp2-und-amp-pd-plattform-partnerschaft-fuer-den-fortschritt-in-der-parkinson-forschung","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gp2.org\/de\/gp2-und-amp-pd-plattform-partnerschaft-fuer-den-fortschritt-in-der-parkinson-forschung\/","title":{"rendered":"GP2 und AMP PD: Plattform-Partnerschaft f\u00fcr den Fortschritt in der Parkinson-Forschung"},"content":{"rendered":"

Das Global Parkinson\u2019s Genetics Program (GP2) und Accelerating Medicines Partnership: Parkinson-Krankheit (<\/span> AMP\u00ae PD<\/span><\/a> ) haben sich zusammengeschlossen, um Ihnen als zentrale Anlaufstelle f\u00fcr genetische (GP2) und genomische (AMP PD) Daten zur Parkinson-Krankheit zu dienen und Ihnen die Entdeckung neuer Wirkstofftargets und Biomarker zu erleichtern und so die Entwicklung neuer Medikamente gegen Parkinson zu beschleunigen. Wir setzen kollaboratives Cloud Computing ein, um diese beiden riesigen Datenbanken miteinander zu verbinden.<\/span><\/p>\n

Wir stellen einen einzigen sicheren und unkomplizierten Zugangspunkt zu einer riesigen Datenmenge, die in der Cloud gespeichert ist. Dabei nutzen wir <\/span>Terra<\/span><\/a> als Backbone f\u00fcr die Datenanalyse, Datenspeicherung und Authentifizierung von Forscher*innen. Mit Terra erreicht die Computerarbeit ein neues Niveau. Es bietet kollaborative Arbeitsbereiche mit Cloud-nativen Notebooks und Workflows. Cloud Computing bedeutet, dass Sie die Daten an einem besser gesicherten Ort analysieren k\u00f6nnen und keine zeitaufw\u00e4ndigen und teuren Daten\u00fcbertragungen notwendig sind. Die Verwendung der intuitiven Jupyter-Notebookstruktur bei Terra erm\u00f6glicht eine klare und interaktive Analyse. Sie k\u00f6nnen Ihre Arbeitsbereiche zusammen mit Ihren Ergebnissen ver\u00f6ffentlichen, wodurch eine reproduzierbare und transparente Forschung gew\u00e4hrleistet wird. F\u00fcr die Zukunft geplant ist die Interoperabilit\u00e4t mit Arbeitsbereichen und Plattformen f\u00fcr andere neurodegenerative Erkrankungen, um den Nutzwert der Daten weiter zu optimieren.<\/span><\/p>\n

Warum sollten diese beiden Programme an einem Ort zusammengef\u00fchrt werden? Weil sie sich hervorragend erg\u00e4nzen. Wenn Sie tief in zehntausend Proben mit verschiedenen harmonisierten Multi-Omik-Auswertungen, einschlie\u00dflich RNAseq und genomeSeq, eintauchen m\u00f6chten, dann ist der Datenbestand von AMP\u00a0PD genau das Richtige f\u00fcr Sie. Wenn Sie genetische Assoziationen in vielf\u00e4ltigen Populationen im Biobank-Ma\u00dfstab erforschen m\u00f6chten, so sind Sie bei GP2 an der richtigen Adresse. Sowohl bei GP2 als auch bei AMP\u00a0PD sind auch kuratierte relevante klinische Longitudinaldaten zu den meisten Teilnehmer*innen enthalten. Grunds\u00e4tzlich nutzen wir GP2 als Forschungsdatenbestand f\u00fcr gro\u00df angelegte Analysen (Hypothesenbildung), um dann Entdeckungen m\u00f6glicherweise weiter zu verfeinern und in den vereinheitlichten AMP-PD-Kohorten genauer zu untersuchen.<\/span><\/p>\n

Und das Beste dabei: Mit einem einzigen Zugangspunkt und denselben Formalit\u00e4ten erh\u00e4lt man Zugang zu beiden Datenbest\u00e4nden, mit einer einheitlichen Architektur und ausf\u00fchrlicher Dokumentation, um den Einarbeitungsaufwand gering zu halten. Zur Illustration der Anwendungsf\u00e4lle f\u00fcr GP2- und AMP-PD-Daten haben wir diese \u00dcbersichtsgrafik entwickelt.<\/span><\/p>\n

\"\"<\/p>\n

\u00a0<\/p>\n

Dieser Blog wurde von den folgenden Mitgliedern von GP2 und AMP PD geschrieben:<\/em><\/p>\n

Mike A. Nalls, PhD
\n<\/b><\/em>Data Tecnica International | USA
\n<\/span><\/em>Mike gr\u00fcndete Data Tecnica Anfang 2017, nachdem er \u00fcber ein Jahrzehnt Erfahrung in der Analyse gro\u00dfer Datens\u00e4tze und der Methodenforschung im Gesundheitswesen und anderen wissenschaftlichen Bereichen gesammelt hatte. Er hat \u00fcber 350\u00a0von Experten begutachtete Publikationen (vor dem 40.\u00a0Lebensjahr) auf dem Gebiet der angewandten Statistik bei gro\u00dfen Datenbest\u00e4nden, Gehirnkrankheiten und Genomik auf seinem Konto. Er ist ein gro\u00dfer F\u00fcrsprecher von Open Science, Zusammenarbeit und Transparenz in der Wissenschaft.<\/span><\/em><\/p>\n

Hampton Leonard, MS
\n<\/b><\/em>Data Tecnica International \/ National Institutes of Health | USA
\n<\/span><\/em>Hampton verf\u00fcgt \u00fcber einen Hintergrund in Datenwissenschaft und maschinellem Lernen, den sie auf gro\u00dfe multiomische Datens\u00e4tze im Bereich neurodegenerativer Erkrankungen anwendet. Ihre Leidenschaft gilt der Erforschung von Unterschieden auf klinischer und omischer Ebene und der Frage, wie diese Unterschiede die Ergebnisse klinischer Studien beeinflussen k\u00f6nnen.<\/span><\/em><\/p>\n

Matt Bookman
\n<\/b><\/em>Verily Life Sciences | USA<\/span>
\n<\/span>Matt ist Solutions Architect f\u00fcr das Terra-Team bei Verily. Als Ko-Vorsitzender der AMP PD Data Working Group arbeitete er mit anderen Wissenschaftler*innen daran, genomische und transkriptomische Daten zu verarbeiten und sie qualifizierten Forscher*innen in Terra zur Verf\u00fcgung zu stellen. Matt erwarb seinen BS in angewandter Mathematik an der UCLA und seinen MS in Computerwissenschaften und Computerbiologie an der Stanford University.<\/span><\/em><\/p>\n

Eline Appelmans
\n<\/b><\/em>Stiftung der National Institutes of Health | USA
\n<\/span><\/em>Als Direktor f\u00fcr neurowissenschaftliche Forschungspartnerschaften arbeitet Dr. Appelmans in Abstimmung mit den NIH, gemeinn\u00fctzigen Organisationen, Branchenf\u00fchrern und Projektleitern des FNIH an der Umsetzung der Accelerating Medicines Partnership (AMP) f\u00fcr die Alzheimer-Krankheit (AMP-AD), der AMP f\u00fcr die Parkinson-Krankheit (AMP PD), der AMP f\u00fcr Schizophrenie (AMP-SCZ), des privaten wissenschaftlichen Gremiums der Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative 3 (ADNI3 PPSB) und des Biomarkers Consortium Neuroscience Steering Committee (BC NSC) sowie an anderen in der Entwicklung befindlichen Projekten.<\/span><\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Unser Ziel: durch eine zus\u00e4tzliche Verarbeitungsebene zwei enorme Datenbest\u00e4nde zusammenf\u00fchren. In diesem neuen Blogbeitrag stellen Mike Nalls, Hampton Leonard, Matt Bookman und Eline Appelmans die Partnerschaft zwischen The Global Parkinson\u2019s Genetics Program (GP2) und Accelerating Medicines Partnership: Parkinson’s Disease (AMP\u00a0PD) als Ihrer einzigen Anlaufstelle f\u00fcr Parkinson-bezogene genetische und genomische Daten vor.<\/p>\n","protected":false},"author":16,"featured_media":50010690,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":"","_links_to":"","_links_to_target":""},"class_list":["post-50011873","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","post-type-blog-de","topic-forschungszusammenarbeit-de","topic-gp2-werte-de"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50011873","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/users\/16"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=50011873"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50011873\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/media\/50010690"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/gp2.org\/de\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=50011873"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}