Arbeitsgruppe Complex Disease – Data Analysis (Komplexe Krankheit – Datenanalyse)

Unsere Aufgabe ist die Durchführung von Kernanalysen, um die genetischen Grundlagen von genetisch komplexen Formen der Parkinson-Krankheit zu identifizieren.

Unsere Zielsetzung besteht darin, die Pflege, Demokratisierung und Beschleunigung von Analysen zu unterstützen, die im Zusammenhang mit dem grundlegenden Analyse- und Speicher-Ökosystem, der Datenqualitätskontrolle einschließlich des Scrubbing geschützter Gesundheitsinformationen (PHI), der Imputationsharmonisierung, der regelmäßigen Aktualisierung der Ergebnisse genomweiter Assoziationsstudien (GWAS) und der Datenqualitätskontrolle sowie Vorhersagen durch maschinelles Lernen für alle relevanten Ergebnisse stehen. Wir leisten auch Unterstützung bei der Analyse für Forschende mit genehmigten Projekten.

Arbeitsgruppe
Mike A. Nalls, PhD
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Mike A. Nalls, PhD

Data Tecnica International | USA
Hampton Leonard, MS
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Hampton Leonard, MS

Data Tecnica International/National Institutes of Health | USA
Sara Bandres-Ciga, PharmD, PhD
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Sara Bandres-Ciga, PharmD, PhD

National Institutes of Health | USA
Cornelis Blauwendraat, PhD
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Cornelis Blauwendraat, PhD

National Institutes of Health | USA
Jean-Christophe Corvol, MD, PhD
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Jean-Christophe Corvol, MD, PhD

ICM Institute | Frankreich
Faraz Faghri, PhD
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Faraz Faghri, PhD

Data Tecnica International/National Institutes of Health | USA
Hirotaka Iwaki, MD, PhD
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Hirotaka Iwaki, MD, PhD

Data Technica International/National Institutes of Health | USA
Jeff J. Kim, BA
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Jeff J. Kim, BA

National Institutes of Health | USA
Mathew Koretsky, BSc
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Mathew Koretsky, BSc

National Institutes of Health | USA
Nicole Kuznetsov
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Nicole Kuznetsov

National Institutes of Health | USA
Kristin Levine, MS
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Kristin Levine, MS

Data Tecnica International | USA
Mary B. Makarious, BSc
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Mary B. Makarious, BSc

National Institutes of Health | USA
Ignacio Fernandez Mata, PhD
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Ignacio Fernandez Mata, PhD

Cleveland Clinic | USA
Yeajin Song, MS
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Yeajin Song, MS

Data Tecnica International | USA
Dan Vitale, MS
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Dan Vitale, MS

Data Tecnica International | USA
Nigel Williams, PhD
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Nigel Williams, PhD

Cardiff University | Vereinigtes Königreich
Meilensteine
Bisherige Fortschritte
  • Automatisierte umfassende cloud-basierte Pipeline zur Qualitätskontrolle
  • Gemeinsame GP2-Teilnehmerdaten auf Terra
  • Zusammenarbeit mit anderen Arbeitsgruppen für den Austausch von Code, Ergebnissen und Schulungsmaterialien
Verbleibende Ziele für das Jahr 3
  • Unterstützung bei der Analyse von Projektvorschlägen
  • Verbesserung der Qualität der Datengenerierung und Hinzufügung neuer Datentypen
  • Vollständig quelloffene GP2-GWAS mit durchsuchbaren Überblickstatistiken

Kontakt

Wenn Sie gerne mitwirken möchten, senden Sie bitte eine E-Mail an [email protected], um einen Link zur Seite des Basecamp zu erhalten.